CSNK2B - CSNK2B

CSNK2B
Protein CSNK2B PDB 1jwh.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarCSNK2B, CK2B, CK2N, CSK2B, G5A, kazein kinaz 2 beta, Ckb2, Ckb1, POBINDS
Tashqi identifikatorlarOMIM: 115441 MGI: 88548 HomoloGene: 55572 Generkartalar: CSNK2B
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 6 (odam)
Chr.Xromosoma 6 (odam)[1]
Xromosoma 6 (odam)
Genomic location for CSNK2B
Genomic location for CSNK2B
Band6p21.33Boshlang31,665,236 bp[1]
Oxiri31,670,343 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE CSNK2B 201390 s at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001320
NM_001282385

NM_009975
NM_001303445
NM_001303446
NM_001303476

RefSeq (oqsil)

NP_001269314
NP_001311

NP_001290374
NP_001290375
NP_001290405
NP_034105

Joylashuv (UCSC)Chr 6: 31.67 - 31.67 MbChr 17: 35.12 - 35.12 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash
Kasein kinaz II regulyativ subbirligi
PDB 1rqf EBI.jpg
p21waf1 peptidi ishtirokida kristallangan ck2 beta subunitining tuzilishi
Identifikatorlar
BelgilarCK_II_beta
PfamPF01214
InterProIPR000704
PROSITEPDOC00845
SCOP21qf8 / QOIDA / SUPFAM

Kasein kinaz II subunit beta-versiyasi a oqsil odamlarda kodlanganligi CSNK2B gen.[5][6]

Ushbu gen metabolik yo'llarni, signal o'tkazuvchanligini, transkripsiyasini, tarjimasini va replikatsiyasini boshqaradigan hamma joyda mavjud bo'lgan protein kinaz - kazein kinaz II ning beta birligini kodlaydi. Ferment endoplazmatik retikulum va Golji apparatiga joylashadi.[7]

Kazein kinaz, hamma joyda yaxshi saqlanib qolgan protein kinaz da ishtirok etish hujayra metabolizm va farqlash, afzalligi bilan tavsiflanadi Serin yoki Treonin ning kislotali cho'zilishlarida aminokislotalar. Ferment a tetramer 2 alfa- va 2 beta-birlikdan.[8][9] Biroq, ba'zilari turlari (masalan, sutemizuvchi hayvonlar) alfa-subunitning (alfa va alfa ') tegishli 2 shakliga ega, boshqalari (masalan, zamburug'lar) 2 ta o'xshash beta-birliklarga (beta va beta') ega.[10] Alfa-subbirlik bu katalitik serin / treonin protein kinazalariga xos bo'lgan mintaqalarni o'z ichiga oladi. Beta-bo'linma tartibga soluvchi, N-terminalli avto-fosforillanish joyiga, ichki kislotali domenga va potentsial metall bilan bog'lanishiga ega deb ishoniladi. motif.[10] Beta subunit a juda konservalangan uning markaziy qismida sisteinga boy motif bo'lgan CX (n) C ni o'z ichiga olgan taxminan 25kDa oqsil majburiy kabi metall rux.[11] The sutemizuvchi beta-bo'linma gen targ'ibotchi umumiy xususiyatlarni boshqalari bilan bo'lishadi sutemizuvchi oqsil kinazlari va ular bilan chambarchas bog'liq targ'ibotchi cAMP-ga bog'liq protein kinazining regulyativ birligining.[10]

