MicroRNA ketma-ketligi - MicroRNA sequencing - Wikipedia

MicroRNA ketma-ketligi (miRNA-seq), turi RNK-sek, foydalanish keyingi avlod ketma-ketligi yoki katta parallel yuqori o'tkazuvchanlik DNKning ketma-ketligi ketma-ketlikka mikroRNKlar, shuningdek, miRNAlar deb ataladi. miRNA-seq boshqa RNK-seq shakllaridan farq qiladi, chunki kirish materiali ko'pincha kichik RNKlar uchun boyitiladi. miRNA-seq tadqiqotchilarga to'qimalarga xos ekspression shakllarini, kasallik assotsiatsiyasini va miRNAlarning izoformalarini o'rganishga va ilgari xarakterlanmagan miRNKlarni kashf qilishga imkon beradi. Kabi tartibga solinmagan miRNKlarning rolini o'ynaydigan dalillar saraton[1] miRNA-seq ni kelajakda diagnostika va prognozlash uchun muhim vosita bo'lishi uchun joylashtirdi, chunki xarajatlar kamayib bormoqda.[2] Boshqa miRNA profillash texnologiyalari singari, miRNA-Seq ham afzalliklarga ega (ketma-ketlik mustaqilligi, qamrovi) va kamchiliklari (yuqori narx, infratuzilma talablari, ishlash muddati va potentsiali asarlar ).[3]

Kirish

MikroRNKlar (miRNAlar) - uzunligi 21-25 nukleotid bo'lgan, transkriptning parchalanishi, inhibisyoni orqali oqsil ekspluatatsiyasini modulyatsiya qiladigan kichik ribonuklein kislotalarining oilasi. tarjima yoki transkriptlarni sekvestrlash.[4][5][6] Birinchi kashf etilgan miRNA, lin-4, genetikada topilgan mutagenez nematodaning embriondan keyingi rivojlanishini boshqaruvchi molekulyar elementlarni aniqlash uchun ekran Caenorhabditis elegans.[7] The lin-4 gen 22-nukleotidli RNKni 3'-tarjima qilinmagan mintaqasida konservatsiyalangan bog'lanish joylari bilan kodlagan. lin-14 mRNA stenogramma[8] va regulyatsiya qilingan LIN-14 oqsil ekspressioni.[9] Hozirda miRNKlar ko'plab rivojlanish va biologik jarayonlarni, shu jumladan tartibga solishda ishtirok etadi deb o'ylashadi gemopoez (miR-181 yilda Muskul mushak[10]), lipid metabolizmi (miR-14 yilda Drosophila melanogaster[11]) va neyronlarning rivojlanishi (lsy-6 yilda Caenorhabditis elegans[12]).[6] Ushbu kashfiyotlar miRNA-seq kabi miRNKlarni aniqlash va tavsiflashga qodir bo'lgan texnikani ishlab chiqishni talab qildi.

Tarix

Fursatdan foydalanish uchun MicroRNA sekvensiyasi (miRNA-seq) ishlab chiqilgan keyingi avlod ketma-ketligi yoki katta darajada parallel yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligi yangi miRNAlarni va ularning ekspression rejimlarini berilgan namunada topish uchun texnologiyalar. miRNA sekvensiyasi o'zi uchun yangi g'oya emas, ketma-ketlikning dastlabki usullari qo'llaniladi Sanger ketma-ketligi usullari. Tartibga tayyorlash kutubxonalarni yaratishni o'z ichiga oladi klonlash ning DNK ustun bilan tanlangan 21-25 bp o'lchamdagi endogen kichik RNKlardan teskari transkripsiya qilingan gel elektroforezi.[13] Biroq, bu usul vaqt va resurslar nuqtai nazaridan to'liqdir, chunki har bir klon alohida kuchaytirilishi va ketma-ketlikka tayyorlanishi kerak. Ushbu usul ham beixtiyor yuqori darajada ifoda etilgan miRNKlarga yordam beradi.[6] Keyingi avlod ketma-ketligi ketma-ketlikda zarur bo'lgan gibridizatsiya zondlariga ehtiyojni yo'q qiladi DNK mikroarray tahlil qilish, shuningdek Sanger ketma-ketligi usulida talab qilinadigan mashaqqatli klonlash usullari. Bundan tashqari, miRNA-SEQ usulidagi yangi avlod ketma-ketlik platformalari kichik RNKlarning katta hovuzlarini bitta ketma-ketlikda bajarilishini osonlashtiradi.[14]

miRNA-seq turli ketma-ketlik platformalari yordamida amalga oshirilishi mumkin. Kichiklarning birinchi tahlili RNKlar miRNA-seq usullari yordamida model zavodidan taxminan 1,4 million kichik RNK tekshirildi Arabidopsis talianasi foydalanish Lynx Therapeutics-ning ommaviy ravishda parallel ravishda imzolanishi (MPSS) ketma-ketlik platformasi. Ushbu tadqiqot kichik RNKlarni o'rganish uchun yangi, yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligi texnologiyalarining potentsialini namoyish etdi va genomlar kichik RNKlarning boy manbalari sifatida o'simliklar bilan ko'p sonli kichik RNKlarni hosil qilishini ko'rsatdi.[15] Keyinchalik tadqiqotlar boshqa ketma-ketlik texnologiyalaridan foydalanilgan, masalan C. elegans 18 yangi miRNA genini, shuningdek yangi nematodli kichik RNK sinfini aniqladi 21U-RNK.[16] Odamning bachadon bo'yni o'smalari va normal to'qimalarining kichik RNK profillarini taqqoslaydigan yana bir tadqiqotda ishlatilgan Illumina (kompaniya) Genom analizatori insonning 64 ta yangi miRNA genini hamda 67 ta differentsial ekspresiya qilingan miRNA ni aniqlash uchun.[17] Amaliy biosistemalar SOLiD sekvensiya platformasi, shuningdek, odamning ko'krak bezi saratonini aniqlashda miRNAlarning prognostik qiymatini o'rganish uchun ishlatilgan.[18]

Usullari

miRNA kutubxonasiga tayyorgarlik

Kichik RNK preparati

Shuningdek qarang: RNK ekstraktsiyasi, Fenol-xloroformni ajratib olish, Gel elektroforezi, DNK ligazasi, Teskari transkriptaz va Polimeraza zanjiri reaktsiyasi

Ketma-ket kutubxonani qurish yuqori ishlaydigan ketma-ketlik platformasiga qarab turli xil to'plamlar yordamida amalga oshirilishi mumkin. Shu bilan birga, kichik RNK sekvensiyasini tayyorlash uchun bir nechta umumiy qadamlar mavjud.[19][20]

RNKning umumiy izolatsiyasi

Berilgan namunada barcha RNK izotiyosiyanat / fenol / xloroform (GITC / fenol) usuli yoki Trizol (masalan, tijorat mahsuloti) yordamida ajratib olinadi va ajratib olinadi.Invitrogen ) reaktiv. Jelni tozalash va hajmini tanlash uchun odatda boshlang'ich miqdori 50-100 mkg bo'lgan umumiy RNK, 1 g to'qima odatda 1 mg umumiy RNK hosil qiladi.[20] RNK sifatini boshqarish ham o'lchanadi, masalan, Caliper LabChipGX-da RNK chipini ishlatish (Kaliper hayot fanlari ).

