EHMT2 - EHMT2

EHMT2
Protein EHMT2 PDB 2o8j.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarEHMT2, BAT8, C6orf30, G9A, GAT8, KMT1C, NG36, eukromatik giston lizin metiltransferaza 2
Tashqi identifikatorlarOMIM: 604599 MGI: 2148922 HomoloGene: 48460 Generkartalar: EHMT2
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 6 (odam)
Chr.Xromosoma 6 (odam)[1]
Xromosoma 6 (odam)
EHMT2 uchun genomik joylashuv
EHMT2 uchun genomik joylashuv
Band6p21.33Boshlang31,879,759 bp[1]
Oxiri31,897,687 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE EHMT2 202326 da fs.png

Fs.png da PBB GE EHMT2 207484 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001289413
NM_006709
NM_025256
NM_001318833
NM_001363689

NM_001286573
NM_001286575
NM_145830
NM_147151

RefSeq (oqsil)

NP_001276342
NP_001305762
NP_006700
NP_079532
NP_001350618

NP_001273502
NP_001273504
NP_665829
NP_671493

Joylashuv (UCSC)Chr 6: 31.88 - 31.9 MbChr 17: 34.9 - 34.91 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Euxromatik giston-lizin N-metiltransferaza 2 (EHMT2), shuningdek, nomi bilan tanilgan G9a, a giston metiltransferaza ferment odamlarda kodlanganligi EHMT2 gen.[5][6][7] G9a ning mono- va di-metillangan holatlarini katalizlaydi histon H3 da lizin qoldiq 9 (ya'ni, H3K9me1 va H3K9me2 ) va lizin qoldig'i 27 (H3K27me1 va HeK27me2 ).[8][9]

Funktsiya

TNF alfa va TNF beta-genlari genlari atrofida BAT1-BAT5 genlar klasteri joylashtirilgan. Ushbu gen ushbu klaster yaqinida joylashgan; u HSP70 gen juftligini o'z ichiga olgan 120 kb mintaqada C2 geni yaqinida xaritada olingan. Ushbu genlar insonning asosiy histokompatibillik kompleksi III sinf mintaqasida joylashgan. Ushbu gen bir-biriga qo'shni ikki xil gen, NG36 va G9a, deb taxmin qilingan, ammo yaqinda chop etilgan nashr faqat bitta gen mavjudligini ko'rsatmoqda. Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil hujayra ichidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'sirida ishtirok etadi deb o'ylashadi. Ushbu genning uchta muqobil ravishda biriktirilgan transkript variantlari mavjud, ammo faqat ikkitasi to'liq tavsiflangan.[7]

G9a va G9a o'xshash oqsil, boshqa bir histon-lizin N-metiltransferaza, sintezini katalizlaydi H3K9me2, bu a repressiv belgi.[8][9][10] G9a bu muhim boshqaruv mexanizmi epigenetik regulyatsiya ichida akumbens yadrosi (NAcc);[11] NAccdagi kamaytirilgan G9a ekspressioni an rivojlanishida vositachilik qilishda markaziy rol o'ynaydi giyohvandlik.[11] G9a o'sishiga qarshi OsFosB orqali ifoda H3K9me2 va DFosB tomonidan bostiriladi.[11][12] G9a DFOSB ning giyohvand moddalar bilan bog'liq xatti-harakatlariga qarama-qarshi ta'sir ko'rsatadi (masalan, o'z-o'zini boshqarish ) va sinaptik qayta qurish (masalan, dendritik arborizatsiya - qo'shimcha daraxtga o'xshash rivojlanish dendritik filiallar va tikanlar ) akumbens yadrosida bo'ladi va shuning uchun DFosB funktsiyasiga qarshi turadi, shuningdek, uning ifodasi oshadi.[11] G9a va DFosB bir xil gen maqsadlariga ega.[13] Akkumulyator yadrosidagi rolidan tashqari, G9a neyropatik og'riqni rivojlanishida va saqlanishida hal qiluvchi rol o'ynaydi.[14][15] Periferik asab shikastlanishidan keyin G9a dorsal ildiz ganglionlaridagi +600 genlarning ekspressionini tartibga soladi. Ushbu transkriptomik o'zgarish sezgir neyronlarni gipereksitativ holatga qaytaradi, bu esa og'riqni mexanik ravishda yuqori sezuvchanligiga olib keladi. [14]