O'zaro aloqalar

CSNK2B ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan CD163,[12] CSNK2A2,[13][14][15][16] Kazein kinaz 2, alfa 1,[14][15][16][17][18] FGF1,[19] TRIB3,[20] CDC34,[21] Ribozomal oqsil L5,[13][17][22][23] BTF3,[24] BRCA1,[25] RNF7,[17] P70-S6 kinazasi 1[26] va APC.[27]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v ENSG00000204435, ENSG00000232960, ENSG00000206406, ENSG00000224774, ENSG00000230700, ENSG00000224398 GRCh38: Ensembl chiqishi 89: ENSG00000228875, ENSG00000204435, ENSG00000232400, ENGG00000232400, ENGG00000232400, ENGG00000232400, ENGG00000232400, - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024387 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Yang-Feng TL, Teitz T, Cheung MC, Kan YW, Kanaani D (1991 yil mart). "Inson kazein kinaz II beta-subunit genini 6p12 ---- p21 ga tayinlash". Genomika. 8 (4): 741–2. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90266-V. PMID  2276748.
  6. ^ Mucher G, Becker J, Knapp M, Buttner R, Moser M, Rudnik-Schonborn S, Somlo S, Germino G, Onuchic L, Avner E, Guay-Woodford L, Zerres K (Aprel 1998). "6p21.1-p12 da autosomal retsessiv buyrak kasalligi lokusini (PKHD1) va MUT, RDS, CSNK2 beta va GSTA1 genlarini aniq xaritalash". Genomika. 48 (1): 40–5. doi:10.1006 / geno.1997.5145. PMID  9503014.
  7. ^ "Entrez Gen: CSNK2B kazein kinaz 2, beta polipeptid".
  8. ^ Jakobi R, Voss H, Pyerin V (iyul 1989). "Inson fosvitin / kazein kinaz turi II. Molekulyar klonlash va subunit beta-ni kodlovchi to'liq uzunlikdagi cDNA ning ketma-ketligi". Yevro. J. Biokimyo. 183 (1): 227–33. doi:10.1111 / j.1432-1033.1989.tb14917.x. PMID  2666134.
  9. ^ Voss H, Virkner U, Jakobi R, Xevitt NA, Shvager S, Zimmermann J, Ansorge V, Pyerin V (iyul 1991). "Inson kazein kinaz II subunit beta-ni kodlovchi genning tuzilishi". J. Biol. Kimyoviy. 266 (21): 13706–11. PMID  1856204.
  10. ^ a b v Bidvay AP, Reed JC, Glover CV (1995 yil may). "CKB1 ning klonlash va buzilishi, Saccharomyces cerevisiae casein kinase II (CKII) ning 38-kDa beta kichik birligini kodlovchi gen. CKII regulyativ bo'linmalarini yo'q qilish tuzga sezgir fenotipni keltirib chiqaradi". J. Biol. Kimyoviy. 270 (18): 10395–404. doi:10.1074 / jbc.270.18.10395. PMID  7737972.
  11. ^ Reed JC, Bidwai AP, Glover CV (1994 yil iyul). "Saccharomyces cerevisiae casein kinase II ning 32-kDa regulyativ beta-subbirligini kodlovchi gen - CKB2 ning klonlanishi va buzilishi". J. Biol. Kimyoviy. 269 (27): 18192–200. PMID  8027080.
  12. ^ Ritter, M; Buechler C; Kapinskiy M; Shmitz G (2001 yil aprel). "CD163 ning kazein kinaz II (CKII) regulyativ birligi bilan o'zaro ta'siri va CD163 signalizatsiyasining CKII va protein kinaz C ga bog'liqligi". Yevro. J. Immunol. Germaniya. 31 (4): 999–1009. doi:10.1002 / 1521-4141 (200104) 31: 4 <999 :: AID-IMMU999> 3.0.CO; 2-R. ISSN  0014-2980. PMID  11298324.
  13. ^ a b Lexner, Ben; Semple Jennifer I; Jigarrang Stefani E; Counsell Damian; Kempbell R Dunkan; Sanderson Kristofer M (2004 yil yanvar). "Yuqori darajadagi xamirturushli ikki gibrid tizimni tahlil qilish va undan odamning MHC III klass mintaqasida kodlangan hujayra ichidagi oqsillarning ishlashini bashorat qilishda foydalanish". Genomika. Qo'shma Shtatlar. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. ISSN  0888-7543. PMID  14667819.
  14. ^ a b Kim, M S; Li Y T; Kim JM; Cha J Y; Bae Y S (1998 yil fevral). "In vivo va in vitro CKII oqsil kinazasi subbirliklari o'rtasida oqsillarning o'zaro ta'sirini tavsiflash". Mol. Hujayralar. KOREYA. 8 (1): 43–8. ISSN  1016-8478. PMID  9571630.
  15. ^ a b Marin, O; Meggio F; Sarno S; Pinna L A (iyun 1997). "Protein kinaz CK2 beta-subunitining regulyatsion xususiyatlari va subbunitlararo o'zaro ta'siri uchun javobgar bo'lgan strukturaviy elementlarni fizik ravishda ajratish". Biokimyo. QO'SHMA SHTATLAR. 36 (23): 7192–8. doi:10.1021 / bi962885q. ISSN  0006-2960. PMID  9188720.