Kichik RNKlarning gel elektroforezi bilan fraktsiyasi

Izolyatsiya qilingan RNK denatura qiluvchi poliakrilamid jelida ishlaydi. Jelning tegishli o'lchamdagi RNKni o'z ichiga olgan qismini aniqlashda, oxir-oqibat ketma-ketlikdagi material miqdorini kamaytirishda radioaktiv 5'-32P yorlig'i bilan ishlangan oligonukleotidlar kabi tasvirlash usuli qo'llaniladi. Ushbu bosqich majburiy ravishda quyida keltirilgan ligatsiya va teskari transkripsiya bosqichlaridan oldin bajarilishi shart emas.[19][20]

Ligatsiya

Bog'lanish bosqichi kichik RNKlarning ikkala uchiga DNK adapterlarini qo'shadi, ular teskari transkripsiya paytida primer bog'lanish joylari vazifasini bajaradi va PCR kuchaytirish. Adenillangan bitta zanjirli DNK 3'adaptor, so'ngra 5'adaptor T4 RNK ligaz2 kabi ligatsiya qiluvchi ferment yordamida kichik RNKlarga bog'lanadi. Adapterlar, shuningdek, 5 'gidroksil guruhi bo'lgan RNKning parchalanish mahsulotlarini emas, balki 5' fosfat guruhi, xarakterli mikroRNKlari bo'lgan kichik RNKlarni ushlash uchun mo'ljallangan.[19][20]

Teskari transkripsiya va PCR kuchaytirish

Ushbu qadam kichik adapter bog'langan RNKlarni sekvensiya reaktsiyasida ishlatiladigan cDNA klonlariga aylantiradi. Ushbu bosqichni ba'zi bir shakllardan foydalangan holda amalga oshiradigan ko'plab savdo to'plamlar mavjud teskari transkriptaz. Keyin PCR cDNA sekansiyalarini ko'paytirish uchun amalga oshiriladi. Noyob nukleotid teglari bilan ishlangan primerlardan, shuningdek, birlashtirilgan kutubxona multiplekslari ketma-ketligida ID teglarini yaratish uchun foydalanish mumkin.[19][20]

Tartiblash

Shuningdek qarang: DNKning ketma-ketligi

Haqiqiy RNK ketma-ketligi ishlatilgan platformaga qarab sezilarli darajada o'zgarib turadi. Uchta yangi avlod avlodlari ketma-ketligi[21] platformalar Pirosekvensiya ustida 454 Hayot fanlari platforma,[22] polimeraza asosidagi ketma-ket sintez Illumina (kompaniya) platforma,[23] yoki ligatsiya bilan tartiblash ustida ABI qattiq ketma-ketligi platforma.[24]

Ma'lumotlarni tahlil qilish

MiRNA-seq ma'lumotlarini tahlil qilishda markaziylik 1) ketma-ketlik o'qishidan miRNA ko'pligi darajasini olish, 2) yangi miRNKlarni kashf etish va keyin 3) differentsial ifoda etilgan miRNA va ularning 4) bog'liq mRNA genlarining maqsadlarini aniqlash qobiliyatidir.

miRNA-seq ma'lumotlarini tahlil qilish

miRNA Alignment & Mouldence Quantification

miRNA'lar ba'zi hujayralar turlarida, to'qimalarida, rivojlanish bosqichlarida yoki ayniqsa saraton kabi kasallik holatlarida ifoda etilishi mumkin.[1] Chuqur sekvensiya (miRNA-seq) berilgan namunadan millionlab o'qishni hosil qilganligi sababli, bu bizga miRNKlarni profillashtirishga imkon beradi; ularning absolyut miqdorini aniqlash, ularning variantlarini kashf etish bilan bo'ladimi (ma'lum izomirlar[25]) O'qish ketma-ketligining o'rtacha uzunligi o'rtacha miRNA (17-25 nt) dan uzunroq ekanligini hisobga olsak, miRNA ning 3 'va 5' uchlari bir xil o'qishda topilishi kerak. Bir nechta miRNA miqdorini aniqlash algoritmlari mavjud.[21][26] Ularning umumiy qadamlari quyidagicha:[27]

  1. Sekvensiyadan so'ng xom ketma-ketlik ko'rsatkichlari sifatga qarab filtrlanadi. Adapter ketma-ketliklari ham xom ketma-ketlikni o'qishdan o'chiriladi.
  2. Natijada olingan o'qishlar tezkor faylga formatlanadi, bu erda har bir noyob teg uchun nusxa raqami va ketma-ketligi qayd etiladi.
  3. E. Coli ifloslanishini ko'rsatishi mumkin bo'lgan ketma-ketliklar a tomonidan aniqlanadi Portlash E. Coli ma'lumotlar bazasini qidirish va tahlildan olib tashlash.
  4. Qolgan ketma-ketliklarning har biri miRNA ketma-ketligi ma'lumotlar bazasiga (masalan, miRBase) to'g'ri keladi[28]) DICER-ning nomukammal ishlashini hisobga olish uchun 3 'uchida 6nt va 5' ning oxirida 3nt ko'tarilishga ruxsat beriladi.
  5. Keyin miRNA ma'lumotlar bazasiga to'g'ri kelmaydigan ko'rsatkichlar mutatsiyalarni o'tkazishi mumkin bo'lgan yoki o'tib ketgan miRNAlarni aniqlash uchun miRNA prekursorlariga yumshoq tarzda to'g'ri keladi. RNK tahriri.
  6. Keyin har bir miRNA uchun o'qishlar soni har bir miRNKning ko'pligi to'g'risida xabar berish uchun xaritada olingan miRNAlarning umumiy soniga normalizatsiya qilinadi.

