Glikozid gidrolaza oilasi 27 - Glycoside hydrolase family 27 - Wikipedia
| Melibiaz | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 guruch alfa-galaktozidazaning kristall tuzilishi | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | Melibiaz | ||||||||
| Pfam | PF02065 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR000111 | ||||||||
| SCOP2 | 1kc / QOIDA / SUPFAM | ||||||||
| Ajoyib | GH27 | ||||||||
| |||||||||
Molekulyar biologiyada glikozid gidrolaza oilasi 27 a oila ning glikozid gidrolazalar.
Glikozid gidrolazalar EC 3.2.1. bu keng tarqalgan fermentlar guruhi gidroliz The glikozid birikmasi ikki yoki undan ortiq uglevodlar o'rtasida yoki uglevod bilan uglevod bo'lmagan qism o'rtasida. Glikozidli gidrolazalar uchun ketma-ketlik o'xshashligiga asoslangan tasniflash tizimi> 100 xil oilani aniqlashga olib keldi.[1][2][3] Ushbu tasnif mavjud Ajoyib veb-sayt,[4][5] va shuningdek, uglevod faol fermentlarining onlayn entsiklopediyasi bo'lgan CAZypedia-da muhokama qilingan.[6][7]
Glikozid gidrolaza oilasi 27 bilan birgalikda oila 31 va oila 36 alfa-galaktozidazalar alfa-galaktozidazalarning superfamilasi bo'lgan GH-D glikozil gidrolaza klanini hosil qiladi, alfa-N-asetilgalaktozaminidazalar va izomaltodextranazlar umumiy birlashishi mumkin bo'lgan katalitik mexanizmi va tarkibiy topologiyasi.
Alfa-galaktozidaza (EC 3.2.1.22 ) (melibiyaz)[8] ning gidrolizini katalizlaydi melibioz ichiga galaktoza va glyukoza. Insonda bu fermentning etishmasligi sababdir Fabri kasalligi (X bilan bog'langan sfingolipidoz). Alfa-galaktozidaza turli xil organizmlarda mavjud. Alfa-galaktozidaza ketma-ketligida har xil o'xshashlik darajasi sezilarli ökaryotik turlari. Escherichia coli kofaktor sifatida NAD va magniyni talab qiladigan alfa-galaktozidaza (gen melA), ökaryotik fermentlar bilan tizimli ravishda bog'liq emas; aksincha, an Escherichia coli plazmid kodlangan alfa-galaktozidaza (gen rafA P16551)[9] eukaryotik alfa-galaktozidazalar domeniga o'xshash taxminan 50 ta aminokislotadan iborat hududni o'z ichiga oladi. Alfa-N-asetilgalaktozaminidaza (EC 3.2.1.49 )[10] N-atsetil-alfa-D-galaktozaminidlardagi kamaytirmaydigan N-atsetil-D-galaktozamin qoldiqlarining gidrolizini katalizlaydi. Insonda bu fermentning etishmasligi sababdir Shindler va Kanzaki kasalliklari. Ushbu fermentning ketma-ketligi eukaryotik alfa-galaktozidazalar bilan juda bog'liq.
Tashqi havolalar
Adabiyotlar
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Mornon JP, Fabrega S, Lehn P, Devies G (1995). "Konservalangan katalitik texnika va glikozil gidrolazalarning bir necha oilalari uchun umumiy katlamni bashorat qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 92 (15): 7090–7094. Bibcode:1995 yil PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC 41477. PMID 7624375.
- ^ Henrissat B, Devies G (1995). "Glikozil gidrolazalarning tuzilmalari va mexanizmlari". Tuzilishi. 3 (9): 853–859. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Bayroch, A. "Glikozil gidrolaza oilalarining tasnifi va SWISS-PROT-dagi glikozil gidrolaza yozuvlari indeksi". 1999 yil.
- ^ "Uy". CAZy.org. Olingan 2018-03-06.
- ^ Lombard, Vinsent; Golaconda Ramulu, Hemalata; Drula, Elodi; Koutino, Pedro M.; Henrissat, Bernard (2014-01-01). "2013 yilda uglevod faol fermentlar bazasi (CAZy)". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 42 (D1): D490-D495. doi:10.1093 / nar / gkt1178. ISSN 0305-1048. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ "Glikozidli gidrolaza oilasi 27". CAZypedia.org. Olingan 2018-03-06.
- ^ CAZypedia konsortsiumi (2018-12-01). "O'n yillik CAZypedia: uglevod-faol fermentlarning tirik ensiklopediyasi" (PDF). Glikobiologiya. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. ISSN 1460-2423. PMID 29040563.
- ^ Dey PM, Pridham JB (1972). "A-Galaktozidazalar biokimyosi". Alfa-galaktozidazalar biokimyosi. Adv. Ferment. Relat. Mollar. Biol. Enzimologiya yutuqlari - va molekulyar biologiyaning tegishli sohalari. 36. 91-120 betlar. doi:10.1002 / 9780470122815.ch3. ISBN 9780470122815. PMID 4561015.
- ^ Aslanidis S, Shmid K, Shmitt R (1989). "Escherichia coli-da rafinozani qabul qilish va ishlatishda vositachilik qiluvchi plazmidli genlarning nukleotidlar ketma-ketligi va operon tuzilishi". J. Bakteriol. 171 (12): 6753–6763. doi:10.1128 / jb.171.12.6753-6763.1989. PMC 210573. PMID 2556373.
- ^ Vang AM, Bishop DF, Desnick RJ (1990). "Odam alfa-N-asetilgalaktozaminidaza-molekulyar klonlash, nukleotidlar ketma-ketligi va to'liq uzunlikdagi cDNA ekspressioni. Odam alfa-galaktozidaza A bilan homologiya umumiy ajdod genidan evolyutsiyani taklif qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 265 (35): 21859–21866. PMID 2174888.
