(S) -2-haloatsidli dehalogenaza - (S)-2-haloacid dehalogenase

(S) -2-haloatsidli dehalogenaza
Identifikatorlar
EC raqami3.8.1.2
CAS raqami37289-39-7
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Gen ontologiyasiAmiGO / QuickGO

Yilda enzimologiya, a (S) -2-haloatsidli dehalogenaza (EC 3.8.1.2 ) an ferment bu kataliz qiladi The kimyoviy reaktsiya

(S) -2-haloatsid + H2O (R) -2-gidroksid kislotasi + galogenid

Shunday qilib, ikkalasi substratlar bu fermentlar (S) -2-haloatsid va H2O, ikkinchisi esa mahsulotlar bor (R) -2-gidroksid kislotasi va haloid.

Ushbu ferment. Oilasiga tegishli gidrolazalar, xususan uglerod-galogenid birikmalaridagi halogen bog'lanishlarga ta'sir etuvchi moddalar. The sistematik ism bu fermentlar sinfiga kiradi (S) -2-haloatsidli halidohidrolaza. Umumiy foydalanishdagi boshqa nomlarga quyidagilar kiradi 2-haloatsidli dehalogenaza [noaniq], 2-haloatsidli halidohidrolaza [noaniq] [noaniq], 2-haloalkanoik kislota dehalogenaza, 2-haloalkanoid kislota halidohidrolaza, 2-halokarboksilik kislota dehalogenaza II, DL-2-haloatsidli dehalogenaza [noaniq], L-2-haloatsidli dehalogenazava L-DEX. Ushbu ferment ishtirok etadi gamma-geksaxlorosikloheksan degradatsiyasi va 1,2-dikloretanning parchalanishi.

Strukturaviy tadqiqotlar

2007 yil oxiriga kelib, 10 tuzilmalar bilan fermentlarning ushbu klassi uchun hal qilingan PDB qo'shilish kodlari 1AQ6, 1JUD, 1QH9, 1-chorak, 1-chorak, 1-chorak, 1ZRM, 1ZRN, 2NO4 va 2NO5.

Adabiyotlar

  • Goldman P, Milne GW, Keister DB (1968). "Uglerod-halogen bog'lanishini ajratish. 3. Bakterial halidohrolazalar bo'yicha tadqiqotlar". J. Biol. Kimyoviy. 243 (2): 428–34. PMID  5635785.
  • Motosugi M, Esaki N, Soda K (1982). "Pseudomonas putida dan 2-halo kislotali dehalogenazning olinishi va xususiyatlari". Agric. Biol. Kimyoviy. 46 (3): 837–838. doi:10.1271 / bbb1961.46.837.
  • Klages U, Krauss S, Lingens F (1983). "4-xlorobenzoatni parchalaydigan Pseudomonas spetsifikatsiyasidan 2-haloatsidli dehalogenaza. CBS 3". Hoppe-Seylerning Z. Fiziol. Kimyoviy. 364 (5): 529–35. doi:10.1515 / bchm2.1983.364.1.529. PMID  6873881.
  • Diez A, Prieto MI, Alvares MJ, Bautista JM, Garrido J, Puyet A (1996). "Azotobacter sp. Dan ionlar almashinadigan immobilizatsiya orqali 2-haloatsidli dehalogenenazaning katalitik ko'rsatkichi yaxshilandi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 220 (3): 828–33. doi:10.1006 / bbrc.1996.0489. PMID  8607850.
  • Morsberger FM, Myuller R, Otto MK, Lingens F, Kulbe KD (1991). "Pseudomonas spec. 2-halokarboksilik kislota dehalogenaz II ning tozalanishi va tavsifi. CBS 3". Biol. Kimyoviy. Xop-Seyler. 372 (10): 915–22. doi:10.1515 / bchm3.1991.372.2.915. PMID  1772590.
  • Kohler R, Brokamp A, Schwarze R, Reiting RH, Shmidt FR (1998). "Agrobacterium tumefaciens RS5 dan kriptik haloalkanoik kislota dehalogenazning xususiyatlari va DNK-ketma-ketligi". Curr. Mikrobiol. 36 (2): 96–101. doi:10.1007 / s002849900286. PMID  9425247. S2CID  12691244.
  • Motosugi K, Esaki N, Soda K (1982). "D- va L-2-xloropropionatlarning bakterial assimilyatsiyasi va yangi dealogenaza paydo bo'lishi". Arch. Mikrobiol. 131 (3): 179–83. doi:10.1007 / BF00405875. PMID  7103659. S2CID  35346002.
  • Kurihara T, Esaki N, Soda K (2000). "Bakterial 2-haloatsidli dehalogenazalar: tuzilmalar va reaktsiya mexanizmlari". J. Mol. Katal., B fermenti. 10 (1–3): 57–65. doi:10.1016 / S1381-1177 (00) 00108-9.
  • M, Tsunasava S; Esaki N (1996). "Bakterial 2-haloatsidli dehalogenazalar: tuzilmalari va katalitik xususiyatlari". Sof Appl. Kimyoviy. 68 (11): 2097–2103. doi:10.1351 / pac199668112097. S2CID  38522855.