Roman miRNA kashfiyoti

MiRNA-seqning yana bir afzalligi shundaki, u an'anaviy skrining va profil usullaridan chetda qolgan bo'lishi mumkin bo'lgan yangi miRNKlarni topishga imkon beradi.[27] Bir nechta yangi miRNA kashfiyot algoritmlari mavjud. Ularning umumiy qadamlari quyidagicha:

  1. Ma'lum bo'lgan miRNA ketma-ketliklariga to'g'ri kelmaydigan o'qishlarni oling va ularni genomga moslang.
  2. RNKni katlama usuli
    1. MiRNA ketma-ketliklari uchun to'liq mos keladigan narsa topildi, genomik ketma-ketlikni oling, ikkala tomonida ~ 100bp yonma-yon ketma-ketlik va RNKni Vena to'plami kabi RNK katlama dasturi orqali boshqaring.[29]
    2. MiRNA soch tolasining bir qo'lida joylashgan va minimal erkin energiyasi ~ 25kkal / mol dan kam bo'lgan katlamali ketma-ketliklar taxminiy miRNA sifatida ro'yxatga kiritilgan.
    3. Qisqa ro'yxatdagi ketma-ketliklar faqatgina mumkin bo'lgan prekursorlar ketma-ketligini o'z ichiga olgan holda qisqartiriladi va keyinchalik qo'shni ketma-ketliklar tomonidan sun'iy ravishda barqarorlashtirilmasligi uchun qayta to'ldiriladi.
    4. Olingan katlanmış ketma-ketliklar, agar miRNA ketma-ketligi soch tolasining bir qo'liga tushib qolsa va turlar orasida yuqori darajada saqlanib qolsa, yangi miRNA deb hisoblanadi.
  3. Yulduzli ipni ifodalash usuli (miRdeep[30])
    1. Yangi miRNA ketma-ketliklari DICERni qayta ishlash tufayli namoyon bo'ladigan xarakterli ekspression naqshlari asosida aniqlanadi: etuk miRNA ning yulduz zanjiri va pastadir ketma-ketliklari bo'yicha yuqori ifodasi.

Diferensial ifoda tahlili

Har bir namuna uchun miRNKlarning ko'pligi aniqlangandan so'ng, ularning ekspression darajalari namunalar bilan taqqoslanishi mumkin. Keyinchalik, ma'lum bir vaqt nuqtalari yoki xususan to'qimalar yoki kasallik holatlarida imtiyozli ravishda ifodalangan miRNKni aniqlash mumkin bo'ladi. Namunalar orasidagi xaritalangan o'qishlar sonini normallashtirgandan so'ng, ko'plab statistik testlardan foydalanish mumkin (ishlatilganlar kabi) gen ekspresiyasini profillash ) differentsial ifodani aniqlash uchun

Maqsadli bashorat

MiRNA ning mRNA maqsadlarini aniqlash, ular ekspressionini boshqaradigan genlar yoki genlar tarmoqlari to'g'risida tushuncha beradi.[31] Ochiq ma'lumotlar bazalari miRNA maqsadlarining prognozlarini ta'minlaydi. Ammo haqiqiy ijobiy bashoratlarni noto'g'ri ijobiy bashoratlardan yaxshiroq ajratish uchun miRNA-seq ma'lumotlarini mRNA-seq ma'lumotlariga qo'shib, miRNA: mRNA funktsional juftlarini kuzatish mumkin. RNA22,[32] TargetScan,[33][34][35][36][37][38] miRanda,[39] va PicTar[40] ushbu maqsad uchun mo'ljallangan dasturiy ta'minotdir. Bashoratli dasturlarning ro'yxati berilgan Bu yerga.Umumiy qadamlar:

  1. MiRNKni aniqlang: mRNA bog'lovchi juftliklar, mRNA ketma-ketligining 3'-UTR dagi miRNA sekanslari orasidagi komplementarlik aniqlanadi.
  2. MiRNKning saqlanish darajasini aniqlang: turlar bo'yicha mRNA bog'lovchi juftliklar. Odatda yuqori darajada bog'langan juftliklar bashorat qilishning noto'g'ri pozitsiyalari bo'lishi ehtimoli kamroq.
  3. MRNA-seq yoki oqsil ekspresyoni ma'lumotlarida miRNA nishonga olish dalillarini kuzatib boring: qaerda miRNA ekspresi yuqori bo'lsa, uning maqsad genining geni va oqsil ekspressioni past bo'lishi kerak.

MRNA maqsadlari uchun maqsadlarni tasdiqlash

Ko'pgina miRNAlar mRNA maqsadlarining to'g'ridan-to'g'ri parchalanishida ishlaydi; bu, ayniqsa, o'simliklarda to'g'ri keladi va shu tariqa miRNKlarning bu xususiyatidan foydalanish uchun ajratilgan yoki parchalanib ketgan mRNKlarning yopilmagan 3 'uchlarini ketma-ketlashtirish orqali yuqori rentabellikga ega bo'lgan tartiblash usullari ishlab chiqilgan. Ushbu usullar sifatida tanilgan Degradom ketma-ketligi yoki PARE.[41][42] Maxsus mRNAlarda nishon dekolatsiyasini tasdiqlash odatda 5 'ning o'zgartirilgan versiyasi yordamida amalga oshiriladi CDNA DNKlarining tez kuchayishi genga xos primer bilan.

Ilovalar

Roman miRNKlarini aniqlash

miRNA-seq ilgari an'anaviy miRNA profillash usullaridan chetga chiqqan yangi miRNKlarni aniqladi. Bunday topilmalarga misollar embrional ildiz hujayralarida,[25] tovuq embrionlari,[43] o'tkir limfoblastik leykemiya,[44] diffuz yirik b-hujayrali limfoma va b-hujayralar,[45] o'tkir miyeloid leykemiya,[46] va o'pka saratoni.[47]

Kasallik biomarkerlari

Mikro RNKlar deyarli barcha uyali jarayonlarning muhim regulyatorlari, masalan, tirik qolish, ko'payish va farqlash. Binobarin, miRNAlarning onko- va regulyatsiyasi orqali saratonning turli jihatlarida ishtirok etishi kutilmagan emas. o'smani bostiruvchi gen ifoda. Yuqori rentabellikga ega profillash usullarini ishlab chiqish bilan birgalikda miRNAlar saratonni tasniflash, terapiyaga javob va prognoz uchun biomarker sifatida aniqlandi.[48] Bundan tashqari, miRNAlar gen ekspressionini tartibga solganligi sababli, ular ma'lum bir buzuqlikni keltirib chiqarishi mumkin bo'lgan muhim tartibga soluvchi tarmoqlarda bezovtaliklarni aniqlashi mumkin.[48] Kasallikning biomarkerlari va bashoratchilari sifatida miRNAlarning bir nechta qo'llanilishi quyida keltirilgan.