  16. ^ a b Bosc, D G; Grem K C; Saulnier R B; Chjan S; Prober D; Gietz R D; Litchfild D V (2000 yil may). "CKIP-1, CK2 oqsil kinazasi bilan o'zaro ta'sir qiluvchi yangi pleckstrin homologiyasi domenini o'z ichiga olgan oqsilni aniqlash va tavsifi". J. Biol. Kimyoviy. QO'SHMA SHTATLAR. 275 (19): 14295–306. doi:10.1074 / jbc.275.19.14295. ISSN  0021-9258. PMID  10799509.
  17. ^ a b v Ahn, B H; Kim T H; Bae Y S (2001 yil oktyabr). "Protein kinaz CKII beta subbirligining maqsadli oqsillar bilan o'zaro ta'sir doirasini xaritalash". Mol. Hujayralar. Koreya (Janubiy). 12 (2): 158–63. ISSN  1016-8478. PMID  11710515.
  18. ^ Kusk, M; Ahmed R; Tomsen B; Bendixen C; Issinger O G; Boldyreff B (1999 yil yanvar). "Holoenzim tarkibidagi oqsil kinaz CK2beta subbirligining va boshqa oqsillarning o'zaro ta'siri". Mol. Hujayra. Biokimyo. HOLLANDIYA. 191 (1–2): 51–8. doi:10.1023 / A: 1006840613986. ISSN  0300-8177. PMID  10094392. S2CID  257329.
  19. ^ Skjerpen, Kamilla Skiple; Nilsen Trin; Wesche Yorgen; Olsnes Sjur (2002 yil avgust). "FGF-1 variantlarining protein kinaz CK2 bilan bog'lanishi mitogenlik bilan o'zaro bog'liq". EMBO J. Angliya. 21 (15): 4058–69. doi:10.1093 / emboj / cdf402. ISSN  0261-4189. PMC  126148. PMID  12145206.
  20. ^ Chjou, Ying; Li Lu; Lyu Qiongming; Sin Guychun; Kuai Xuezhang; Sun Jing; Yin Xiushan; Van Tszyan; Chjan Lingqiang; U Fuchu (2008 yil may). "E3 ubikuitin ligase SIAH1 TRB3 ning hamma joyda tarqalishi va parchalanishiga vositachilik qiladi". Hujayra. Signal. Angliya. 20 (5): 942–8. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. ISSN  0898-6568. PMID  18276110.
  21. ^ Blok, K; Boyer T G; Yew P R (2001 yil noyabr). "Odamning kvitin-konjugatsiya qiluvchi fermenti CDC34 ning fosforillanishi, kazein kinaz 2 bilan". J. Biol. Kimyoviy. Qo'shma Shtatlar. 276 (44): 41049–58. doi:10.1074 / jbc.M106453200. ISSN  0021-9258. PMID  11546811.
  22. ^ Boldyreff, B; Issinger O G (1997 yil fevral). "A-Raf kinaz - bu protein kinaz CK2 beta subunitining yangi o'zaro ta'sir qiluvchi sherigi". FEBS Lett. HOLLANDIYA. 403 (2): 197–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00010-0. ISSN  0014-5793. PMID  9042965. S2CID  84557809.
  23. ^ Kim, JM; Cha J Y; Marshak D R; Bae Y S (1996 yil sentyabr). "Kasein kinaz II beta subbirligining ribosomal oqsil L5 bilan o'zaro ta'siri". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. QO'SHMA SHTATLAR. 226 (1): 180–6. doi:10.1006 / bbrc.1996.1330. ISSN  0006-291X. PMID  8806611.
  24. ^ Grein, S; Pyerin V (1999 yil yanvar). "BTF3 - bu protein kinaz CK2 ning potentsial yangi substratidir". Mol. Hujayra. Biokimyo. HOLLANDIYA. 191 (1–2): 121–8. doi:10.1023 / A: 1006806226764. ISSN  0300-8177. PMID  10094400. S2CID  1057554.
  25. ^ O'Brayen, K A; Lemke S J; Cocke K S; Rao R N; Beckmann R P (1999 yil iyul). "Kazein kinaz 2 BRCA1 bilan bog'lanadi va fosforillaydi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. QO'SHMA SHTATLAR. 260 (3): 658–64. doi:10.1006 / bbrc.1999.0892. ISSN  0006-291X. PMID  10403822.
  26. ^ Panasyuk, Ganna; Nemazanyy Ivan; Jivoloup Aleksandr; Bretner Mariya; Litchfild Devid V; Filonenko Valeriy; Gut Ivan T (2006 yil oktyabr). "S6K1 II ning yadro eksporti Ser-17 da protein kinaz CK2 fosforillanishi bilan tartibga solinadi". J. Biol. Kimyoviy. Qo'shma Shtatlar. 281 (42): 31188–201. doi:10.1074 / jbc.M602618200. ISSN  0021-9258. PMID  16895915.
  27. ^ Xomma, Miwako Kato; Li Dongxia; Krebs Edvin G; Yuasa Yasuxito; Xomma Yoshimi (2002 yil aprel). "Adenomatöz polipoz koli oqsili bilan kazein kinaz 2 faolligini birlashtirish va tartibga solish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. Qo'shma Shtatlar. 99 (9): 5959–64. Bibcode:2002 PNAS ... 99.5959K. doi:10.1073 / pnas.092143199. ISSN  0027-8424. PMC  122884. PMID  11972058.

Tashqi havolalar

  • Inson CSNK2B genom joylashuvi va CSNK2B gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.
  • PDBe-KB PDB-da mavjud bo'lgan odamning kazein kinaz II subunit beta (CSNK2B) uchun mavjud bo'lgan barcha tuzilish ma'lumotlari haqida umumiy ma'lumot beradi.

Qo'shimcha o'qish

Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR000704