Exosome komponenti 2 - Exosome component 2

EXOSC2
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2NN6
Identifikatorlar
Taxalluslar	EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosome komponent 2, SHRF
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 Generkartalar: EXOSC2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 9 (odam)
Oxiri	130,704,894 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 2 (sichqoncha)
Oxiri	31,681,349 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• 3'-5'-ekzoribonukleaza faolligi; • ekzoribonukleaza faolligi; • 7S RNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitoplazma; • sitozol; • ekzosoma (RNase kompleksi); • yadro ekzozomasi (RNase kompleksi); • sitoplazmatik ekzoma (RNase kompleksi); • hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • nukleus;
Biologik jarayon	• yadroli poliadenilatsiyaga bog'liq tRNK katabolik jarayoni; • yadroli poliadenilatsiyaga bog'liq rRNK katabolik jarayoni; • mRNK barqarorligini tartibga solish; • trikistronik rRNK transkriptidan (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 5.8S rRNK ning etuk 3'-uchini hosil qilish uchun ekzonukleolitik qirqish; • yadro-transkripsiyalangan mRNK katabolik jarayoni, ekzonukleolitik, 3'-5 '; • CUT katabolik jarayoni; • transkripsiya joyida aberrant 3'-uchlari bo'lgan mRNKgacha bo'lgan yadro tutilishi; • hujayra o'sishini ijobiy tartibga solish; • ekzonukleolitik yadro-transkripsiyalangan mRNK katabolik jarayoni, dezenilatsiyaga bog'liq parchalanish jarayonida ishtirok etadi; • rRNKni qayta ishlash; • U4 snRNA 3'-oxirigacha ishlov berish; • poliadenilatsiyaga bog'liq snoRNA 3'-oxirigacha ishlov berish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	23404
	227715
	ENSG00000130713
	ENSMUSG00000039356
	Q13868
	Q8VBV3
	NM_001282708; NM_001282709; NM_014285
	NM_144886
	NP_001269637; NP_001269638; NP_055100
	NP_659135
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Exosome komponenti 2, shuningdek, nomi bilan tanilgan EXOSC2, a oqsil odamlarda bu kodlangan EXOSC2 gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Sutemizuvchi mRNAlar o'z ichiga oladi AUga boy elementlar (ARE) ularning ichida uchta asosiy tarjima qilinmagan mintaqalar. Xamirturushda, 3-boshdan 5-gacha mRNA degradatsiyasi vositachilik qiladi ekzozom, ko'p qismli zarracha. EXOSC2 (xamirturush Rrp4 oqsiliga homolog bo'lgan) inson ekzozomasining tarkibiy qismidir.^[7]

O'zaro aloqalar

Exosome komponent 2 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000130713 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039356 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Entrez Gen: EXOSC2 exosome 2-komponent".
^ Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A, Mann M, Tollervey D (noyabr 1997). "Ekzosoma: ko'p miqdordagi 3 '-> 5' ekzoribonukleazlarni o'z ichiga olgan konservalangan eukaryotik RNKni qayta ishlash kompleksi". Hujayra. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.
^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (noyabr, 2001). "AU biriktiruvchi oqsillar tarkibida ARE o'z ichiga olgan mRNAlarning parchalanishi uchun ekzosomani jalb qiladi". Hujayra. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
^ ^a ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (noyabr 2002). "Inson ekzosomasi tarkibiy qismlari orasidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri RNase PH tipidagi subbirliklarni oltita a'zodan iborat PNPase-ga o'xshash halqaga o'rnatilishini qo'llab-quvvatlaydi". J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