1-jadval: MikroRNKlar bilan ajralib turadigan saraton subtiplari
Saraton turimiRNAlar aRef.
Ko'krak
ER holatimiR-26a / b, miR-30 oilasi, miR-29b, miR-155, miR-342, miR-206, miR-191[49][50][51][52]
PR maqomilet-7c, miR-29b, miR-26a, miR-30 oilasi, miR-520g[52][53]
HER2 /neu holatmiR-520d, miR-181c, miR-302c, miR-376b, miR-30e[49][53]
O'pka
Skuamoz va skuamoz bo'lmagan hujayramiR-205[54]
Kichik hujayra va kichik bo'lmagan hujayramiR-17-5p, miR-22, miR-24, miR-31[48]
Oshqozon
Diffuz va ichakmiR-29b / c, miR-30 oilasi, miR-135a / b[55]
Endometrium
Bachadon papilleriga qarshi endometrioidmiR-19a / b, miR-30e-5p, miR-101, miR-452, miR-382, miR-15a, miR-29c[56]
Buyrak
Papillariya va hujayralarni tozalashmiR-424, miR-203, miR-31, miR-126[57]
Onkotsitoma va xromofobmiR-200c, miR-139-5p[57]
Miyeloma
t bilan (14; 16)miR-1, miR-133a[58]
t (4; 14) bilanmiR-203, miR-155, miR-375[58]
t bilan (11; 14)miR-125a, miR-650, miR-184[58]
O'tkir miyeloid leykemiya
t bilan (15; 17)miR-382, miR-134, miR-376a, miR-127, miR-299-5p, miR-323[59]
t (8; 21) yoki inv (16) bilanlet-7b / c, miR-127[59]
bilan NPM1 mutatsiyalarmiR-10a / b, let-7, miR-29, miR-204, miR-128a, miR-196a / b[59][60]
bilan FLT3 ITDmiR-155[59][60][61]
Surunkali limfotsitik leykemiya
ZAP-70 darajasi va IgVH holatimiR-15a, miR-195, miR-221, miR-155, miR-23b[62]
Melanoma
BRAF V600E bilanmiR-193a, miR-338, miR-565[63]
Lenfoma
Diffuz katta B hujayrali limfomabor-miR-128, bor-miR-129-3p, bor-miR-152, bor-miR-155, bor-miR-185, bor-miR-193a-5p, bor-miR-196b, bor-miR- 199b-3p, has-miR-20b, has-miR-23a, has-miR-27a, has-miR-28-5p, has-miR-301a, has-miR-331-3p, has-miR-365, miR-625 ga ega, miR-9 ga ega[45]

aBu ushbu xavfli kasalliklarga chalingan miRNAlarning to'liq ro'yxati emas.

MiRNA profilining boshqa usullari bilan taqqoslash

MiRNA-seq-ni miRNA profilining boshqa usullariga nisbatan zararli tomonlari shundaki, u qimmatroq, odatda umumiy RNKning ko'proq miqdorini talab qiladi, keng amplifikatsiyani o'z ichiga oladi va mikroarray va qPCR usullariga qaraganda ancha vaqt talab etadi.[3] Shuningdek, miRNA-seq kutubxonasini tayyorlash usullari miRNA komplementining muntazam ravishda imtiyozli ko'rinishiga ega bo'lib tuyuladi va bu miRNA ko'pligini aniq aniqlashga to'sqinlik qiladi.[64] Shu bilan birga, yondashuv mustaqil hibridizatsiya hisoblanadi va shuning uchun uni talab qilmaydi apriori ketma-ketlik haqida ma'lumot. Shu sababli, yangi miRNA va miRNA izoformalari (izoMirs) ketma-ketligini olish, ketma-ket o'xshash miRNKlarni ajratish va nuqta mutatsiyalarini aniqlash mumkin.[65]

MiRNA profilining platformadagi taqqoslanishi

[3]

Jadval 2: miRNA profilining platformadagi taqqoslanishi
qPCRMikroarrayTartiblash
Ishlash vaqti~ 6 soat~ 2 kun1-2 hafta
Jami RNK talab qilinadi500 ng100-1000 ng500-5000 ng
Dinamik diapazon aniqlandiOltita kattalik buyrug'iTo'rt darajaBesh yoki undan ortiq buyurtma kattaligi
Infratuzilma va texnik talablarKamO'rtachaMuhim
Namuna narxi (USD)$400$250–$350$500–$700

