Fimbrial usher oqsil - Fimbrial usher protein
| Fimbrial Usher oqsili | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 FimD (25-139) 1-turdagi plyuslarni yig'ish platformasining tuzilishi.[1] | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | Usher | ||||||||
| Pfam | PF00577 | ||||||||
| InterPro | IPR000015 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00886 | ||||||||
| TCDB | 1. B.11 | ||||||||
| OPM superfamily | 187 | ||||||||
| OPM oqsili | 4j3o | ||||||||
| |||||||||
The fimbrial usher oqsil ning biogenezida ishtirok etadi pilus yilda Gram-manfiy bakteriyalar. Fimbriyalar (yoki pili) biogenezi uchun molekulyar "usher" deb nomlangan periplazmik chaperon va tashqi membrana oqsilidan tashkil topgan ikki komponentli yig'ish va tashish tizimi zarur.[2][3][4]
Usher oqsili 86 dan 100 kDa gacha bo'lgan molekulyar og'irlikka ega va membranani o'z ichiga olgan 24 ta torli beta barel domenidan iborat bo'lib, uni eslatadi porinlar va to'rtta periplazmik eruvchan domenlardan: taxminan 120 qoldiqdan iborat N-terminal (NTD),[1] taxminan 80 ta qoldiqdan iborat "o'rta" domen[5] ketma-ketlikning (plagin domeni) va ikkita IG-ga o'xshash domenlarning (har biri 80 ta qoldiq uzunlikdagi) beta-barel mintaqasida (CTD1 va CTD2) eruvchan qo'shimchalar sifatida joylashgan.[6] Ushbu oqsillarning ketma-ket o'xshashligi darajasi unchalik katta bo'lmasa ham, ular bir qator xususiyatlarga ega. Ulardan biri ikki juft disulfidli bog'lanish hosil qiluvchi sisteinlarning mavjudligi, birinchisi NTDda, ikkinchisi CTD2 da joylashgan. Ketma-ketlikning eng yaxshi saqlanadigan mintaqasi vilka domeniga to'g'ri keladi.
Adabiyotlar
- ^ a b Nishiyama M, Horst R, Eidam O va boshq. (Iyun 2005). "Fermning 1-tipli yig'ish platformasi bo'yicha shaperone-subunit kompleksini tanib olishning strukturaviy asoslari". EMBO J. 24 (12): 2075–86. doi:10.1038 / sj.emboj.7600693. PMC 1150887. PMID 15920478.
- ^ Xultgren SJ, Jeykob-Dubuisson F, Striker R (1994). "Uyali energiyadan mustaqil ravishda pilini shaperon yordamida o'zini o'zi yig'ish". J. Biol. Kimyoviy. 269 (17): 12447–12455. PMID 7909802.
- ^ Schifferli DM, Alrutz MA (1994). "Escherichia coli ning 987P fimbriyalari tashqi membrana oqsiliga bog'lovchi joylashtirilgan joylar". J. Bakteriol. 176 (4): 1099–1110. doi:10.1128 / JB.176.4.1099-1110.1994. PMC 205162. PMID 7906265.
- ^ Saier Jr MH, Van Rosmalen M (1993). "Fimbrial assambleyada hamkorlikda ishlaydigan bakterial ekstrasitoplazmatik shaperon oqsillarining ikki oilasi o'rtasidagi tuzilish va evolyutsion munosabatlar". Res. Mikrobiol. 144 (7): 507–527. doi:10.1016 / 0923-2508 (93) 90001-I. PMID 7906046.
- ^ Capitani G, Eidam O, Grutter MG (2006). "Bakterial tashqi membranani yaratuvchi yangi sohaga dalillar". Oqsillar. 65 (4): 816–23. doi:10.1002 / prot.21147. PMID 17066380. S2CID 28766740.
- ^ Phan G, Remaut H, Vang T, Allen WJ, Pirker KF, Lebedev A va boshq. (2011). "FimD usherining kristalli tuzilishi, uning FimC-FimH substratiga bog'langan". Tabiat. 474 (7349): 49–53. doi:10.1038 / tabiat10109. PMC 3162478. PMID 21637253.