O'zaro aloqalar

EHMT2 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan KIAA0515 va prostata bezi to'qimalari bilan bog'langan homeodomain oqsili NKX3.1.[16][17]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v ENSG00000224143, ENSG00000206376, ENSG00000204371, ENSG00000227333, ENSG00000232045, ENSG00000236759 GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000238134, ENSG00000224143, ENSG00000202300000, ENGG0000002020, 6300 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000013787 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Milner CM, Kempbell RD (mart 1993). "G9a geni insonning asosiy histosayish kompleksidagi tarkibida ankiringa o'xshash takrorlanishlarni o'z ichiga olgan yangi oqsilni kodlaydi". Biokimyoviy jurnal. 290 (Pt 3): 811-8. doi:10.1042 / bj2900811. PMC  1132354. PMID  8457211.
  6. ^ Tachibana M, Sugimoto K, Fukusima T, Shinkai Y (iyul 2001). "G9a tarkibidagi domen tarkibidagi oqsil - bu yangi lizinni afzal ko'rgan sutemizuvchilarning histoni metiltransferaza, giperaktivlik va histon H3 ning 9 va 27 lizinlariga nisbatan o'ziga xos selektivligi bilan". Biologik kimyo jurnali. 276 (27): 25309–17. doi:10.1074 / jbc.M101914200. PMID  11316813.
  7. ^ a b "Entrez Gen: EHMT2 eukromatik giston-lizin N-metiltransferaza 2".
  8. ^ a b Nestler EJ (avgust 2015). Depressiyada miyaning mukofotlash davri roli: transkripsiya mexanizmlari. Neyrobiologiyaning xalqaro sharhi. 124. 151-70 betlar. doi:10.1016 / bs.irn.2015.07.003. ISBN  9780128015834. PMC  4690450. PMID  26472529.
  9. ^ a b "Giston-lizin N-metiltransferaza, H3 lizin-9 o'ziga xos 3". HIstome: Giston infobazasi. Olingan 8 iyun 2018.
  10. ^ "Giston-lizin N-metiltransferaza, H3 lizin-9 o'ziga xos 5". HIstome: Giston infobazasi. Olingan 8 iyun 2018.
  11. ^ a b v d Nestler EJ (2014 yil yanvar). "Giyohvandlikning epigenetik mexanizmlari". Neyrofarmakologiya. 76 (Pt B): 259-68. doi:10.1016 / j.neuropharm.2013.04.004. PMC  3766384. PMID  23643695.
  12. ^ Whalley K (2014 yil dekabr). "Ruhiy kasalliklar: epigenetik muhandislikning yutug'i". Tabiat sharhlari. Nevrologiya. 15 (12): 768–9. doi:10.1038 / nrn3869. PMID  25409693. S2CID  11513288.
  13. ^ Robison AJ, Nestler EJ (oktyabr 2011). "Narkomaniyaning transkripsiya va epigenetik mexanizmlari". Tabiat sharhlari. Nevrologiya. 12 (11): 623–37. doi:10.1038 / nrn3111. PMC  3272277. PMID  21989194.
    Shakl 4: Gen ekspressionining dori regulyatsiyasining epigenetik asoslari
  14. ^ a b Laumet, Geoffroy (2015). "G9a o'tkir va surunkali og'riqqa o'tish paytida K + kanal genlarining epigenetik sustirilishi uchun juda muhimdir". Tabiat nevrologiyasi. 18 (12): 1746–1755. doi:10.1038 / nn.4165. PMC  4661086. PMID  26551542.
  15. ^ Liang, Lingli (2016). "G9a birlamchi sezgir neyronlarda asab shikastlanishidan kelib chiqqan Kcna2 regulyatsiyasida ishtirok etadi". Ilmiy ma'ruzalar. 6: 37704. Bibcode:2016 yil NatSR ... 637704L. doi:10.1038 / srep37704. PMC  5118693. PMID  27874088.
  16. ^ Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  17. ^ Dutta A va boshq. (Iyun 2016). "Prostata bezi differentsiatsiyasini boshqaradigan NKX3.1-G9a-UTY transkripsiya qiluvchi tartibga solish tarmog'ini aniqlash". Ilm-fan. 352 (6293): 1576–80. Bibcode:2016Sci ... 352.1576D. doi:10.1126 / science.aad9512. PMC  5507586. PMID  27339988.

Qo'shimcha o'qish