Qo'shimcha o'qish

Adams MD, Dubnik M, Kerlavage AR va boshq. (1992). "Inson miyasining 2375 genini ketma-ket aniqlash". Tabiat. 355 (6361): 632–4. doi:10.1038 / 355632a0. PMID 1538749. S2CID 4234345.
Morris CM, Heisterkamp N, Groffen J, Fitzgerald PH (1991). "Filadelfiya-musbat leykemiya bilan og'rigan ayrim bemorlarda butun ABL geni 5'-BCR bilan qo'shiladi". Qon. 78 (4): 1078–84. doi:10.1182 / qon.V78.4.1078.1078. PMID 1868241.
Zhu QS, Heisterkamp N, Groffen J (1990). "Insonning ABL promouter mintaqalarining xarakteristikasi". Onkogen. 5 (6): 885–91. PMID 2163052.
Soekarman D, van Denderen J, Hoefsloot L va boshq. (1990). "Filadelfiyadagi bcr-abl termoyadroviy mahsulotining yangi varianti xromosoma-pozitiv o'tkir limfoblastik leykemiya". Leykemiya. 4 (6): 397–403. PMID 2193202.
Chen SJ, Chen Z, Shrift MP va boshq. (1989). Ph1 musbat o'tkir leykemiyalardagi BCR va ABL genlarining tarkibiy o'zgarishlari, BCR genining birinchi intronidagi qayta tuzilishlar: Alu ketma-ketligini xromosoma translokatsiyasiga taalluqli yana bir dalil ". Nuklein kislotalari rez. 17 (19): 7631–42. doi:10.1093 / nar / 17.19.7631. PMC 334872. PMID 2678002.
Heisterkamp N, Stam K, Groffen J va boshq. (1985). "Bcr genining tarkibiy tuzilishi va uning Ph 'translokatsiyasidagi roli". Tabiat. 315 (6022): 758–61. doi:10.1038 / 315758a0. PMID 2989703. S2CID 4343076.
Shtivelman E, Lifshitz B, Gale RP va boshq. (1986). "Insonning abl genidan va bcr-abl birlashtirilgan genidan transkripsiyalangan RNKlarning muqobil qo'shilishi". Hujayra. 47 (2): 277–84. doi:10.1016/0092-8674(86)90450-2. PMID 3021337. S2CID 36324337.
Grosveld G, Verwoerd T, van Agthoven T va boshq. (1987). "K562 surunkali myelotsitik hujayra chizig'i bcr ning uzilish nuqtasini o'z ichiga oladi va kimyoviy bcr / c-abl transkriptini ishlab chiqaradi". Mol. Hujayra. Biol. 6 (2): 607–16. doi:10.1128 / mcb.6.2.607. PMC 367552. PMID 3023859.
Bernards A, Rubin CM, Westbrook CA va boshq. (1987). "Insonning c-abl genidagi birinchi intron kamida 200 kilobazadan iborat bo'lib, surunkali miyelogik leykozda translokatsiya uchun mo'ljallangan". Mol. Hujayra. Biol. 7 (9): 3231–6. doi:10.1128 / mcb.7.9.3231. PMC 367959. PMID 3313010.
Groffen J, Heisterkamp N, Grosveld F va boshq. (1982). "Kosmid kutubxonasidan odam onkogen sekanslarini ajratish (v-fes homolog)". Ilm-fan. 216 (4550): 1136–8. doi:10.1126 / science.6281890. PMID 6281890.
Heisterkamp N, Groffen J, Stivenson JR (1983). "Inson v-abl uyali homologi". J. Mol. Qo'llash. Genet. 2 (1): 57–68. PMID 6302194.
Heisterkamp N, Stivenson JR, Groffen J va boshq. (1984). "Surunkali myelotsitik leykemiyada translokatsion sinish nuqtasi yonida joylashgan c-ab1 onkogenini lokalizatsiya qilish". Tabiat. 306 (5940): 239–42. doi:10.1038 / 306239a0. PMID 6316147. S2CID 4258884.
Groffen J, Stivenson JR, Heisterkamp N va boshq. (1984). "Filadelfiya xromosomalarining uzilish nuqtalari 22 xromosomada, cheklangan mintaqada to'plangan". Hujayra. 36 (1): 93–9. doi:10.1016/0092-8674(84)90077-1. PMID 6319012. S2CID 9876892.
Chissoe SL, Bodenteich A, Vang YF va boshq. (1995). "Filadelfiya xromosoma translokatsiyasida ishtirok etgan odamning ABL geni, BCR geni va mintaqalarining ketma-ketligi va tahlili". Genomika. 27 (1): 67–82. doi:10.1006 / geno.1995.1008. PMID 7665185.
Litz Idoralar, McClure JS, Kopenhaver CM, Brunning RD (1993). "Surunkali myelojenik leykemiyada asosiy to'xtash nuqtasi klasteri mintaqasidagi kichik segmentlarning takrorlanishi". Qon. 81 (6): 1567–72. doi:10.1182 / qon.V81.6.1567.1567. PMID 8453102.
Mitchell P, Petfalski E, Tollervey D (1996). "5.8S rRNA xamirturushining 3 'uchi ekzonukleazni qayta ishlash mexanizmi orqali hosil bo'ladi". Genlar Dev. 10 (4): 502–13. doi:10.1101 / gad.10.4.502. PMID 8600032.
Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A va boshq. (1997). "Ekzosoma: ko'p miqdordagi 3 '-> 5' ekzoribonukleazlarni o'z ichiga olgan konservalangan eukaryotik RNKni qayta ishlash kompleksi". Hujayra. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A va boshq. (1999). "Xamirturush ekzozomasi va odam PM-Scl 3 '-> 5' ekzonukleazalarning o'zaro bog'liq komplekslari". Genlar Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R va boshq. (2001). "Inson ekzosomasining uchta yangi komponenti". J. Biol. Kimyoviy. 276 (9): 6177–84. doi:10.1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE va boshqalar. (2002). "AU biriktiruvchi oqsillar tarkibida ARE o'z ichiga olgan mRNAlarning parchalanishi uchun ekzosomani jalb qiladi". Hujayra. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 9 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000130713 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039356 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: EXOSC2 exosome 2-komponent".

[pmid9390555-6] Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A, Mann M, Tollervey D (noyabr 1997). "Ekzosoma: ko'p miqdordagi 3 '-> 5' ekzoribonukleazlarni o'z ichiga olgan konservalangan eukaryotik RNKni qayta ishlash kompleksi". Hujayra. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.

[pmid11719186-7] Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (noyabr, 2001). "AU biriktiruvchi oqsillar tarkibida ARE o'z ichiga olgan mRNAlarning parchalanishi uchun ekzosomani jalb qiladi". Hujayra. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

[pmid12419256-8] Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (noyabr 2002). "Inson ekzosomasi tarkibiy qismlari orasidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri RNase PH tipidagi subbirliklarni oltita a'zodan iborat PNPase-ga o'xshash halqaga o'rnatilishini qo'llab-quvvatlaydi". J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]