BOP1 - BOP1

Mavjud oqsil tuzilmalari:
Pfam	tuzilmalar / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	tuzilish xulosasi

BOP1NT
Identifikatorlar
Belgilar	BOP1NT
Pfam	PF08145
InterPro	IPR012953
Mavjud oqsil tuzilmalari:
Pfam	tuzilmalar / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	tuzilish xulosasi

BOP1
Identifikatorlar
Taxalluslar	BOP1, ko'payish bloki 1, BOP1 ribosomal biogenez omil
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 610596 MGI: 1334460 HomoloGene: 6612 Generkartalar: BOP1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	144,291,438 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 15 (sichqoncha)
Oxiri	76,477,277 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• ribonukleoprotein kompleksi bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• nukleus; • hujayra yadrosi; • PeBoW kompleksi; • nukleoplazma; • preribozoma, katta subbirlik kashshofi; • ribonukleoprotein;
Biologik jarayon	• ribosomal katta subbirlik biogenezi; • tricistronic rRNA transkriptining 5.8S rRNA va LSU-rRNA o'rtasida ITS2 da bo'linish (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • uyali proliferatsiya; • ribosoma biogenezi; • hujayra aylanishini tartibga solish; • rRNKni qayta ishlash; • trisistronik rRNK transkriptidan LSU-rRNK ning pishishi (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • ribosomal katta subbirlik assambleyasi; • p53 sinf mediatori tomonidan signal uzatilishini tartibga solish; • tricistronic rRNA transkriptidan 5.8S rRNK ning pishishi (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA);
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	23246
	12181
	ENSG00000261236; ENSG00000285301
	ENSMUSG00000022557
	14147
	P97452
	NM_015201
	NM_013481
	NP_056016
	NP_038509
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Ribozoma biogenez oqsili BOP1 a oqsil odamlarda kodlanganligi BOP1 gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Bu WD40 takrorlanadi - tarkibida nukleolyar rRNKni qayta ishlashda ishtirok etadigan protein va shu bilan ularni boshqaradi hujayra tsikl^[7] Bu 25S va 5.8S ning pishishi uchun talab qilinadi ribosomal RNKlar. Bu muhim omil bo'lib xizmat qilishi mumkin ribosoma pre-RRNK da spacer mintaqalarini qayta ishlashni muvofiqlashtiradigan shakllanish. Pes1-Bop1 murakkab bir nechta tarkibiy qismlarga ega: BOP1, GRWD1, PES1, ORC6L va RPL3 va ribosomada ishtirok etadi biogenez va o'zgartirilgan xromosomalarning ajratilishi. BOP1 ning haddan tashqari ifodalanishi foizni oshiradi ko'p qutbli millar yilda inson hujayralari. BOP1 yo'lini tartibga solish kolorektal tumourigenezga sabab bo'lishi mumkin odamlar.^[8] Bop1 darajasining ko'tarilishi Bop1 / WDR12 va Bop1 / Pes1 subkomplekslarini keltirib chiqaradi va PeBoW kompleksining yig'ilishi va yaxlitligi Bop1 oqsil darajasidagi o'zgarishlarga juda sezgir.^[9]

Nop7p-Erb1p -Ytm1p, xamirturush tarkibida bo'lishi mumkin gomologik Pes1-Bop1-WDR12 kompleksi, chunki u ribosoma biogenezini boshqarishda ishtirok etadi S bosqichi kirish. PeBoW kompleksining yaxlitligi ribosoma biogenezi va hujayralar ko'payishi uchun talab qilinadi sutemizuvchi hujayralar.^[10] Giardiyada turlari aniq sitoskelet oqsil, beta-giardin, o'zaro ta'sir qiladi Bop1 bilan.^[7]

Tuzilishi

BOP1 konservalanganni o'z ichiga oladi N-terminal domen, BOP1NT.