Adabiyotlar

  1. ^ a b Farazi, Taliya A; Spitser, Jessika I; Morozov, Pavel; Tushl, Tomas (2011). "odam saratonida miRNAlar". Patologiya jurnali. 223 (2): 102–115. doi:10.1002 / yo'l.2806. ISSN  0022-3417. PMC  3069496. PMID  21125669.
  2. ^ Sandhu, S .; Garzon, R. (2011). "MikroRNKlarning saraton diagnostikasi, prognozi va davolashda potentsial qo'llanilishi". Semin Onkol. 38 (6): 781–787. doi:10.1053 / j.seminoncol.2011.08.007. PMID  22082764.
  3. ^ a b v Beyker, Monya (2010). "MicroRNA profillash: signalni shovqindan ajratish". Tabiat usullari. 7 (9): 687–692. doi:10.1038 / nmeth0910-687. ISSN  1548-7091. PMID  20805796. S2CID  6853222.
  4. ^ Kim, V. Narri; Xan, Jinju; Siomi, Mikiko C. (2009). "Hayvonlardagi kichik RNKlarning biogenezi". Molekulyar hujayra biologiyasi. 10 (2): 126–139. doi:10.1038 / nrm2632. ISSN  1471-0072. PMID  19165215. S2CID  8360619.
  5. ^ Bartel, D (2004). "MicroRNAsGenomics, Biogenesis, Mexanizm va funktsiya". Hujayra. 116 (2): 281–297. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00045-5. ISSN  0092-8674. PMID  14744438. S2CID  2669459.
  6. ^ a b v U, Lin; Hannon, Gregori J. (2004). "MicroRNAs: genlarni boshqarishda katta rol o'ynaydigan kichik RNKlar". Genetika haqidagi sharhlar. 5 (7): 522–531. doi:10.1038 / nrg1379. ISSN  1471-0056. PMID  15211354. S2CID  86602746.
  7. ^ Ambros, Viktor (1989). "Regulyativ genlar ierarxiyasi C. elegans-da lichinkadan kattalarga rivojlanish o'zgarishini boshqaradi". Hujayra. 57 (1): 49–57. doi:10.1016/0092-8674(89)90171-2. ISSN  0092-8674. PMID  2702689. S2CID  13103224.
  8. ^ Li, Rozalind S.; Faynbaum, Rhonda L.; Ambros, Viktor (1993). "C. elegans heterochronic gen-4 geni 14-ga antisens komplementarligi bilan kichik RNKlarni kodlaydi". Hujayra. 75 (5): 843–854. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90529-Y. ISSN  0092-8674. PMID  8252621.
  9. ^ Uaytmen, Bryus; Xa, Ilho; Ruvkun, Gari (1993). "Lin-4 tomonidan geteroxronik genning posttranskripsiyaviy regulyatsiyasi C. elegans-da vaqtinchalik shakllanishni vositachilik qiladi".. Hujayra. 75 (5): 855–862. doi:10.1016/0092-8674(93)90530-4. ISSN  0092-8674. PMID  8252622.
  10. ^ Chen, C.-Z. (2004). "MicroRNAs gemotopoetik naslning farqlanishini modulyatsiya qiladi" (PDF). Ilm-fan. 303 (5654): 83–86. Bibcode:2004Sci ... 303 ... 83C. doi:10.1126 / science.1091903. hdl:1721.1/7483. ISSN  0036-8075. PMID  14657504. S2CID  7044929.
  11. ^ Xu, Peizhang; Vernoy, Stefani Y.; Guo, Ming; Hay, Bryus A. (2003). "Drosophila MicroRNA Mir-14 hujayra o'limini bostiradi va normal yog 'almashinuvi uchun zarur" (PDF). Hozirgi biologiya. 13 (9): 790–795. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00250-1. ISSN  0960-9822. PMID  12725740. S2CID  6391484.
  12. ^ Johnston, Robert J.; Hobert, Oliver (2003). "Caenorhabditis elegansida chap / o'ng neyronal assimetriyani boshqaruvchi mikroRNK". Tabiat. 426 (6968): 845–849. Bibcode:2003 yil natur.426..845J. doi:10.1038 / tabiat02255. ISSN  0028-0836. PMID  14685240. S2CID  4410288.
  13. ^ Lee, R. C. (2001). "Caenorhabditis elegansidagi kichik RNKlarning keng klassi". Ilm-fan. 294 (5543): 862–864. Bibcode:2001 yil ... 294..862L. doi:10.1126 / science.1065329. ISSN  0036-8075. PMID  11679672. S2CID  33480585.
  14. ^ Aldrij, Sara; Hadfild, Jeyms (2012). MiRNA profillash texnologiyalari va platformalararo taqqoslash bilan tanishish. Molekulyar biologiya usullari. 822. Keyingi avlod MicroRNA ifodasini profillashtirish texnologiyasi. 19-31 betlar. doi:10.1007/978-1-61779-427-8_2. ISBN  978-1-61779-426-1. ISSN  1064-3745. PMID  22144189.
  15. ^ Lu, C; Tej, SS; Luo, S; Haudenschild, CD; Meyers, miloddan avvalgi; Green, PJ (2005 yil 2-sentabr). "Transkriptomning kichik RNK komponentini yoritib berish". Ilm-fan. 309 (5740): 1567–9. Bibcode:2005 yil ... 309.1567L. doi:10.1126 / science.1114112. PMID  16141074. S2CID  1651848.
  16. ^ Rubi, J. Grem; Jan, Kalvin; Aktyor, Kristofer; Axtell, Maykl J.; Li, Uilyam; Nusbaum, Chad; Ge, Hui; Bartel, Devid P. (2006). "Keng ko'lamli ketma-ketlik 21U-RNK va C. elegansdagi qo'shimcha mikroRNKlar va endogen siRNKalarni ochib beradi". Hujayra. 127 (6): 1193–1207. doi:10.1016 / j.cell.2006.10.040. ISSN  0092-8674. PMID  17174894. S2CID  16838469.
  17. ^ Vitten, Daniela; Tibshirani, Robert; Gu, Sem; Yong'in, Endryu; Lui, Veng-Onn (2010). "Bachadon bo'yni o'smalari va mos keladigan boshqaruv elementlari to'plamida ultra yuqori o'tkazuvchanlikni ketma-ketligiga asoslangan kichik RNK kashfiyoti va alohida statistik biomarker tahlillari". BMC biologiyasi. 8 (1): 58. doi:10.1186/1741-7007-8-58. ISSN  1741-7007. PMC  2880020. PMID  20459774.
