Chi sayt - Chi site

A Chi sayt yoki Chi ketma-ketligi ning qisqa qismi DNK ichida genom a bakteriya yaqinida gomologik rekombinatsiya genom bo'yicha o'rtacha ko'rsatkichga qaraganda ko'proq sodir bo'ladi. Chi joylari DNKning stimulyatori bo'lib xizmat qiladi ikki qatorli tanaffusni ta'mirlash paydo bo'lishi mumkin bo'lgan bakteriyalarda nurlanish yoki kimyoviy muolajalar, yoki natijada replikatsiya vilkasi davomida sinish DNKning replikatsiyasi. The ketma-ketlik Chi joyi har bir yaqin organizmlar guruhiga xosdir; yilda E. coli va boshqa ichak bakteriyalari, masalan, Salmonella, yadro ketma-ketligi 5' -GCTGGTGG-3' ortiqcha yadro ketma-ketligining 3 'tomoniga taxminan 4 dan 7 gacha bo'lgan nukleotidlar. Chi joylarining mavjudligi dastlab genomida topilgan bakteriofag lambda, a virus yuqtiradi E. coli, lekin hozirda taxminan 1000 marta sodir bo'lishi ma'lum E. coli genom.

Chi ketma-ketligi signal uchun xizmat qiladi RecBCD helikaz-nukleaz bu ferment faolligidagi katta o'zgarishlarni keltirib chiqaradi. Chi ketma-ketligiga duch kelganda, DNKni echishda RecBCD DNKni yuqorida qayd etilgan muhim ketma-ketliklar ichida bir nechta nukleotidlarni Chi ning 3 tomoniga kesib tashlaydi; reaksiya sharoitiga qarab, bu kesma yoki 3'-uchli ipda oddiy nik yoki 3'-uchli ipni kesishdan 5'-sonli ipni kesishga nukleaza faolligining o'zgarishi. Ikkala holatda ham hosil bo'lgan 3 'bitta zanjirli DNK (ssDNA) ning ko'p molekulalari bilan bog'langan RecA gomologik ikki zanjirli DNKning bir zanjiri RecA bilan bog'langan ssDNA tomonidan siljigan "zo'ravonlik invaziyasini" engillashtiradigan oqsil. Strand bosqini D-loop deb ataladigan qo'shma DNK molekulasini hosil qiladi. D-tsiklning rezolyutsiyasi Chi-da hosil bo'lgan 3 'uchi (D-tsiklda) tomonidan replikatsiya bilan sodir bo'ladi deb o'ylashadi. Shu bilan bir qatorda, D-tsikl a ga aylantirilishi mumkin Holliday aloqasi D-tsiklni kesish va DNK zanjirlarining ikkinchi almashinuvi bilan; Holliday birikmasini kesish va natijada paydo bo'lgan niklarni bog'lash orqali Holliday birikmasi chiziqli dupleks DNKga aylanishi mumkin. Ikkala o'zaro ta'sir qiluvchi DNKlar genetik jihatdan bir-biridan farq qiladigan bo'lsa, shuningdek har qanday rezolyutsiya turi rekombinant DNK molekulalarini hosil qilishi mumkin, shuningdek dastlab buzilgan DNKni tiklaydi.

Chi joylari ba'zan "rekombinatsiyali issiq joylar" deb nomlanadi. "Chi" nomi - ning qisqartmasi vrossover hotspot mennstigator. Ga nisbatan E. coli phage lambda, bu atama ba'zida yunoncha harfdan foydalanib "χ sayt" deb yoziladi chi; uchun E. coli va boshqa bakteriyalarga "Chi" atamasi to'g'ri keladi.

Adabiyotlar

  • Amundsen SK, Sharp JW, Smit GR (2016) RecBCD fermenti "Chi Recognition" mutantlari Chi rekombinatsiyasining nuqtalarini to'g'ri DNK kontekstida taniydi. Genetika 204 (1): 139-52. PMID  27401752
  • Teylor AF, Amundsen SK, Smit GR (2016) Kutilmagan DNKning kontekstga bog'liqligi Chi rekombinatsiya nuqtalarining yangi determinantini aniqlaydi. Nuklein kislotalari rez. 44 (17): 8216-28. PMID  27330137
  • Smit GR. (2012). RecBCD fermenti va Chi qanday qilib DNK sinishini tiklash va rekombinatsiyani targ'ib qiladi: molekulyar biologning fikri. Microbiol Mol Biol Rev. 76(2): 217-28. PMID  22688812
  • Dillingham MS, Kovalchykowski SC. (2008). RecBCD fermenti va ikki zanjirli DNK parchalarini tiklash. Microbiol Mol Biol Rev. 72(4): 642-671. PMID  19052323
  • Amundsen SK, Teylor AF, Reddi M, Smit GR. (2007). Chi issiq joylari tomonidan boshqariladigan murakkab oqsil mashinasi RecBCD fermentidagi interubunit signalizatsiyasi. Genlar Dev 21(24): 3296-3307. PMID  18079176
  • Stahl FW. (2005). Chi: Kichkina ketma-ketlik katta fermentni boshqaradi. Genetika 170(2): 487–493. PMID  15980270

Tashqi havolalar