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000022557 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikava K, Nomura N (Mar 1996). "Odamning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. IV. KG-1 hujayra chizig'idan cDNA klonlarini tahlil qilish natijasida chiqarilgan 40 ta yangi genning (KIAA0121-KIAA0160) kodlash ketma-ketliklari". DNK rez. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
^ "Entrez Gen: BOP1 tarqalish bloki 1".
^ ^a ^b Kim J, Goo SY, Chung HJ, Yang HW, Yong TS, Lee KH, Park SJ (2006 yil yanvar). "Giardia lamblia tarkibidagi beta-giardinning Bop1 oqsil bilan o'zaro ta'siri". Parazitol. Res. 98 (2): 138–44. doi:10.1007 / s00436-005-0040-8. PMID 16362343. S2CID 24519868.
^ Killian A, Sarafan-Vasseur N, Sesboéé R, Le Pessot F, Blanchard F, Lamy A, Loran M, Flaman JM, Frébourg T (sentyabr 2006). "8q24 da joylashgan BOP1 genining kolorektal shish paydo bo'lishiga qo'shgan hissasi". Genlarning xromosomalari saratoni. 45 (9): 874–81. doi:10.1002 / gcc.20351. PMID 16804918. S2CID 38299400.
^ Rohrmoser M, Xölzel M, Grimm T, Malamoussi A, Xarasim T, Orban M, Pfister I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eik D (may 2007). "Pes1, Bop1 va WDR12 ning o'zaro bog'liqligi nukleolyar lokalizatsiyasini va 60S ribosomal subunitining pishishi uchun zarur bo'lgan PeBoW kompleksini yig'ilishini nazorat qiladi". Mol. Hujayra. Biol. 27 (10): 3682–94. doi:10.1128 / MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID 17353269.
^ Xölzel M, Rohrmoser M, Shli M, Grimm T, Xarasim T, Malamoussi A, Gruber-Eber A, Kremmer E, Xiddemann V, Bornkamm GW, Eik D (avgust 2005). "Sutemizuvchilar WDR12 Pes1-Bop1 kompleksining yangi a'zosi bo'lib, ribosoma biogenezi va hujayralarni ko'payishi uchun zarurdir". J. Hujayra Biol. 170 (3): 367–78. doi:10.1083 / jcb.200501141. PMC 2171466. PMID 16043514.

Tashqi havolalar

Inson BOP1 genom joylashuvi va BOP1 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.

Qo'shimcha o'qish

Chjan Y, Koushik S, Dai R, Mivechi NF (1999). "Murin issiqlik shok transkripsiyasi omil-1 genini tarkibiy tashkil etish va targ'ibotchi tahlili". J. Biol. Kimyoviy. 273 (49): 32514–21. doi:10.1074 / jbc.273.49.32514. PMID 9829985.
Nakatsura T, Senju S, Yamada K, Jotsuka T, Ogawa M, Nishimura Y (2001). "Pankreatik saraton kasalligida ortiqcha ta'sirlangan immunogen antigenlarning gen klonlashi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 281 (4): 936–44. doi:10.1006 / bbrc.2001.4377. PMID 11237751.
Pestov DG, Strezoska Z, Lau LF (2001). "Ribosoma biogenezi va hujayra tsikli o'rtasidagi p53 ga bog'liq bo'lgan o'zaro suhbatning dalillari: Bop1 yadroli oqsilining G (1) / S o'tishiga ta'siri". Mol. Hujayra. Biol. 21 (13): 4246–55. doi:10.1128 / MCB.21.13.4246-4255.2001. PMC 87085. PMID 11390653.
Pestov DG, Stokelman MG, Strezoska Z, Lau LF (2001). "ERB1, sutemizuvchilar Bop1 ning xamirturush homologi, 25S va 5.8S ribosomal RNKlarning pishishi uchun zarur bo'lgan gen". Nuklein kislotalari rez. 29 (17): 3621–30. doi:10.1093 / nar / 29.17.3621. PMC 55883. PMID 11522832.
Andersen JS, Lion Idoralar, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Sten H, Mann M, Lamond AI (2002). "Inson yadrosi yo'naltirilgan proteomik tahlil". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Strezoska Z, Pestov DG, Lau LF (2002). "Bop1 sichqoncha nukleolyar oqsilining funktsional inaktivatsiyasi pre-rRNKni qayta ishlashda bir necha bosqichlarni inhibe qiladi va hujayra tsiklining rivojlanishini bloklaydi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (33): 29617–25. doi:10.1074 / jbc.M204381200. PMID 12048210.
Scherl A, Couté Y, Deon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanches JC, Greko A, Hochstrasser D, Diaz JJ (2003). "Odam yadrosini funktsional proteomik tahlil qilish". Mol. Biol. Hujayra. 13 (11): 4100–9. doi:10.1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Lapik YR, Fernandes CJ, Lau LF, Pestov DG (2004). "Sutemizuvchilar ribosomalari biogenezida Pes1 va Bop1 o'rtasidagi fizikaviy va funktsional o'zaro ta'sir". Mol. Hujayra. 15 (1): 17–29. doi:10.1016 / j.molcel.2004.05.020. PMID 15225545.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lion Idoralar, Diamond AI, Mann M (2005). "Nukleolyar proteom dinamikasi". Tabiat. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). "Odam mitoz milining fosfoproteomik tahlili". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). "Yuqori oqsilli fosforillanish tahlili va joyni lokalizatsiya qilish uchun ehtimollikka asoslangan yondashuv". Nat. Biotexnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen QK, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Signalizatsiya tarmoqlarida global, in vivo jonli va saytga xos fosforillanish dinamikasi". Hujayra. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Teylor P, Klimi S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Konnor L, Li M, Teylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Chjan S, Ornatskiy O, Buxman YV, Etier M, Sheng Y, Vasilesku J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duelel HS, Styuart II, Kuehl B, Xogue K, Kolvill K, Gladvish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR012953