  18. ^ Vu, Qian; Lu, Zuhong; Li, salomlashish; Lu, Jiafeng; Guo, Li; Ge, Qinyu (2011). "Ko'krak bezi saratonini aniqlash uchun MicroRNA-larning navbatdagi navbati". Biomeditsina va biotexnologiya jurnali. 2011: 1–7. doi:10.1155/2011/597145. ISSN  1110-7243. PMC  3118289. PMID  21716661.
  19. ^ a b v d Lu, C; Meyers, miloddan avvalgi; Green, PJ (oktyabr 2007). "Chuqur sekvensiya uchun kichik RNK cDNA kutubxonalarini qurish". Usullari. 43 (2): 110–7. doi:10.1016 / j.ymeth.2007.05.002. PMID  17889797.
  20. ^ a b v d e Xafner, Markus; Landgraf, Pablo; Lyudvig, Yanos; Rays, Amanda; Ojo, Tolulope; Lin, Karolina; Xoloch, Doniyor; Lim, Sindi; Tushl, Tomas (2008). "CDNA kutubxonasi ketma-ketligi yordamida mikroRNKlarni va boshqa kichik tartibga soluvchi RNKlarni aniqlash". Usullari. 44 (1): 3–12. doi:10.1016 / j.ymeth.2007.09.009. ISSN  1046-2023. PMC  2847350. PMID  18158127.
  21. ^ a b Shendure, Jey; Dji, Xanli (2008). "Keyingi avlod DNK sekvensiyasi". Tabiat biotexnologiyasi. 26 (10): 1135–1145. doi:10.1038 / nbt1486. ISSN  1087-0156. PMID  18846087. S2CID  6384349.
  22. ^ "Arxivlangan nusxa". Arxivlandi asl nusxasi 2011-05-26. Olingan 2012-03-01.CS1 maint: nom sifatida arxivlangan nusxa (havola)
  23. ^ http://www.illumina.com/pages.ilmn?ID=204
  24. ^ "Arxivlangan nusxa". Arxivlandi asl nusxasi 2008-05-16. Olingan 2008-05-16.CS1 maint: nom sifatida arxivlangan nusxa (havola)
  25. ^ a b Morin, R. D .; O'Konnor, M. D .; Griffit, M.; Kuchenbauer, F.; Delani, A .; Prabxu, A.-L .; Chjao, Y .; Makdonald, X.; Zeng, T .; Xirst, M.; Eaves, C. J .; Marra, M. A. (2008). "Insonning embrional ildiz hujayralarida mikroRNK profillashi va kashfiyotiga massiv parallel ketma-ketlikni qo'llash". Genom tadqiqotlari. 18 (4): 610–621. doi:10.1101 / gr.7179508. ISSN  1088-9051. PMC  2279248. PMID  18285502.
  26. ^ Berninger, Filipp; Gaidatzis, Dimos; van Nimvegen, Erik; Zavolan, Mixaela (2008). "Kichik RNK klonlash ma'lumotlarini hisoblash tahlili". Usullari. 44 (1): 13–21. doi:10.1016 / j.ymeth.2007.10.002. ISSN  1046-2023. PMID  18158128.
  27. ^ a b Kreyton, C. J .; Reid, J. G.; Gunaratne, P. H. (2009). "MikroRNKlarni chuqur sekvensiya yordamida ifodalash profilingi". Bioinformatika bo'yicha brifinglar. 10 (5): 490–497. doi:10.1093 / bib / bbp019. ISSN  1467-5463. PMC  2733187. PMID  19332473.
  28. ^ Kozomara, A .; Griffits-Jons, S. (2010). "miRBase: microRNA annotatsiyasi va chuqur ketma-ketlik ma'lumotlarini birlashtirish". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 39 (Ma'lumotlar bazasi): D152-D157. doi:10.1093 / nar / gkq1027. ISSN  0305-1048. PMC  3013655. PMID  21037258.
  29. ^ Xofaker, I. L .; Fontana, V.; Stadler, P. F.; Bonxeffer, L. S .; Taker, M.; Schuster, P. (1994). "RNK ikkilamchi tuzilmalarini tez katlama va taqqoslash". Monatshefte für Chemie. 125 (2): 167–188. doi:10.1007 / BF00818163. ISSN  0026-9247. S2CID  19344304.
  30. ^ Yang X.; Li, L. (2011). "miRDeep-P: o'simliklarda mikroRNA transkriptomini tahlil qilish uchun hisoblash vositasi". Bioinformatika. 27 (18): 2614–5. doi:10.1093 / bioinformatika / btr430. ISSN  1367-4803. PMID  21775303.
  31. ^ Klunan, Nikol; Vani, Shivangi; Xu, Qinying; Gu, Tszian; Lea, Kristi; Isitgich, Sheila; Barbacioru, Katalin; Stepto, Anita L; Martin, Xilari S; Nurbaxsh, Ehsan; Krishnan, Keertana; Gardiner, Bruk; Vang, Xiaohui; Nons, Katiya; Stin, Jeyson A; Matigan, Nik; Vud, Devid L; Kassaxn, Karin S; Vaddell, Nic; Cho'pon, Jil; Li, Klarens; Ichikava, Jef; MakKernan, Kevin; Bramlett, Kelli; Kuersten, Skott; Grimmond, Shon M (2011). "MicroRNAs va ularning izomiRlari umumiy biologik yo'llarni nishonga olish uchun birgalikda ishlaydi". Genom biologiyasi. 12 (12): R126. doi:10.1186 / gb-2011-12-12-r126. ISSN  1465-6906. PMC  3334621. PMID  22208850.
  32. ^ Miranda KC, Huynh T, Tay Y, Ang YS, Tam WL, Tomson AM, Lim B, Rigoutsos I (2006). "MicroRNA ulanish joylari va ularga mos keladigan heteroduplekslarni aniqlash uchun naqshga asoslangan usul". Hujayra. 126 (6): 1203–17. doi:10.1016 / j.cell.2006.07.031. PMID  16990141. S2CID  12749133.
  33. ^ Lyuis, BP; Burge CB; Bartel DP (2005 yil 14-yanvar). "Odatda adenozinlar bilan yonma-yon turadigan urug'larni bir-biriga bog'lab qo'yish, odamlarning minglab genlari mikroRNK nishonlari ekanligidan dalolat beradi". Hujayra. 120 (1): 15–20. doi:10.1016 / j.cell.2004.12.035. PMID  15652477. S2CID  17316349.
  34. ^ Grimson, A; Farx, KK; Johnston, WK; Garret-Engele, P; Lim, LP; Bartel, DP (6 Jul, 2007). "Sutemizuvchilarning o'ziga xos xususiyatiga ega bo'lgan MicroRNA: urug'larni juftlashtirishdan tashqari determinantlar". Molekulyar hujayra. 27 (1): 91–105. doi:10.1016 / j.molcel.2007.06.017. PMC  3800283. PMID  17612493.
  35. ^ Fridman, RC; Farx, KK; Burge, CB; Bartel, DP (yanvar, 2009 yil). "Ko'pgina sutemizuvchilar mRNKlari mikroRNKlarning saqlanib qolgan maqsadlari". Genom tadqiqotlari. 19 (1): 92–105. doi:10.1101 / gr.082701.108. PMC  2612969. PMID  18955434.
  36. ^ Garsiya, DM; Baek, D; Shin, C; Bell, GW; Grimson, A; Bartel, DP (2011 yil 11 sentyabr). "Urug'larni juftlashtirishning zaif barqarorligi va mo'ljaldagi mo'l-ko'llik lsy-6 va boshqa mikroRNKlarning malakasini pasaytiradi". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 18 (10): 1139–46. doi:10.1038 / nsmb.2115. PMC  3190056. PMID  21909094.
  37. ^ Agarval, Vikram; Bell, Jorj V.; Nam, Jin-Vu; Bartel, Devid P. (2015-08-12). "Sutemizuvchilar mRNKlarida samarali mikroRNK nishon joylarini bashorat qilish". eLife. 4: e05005. doi:10.7554 / eLife.05005. ISSN  2050-084X. PMC  4532895. PMID  26267216.
  38. ^ Agarval, V; Subtelny, AO; Thiru, P; Ulitskiy, men; Bartel, DP (4 oktyabr 2018). "Drozofilada mikroRNKning samaradorligini taxmin qilish". Genom biologiyasi. 19 (1): 152. doi:10.1186 / s13059-018-1504-3. PMC  6172730. PMID  30286781.
  39. ^ Mazier, P; Enright, A (2007). "MikroRNK maqsadlarini bashorat qilish". Bugungi kunda giyohvand moddalarni kashf etish. 12 (11–12): 452–458. doi:10.1016 / j.drudis.2007.04.002. ISSN  1359-6446. PMID  17532529.
  40. ^ Krek, A. MikroRNK maqsadlarini aniqlash. DAI-B 70/07, (2010).
  41. ^ Nemis MA, Pillay M, Jeong DH, Hetawal A, Luo S, Janardhanan P, Kannan V, Rymarquis LA, Nobuta K, German R, De Paoli E, Lu C, Schroth G, Meyers BC, Green PJ (2008). "RNK uchlarini parallel tahlil qilish orqali mikroRNK-maqsadli RNK juftlarini global identifikatsiyasi". Nat. Biotexnol. 26 (8): 941–946. doi:10.1038 / nbt1417. PMID  18542052. S2CID  13187064.
  42. ^ Addo-Quaye C, Eshoo TW, Bartel DP, Axtell MJ (2008). "Arabidopsis degradomining ketma-ketligi bilan aniqlangan endogen siRNA va miRNA maqsadlari". Curr. Biol. 18 (10): 758–762. doi:10.1016 / j.cub.2008.04.042. PMC  2583427. PMID  18472421.
  43. ^ Buermans, Xenk PJ; Ariyurek, Yavuz; van Ommen, Gertjan; den Dunnen, Yoxan T; Hoen, Piter AC (2010). "Keyingi avlod ketma-ketligini mikroRNK ekspresiyasini profillashtirishning yangi usullari". BMC Genomics. 11 (1): 716. doi:10.1186/1471-2164-11-716. ISSN  1471-2164. PMC  3022920. PMID  21171994.
  44. ^ Chjan, Baoxon; Chjan, Xua; Yang, Tszian-Xua; Chjen, Yu-Sheng; Chjan, Peng; Chen, Xiao; Vu, iyun; Xu, Ling; Luo, Xue-Tsun; Ke, Chji-Yong; Chjou, Xuy; Qu, Liang-Xu; Chen, Yue-Qin (2009). "Keng sekvensiya yondashuvi asosida insonning o'tkir limfoblastik leykemiyasida kichik RNK va yangi mikro-RNK kashfiyotlarining genom-keng tahlili". PLOS ONE. 4 (9): e6849. Bibcode:2009PLoSO ... 4.6849Z. doi:10.1371 / journal.pone.0006849. ISSN  1932-6203. PMC  2731166. PMID  19724645.
  45. ^ a b Jima, D. D.; Chjan, J .; Jeykobs, C .; Richards, K. L .; Dunfi, C. X.; Choi, V. V. L.; Yan Au, V.; Srivastava, G.; Czader, M. B .; Rizzieri, D. A .; Lagoo, A. S .; Lugar, P. L .; Mann, K. P.; Gullar, C. R .; Bernal-Mizrachi, L.; Naresh, K. N .; Evens, A. M .; Gordon, L. I .; Luftig, M .; Fridman, D. R .; Vaynberg, J. B .; Tompson, M. A .; Gill, J. I .; Liu, Q .; Qanday qilib, T .; Grubor, V .; Gao, Y .; Patel, A .; Vu, H.; Chju, J .; Blobe, G. C .; Lipskiy, P. E.; Chadbern, A .; Deyv, S. S. (2010). "Oddiy va zararli B hujayralarining kichik RNK transkriptomini chuqur ketma-ketligi yuzlab yangi mikroRNKlarni aniqlaydi". Qon. 116 (23): e118-e127. doi:10.1182 / qon-2010-05-285403. ISSN  0006-4971. PMC  3012600. PMID  20733160.
  46. ^ Starchinowski, D. T.; Morin, R .; McPherson, A .; Lam, J .; Chari, R .; Wegrzyn, J .; Kuchenbauer, F.; Xirst, M.; Toxima, K .; Hamfris, R. K .; Lam, V. L.; Marra, M.; Karsan, A. (2010). "Leykemiya bilan bog'liq genomik o'zgarishlarda joylashgan odam mikroRNKlarini genom bo'yicha aniqlash". Qon. 117 (2): 595–607. doi:10.1182 / qon-2010-03-277012. ISSN  0006-4971. PMID  20962326.
  47. ^ Keller, Andreas; Backes, Kristina; Leydinger, Petra; Kefer, Natali; Boysgerin, Valeska; Barbacioru, Katalin; Vogel, Britta; Matzas, Mark; Xuver, Xanno; Katus, Gyugo A.; Styler, Kord; Meder, Benjamin; Meese, Ekart (2011). "Keyingi avlod ketma-ketligi o'pka saratoni bilan kasallangan bemorlarning periferik qonidagi yangi mikroRNKlarni aniqlaydi". Molekulyar biosistemalar. 7 (12): 3187–99. doi:10.1039 / c1mb05353a. ISSN  1742-206X. PMID  22027949.
  48. ^ a b v Chan, Elsi; Prado, Daniel Estéves; Weidhaas, Joanne Barnes (2011). "Saraton mikroRNKlari: pastki turini profillashdan terapiya reaktsiyasini bashorat qilishgacha". Molekulyar tibbiyot tendentsiyalari. 17 (5): 235–243. doi:10.1016 / j.molmed.2011.01.008. ISSN  1471-4914. PMC  3092835. PMID  21354374.