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 8 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000022557 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8590280-5] Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikava K, Nomura N (Mar 1996). "Odamning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. IV. KG-1 hujayra chizig'idan cDNA klonlarini tahlil qilish natijasida chiqarilgan 40 ta yangi genning (KIAA0121-KIAA0160) kodlash ketma-ketliklari". DNK rez. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.

[entrez-6] "Entrez Gen: BOP1 tarqalish bloki 1".

[pmid16362343-7] Kim J, Goo SY, Chung HJ, Yang HW, Yong TS, Lee KH, Park SJ (2006 yil yanvar). "Giardia lamblia tarkibidagi beta-giardinning Bop1 oqsil bilan o'zaro ta'siri". Parazitol. Res. 98 (2): 138–44. doi:10.1007 / s00436-005-0040-8. PMID 16362343. S2CID 24519868.

[pmid16804918-8] Killian A, Sarafan-Vasseur N, Sesboéé R, Le Pessot F, Blanchard F, Lamy A, Loran M, Flaman JM, Frébourg T (sentyabr 2006). "8q24 da joylashgan BOP1 genining kolorektal shish paydo bo'lishiga qo'shgan hissasi". Genlarning xromosomalari saratoni. 45 (9): 874–81. doi:10.1002 / gcc.20351. PMID 16804918. S2CID 38299400.

[pmid17353269-9] Rohrmoser M, Xölzel M, Grimm T, Malamoussi A, Xarasim T, Orban M, Pfister I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eik D (may 2007). "Pes1, Bop1 va WDR12 ning o'zaro bog'liqligi nukleolyar lokalizatsiyasini va 60S ribosomal subunitining pishishi uchun zarur bo'lgan PeBoW kompleksini yig'ilishini nazorat qiladi". Mol. Hujayra. Biol. 27 (10): 3682–94. doi:10.1128 / MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID 17353269.

[pmid16043514-10] Xölzel M, Rohrmoser M, Shli M, Grimm T, Xarasim T, Malamoussi A, Gruber-Eber A, Kremmer E, Xiddemann V, Bornkamm GW, Eik D (avgust 2005). "Sutemizuvchilar WDR12 Pes1-Bop1 kompleksining yangi a'zosi bo'lib, ribosoma biogenezi va hujayralarni ko'payishi uchun zarurdir". J. Hujayra Biol. 170 (3): 367–78. doi:10.1083 / jcb.200501141. PMC 2171466. PMID 16043514.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]