  49. ^ a b Blenkiron, Cheri; Goldstein, Leonard D; Torn, Natali P; Spiteri, Inmakulada; Chin, Suet-Feun; Dunning, Mark J; Barbosa-Morais, Nuno L; Teschendorff, Endryu E; Yashil, Endryu R; Ellis, Yan O; Tavaré, Simon; Kaldas, Karlos; Miska, Erik A (2007). "Odamning ko'krak bezi saratonining mikroRNK ekspression profilingi o'smaning pastki turining yangi belgilarini aniqlaydi". Genom biologiyasi. 8 (10): R214. doi:10.1186 / gb-2007-8-10-r214. ISSN  1465-6906. PMC  2246288. PMID  17922911.
  50. ^ Sempere, L. F .; Kristensen, M .; Silaxatoglu, A .; Bak, M.; Xit, C. V .; Shvarts, G.; Uells, V.; Kauppinen, S .; Cole, C. N. (2007). "Ko'krak bezi saratonida epiteliya hujayralarining o'ziga xos subpopulyatsiyalari bilan chegaralangan mikroRNKning o'zgarishi". Saraton kasalligini o'rganish. 67 (24): 11612–11620. doi:10.1158 / 0008-5472. CAN-07-5019. ISSN  0008-5472. PMID  18089790.
  51. ^ Matti, Maykl D; Benz, Kristofer S; Bowers, Jessica; Sensinger, Kelli; Vong, Linda; Skott, Gari K; Fedele, Vita; Ginzinger, Devid; Gets, Robert; Haqq, Kris (2006). "Optimallashtirilgan yuqori o'tkazuvchan mikroRNK ekspresiyasi profilaktikasi prostata va ko'krak bezi saratoni biopsiyalarining yangi biomarker bahosini beradi". Molekulyar saraton. 5 (1): 24. doi:10.1186/1476-4598-5-24. ISSN  1476-4598. PMC  1563474. PMID  16784538.
  52. ^ a b Iorio, M. V .; Ferracin, M.; Liu, C.-G.; Veronese, A .; Spizzo, R .; Sabbioni, S .; Magri, E .; Pedriali, M .; Fabbri, M .; Kempiglio, M .; Menard, S .; Palazzo, J. P .; Rozenberg, A .; Musiani, P .; Voliniya, S .; Nensi, I .; Kalin, G. A .; Querzoli, P .; Negrini, M .; Croce, C. M. (2005). "Odamning ko'krak bezi saratonida MicroRNA gen ekspressionini tartibga solish". Saraton kasalligini o'rganish. 65 (16): 7065–7070. doi:10.1158 / 0008-5472. CAN-05-1783. ISSN  0008-5472. PMID  16103053.
  53. ^ a b Loweri, Aoife J; Miller, Nikola; Devani, Amanda; Makneyl, Ruzin E; Davoren, Pamela A; Lemetr, Kristof; Benes, Vladimir; Shmidt, Sabin; Bleyk, Jonaton; To'p, Grem; Kerin, Maykl J (2009). "MicroRNA imzolari ko'krak bezi saratonida estrogen retseptorlari, progesteron retseptorlari va HER2 / neu retseptorlari holatini taxmin qiladi". Ko'krak bezi saratonini o'rganish. 11 (3): R27. doi:10.1186 / bcr2257. ISSN  1465-5411. PMC  2716495. PMID  19432961.
  54. ^ Livan, D .; Benjamin, X.; Gilad, S .; Ezagouri, M .; Dov, A .; Ashkenazi, K .; Gefen, N .; Izraeli, S .; Rechavi, G .; Pass, H.; Nonaka, D .; Li, J .; Spektor, Y .; Rozenfeld, N .; Chajut, A .; Koen, D .; Aharonov, R .; Mansuxani, M. (2009). "Hsa-miR-205 ifodasi asosida diagnostik tahlil skuamozni noaniq kam bo'lmagan kichik hujayrali o'pka karsinomasidan ajratib turadi". Klinik onkologiya jurnali. 27 (12): 2030–2037. doi:10.1200 / JCO.2008.19.4134. ISSN  0732-183X. PMID  19273703.
  55. ^ Ueda, Tetsuya; Voliniya, Stefano; Okumura, Xirosi; Shimizu, Masayoshi; Tachioli, Kristian; Rossi, Simona; Alder, Xansyuerg; Lyu, Chang-gong; Oue, Naohid; Yasui, Vataru; Yoshida, Kazuxiro; Sasaki, Xiroki; Nomura, Sachiyo; Seto, Yasuyuki; Kaminishi, Michio; Kalin, Jorj A; Croce, Carlo M (2010). "MikroRNK ekspressioni va oshqozon saratoni progressiyasi va prognozi o'rtasidagi bog'liqlik: mikroRNK ekspression tahlili". Lanset onkologiyasi. 11 (2): 136–146. doi:10.1016 / S1470-2045 (09) 70343-2. ISSN  1470-2045. PMC  4299826. PMID  20022810.
  56. ^ Ratner, Elena S.; Tuck, David; Rixter, Kristin; Nallur, Sunita; Patel, Rajeshvari M.; Shultz, Vins; Xui, Pei; Shvarts, Piter E.; Rezerford, Tomas J.; Weidhaas, Joanne B. (2010). "MicroRNA imzolari bachadon saratoni o'simtasining pastki turlarini ajratib turadi". Ginekologik onkologiya. 118 (3): 251–257. doi:10.1016 / j.ygyno.2010.05.010. ISSN  0090-8258. PMC  2918705. PMID  20542546.
  57. ^ a b Fridman, Eddi; Dotan, Zoxar; Barshak, Iris; Devid, Miriyam Ben; Dov, Avital; Tabak, Sarit; Sion, Orit; Benjamin, Sima; Benjamin, Xila; Kuker, Xagit; Avivi, Kamila; Rozenblatt, Kinneret; Polak-Charcon, Silvi; Ramon, Yoqub; Rozenfeld, Nitsan; Spector, Yael (2010). "MicroRNA ekspressioni yordamida buyrak o'smalarining aniq molekulyar tasnifi". Molekulyar diagnostika jurnali. 12 (5): 687–696. doi:10.2353 / jmoldx.2010.090187. ISSN  1525-1578. PMC  2928434. PMID  20595629.
  58. ^ a b v Gutierrez, N C; Sarasquete, M E; Misevich-Krzeminska, men; Delgado, M; De Las Rivas, J; Ticona, F V; Ferminan, E; Martin-Ximenes, P; Chillon, C; Risueño, A; Ernandes, J M; Garsiya-Sanz, R; Gonsales, M; San-Migel, J F (2010). "Multipl miyelomning turli xil genetik subtiplarida mikroRNK ekspresiyasining regulyatsiyasi va genlarning ekspression profilatsiyasi bilan o'zaro bog'liqlik". Leykemiya. 24 (3): 629–637. doi:10.1038 / leu.2009.274. ISSN  0887-6924. PMID  20054351.
  59. ^ a b v d Yongen-Lavrencich, M.; Quyosh, S. M .; Dijkstra, M. K .; Valk, P. J. M.; Lowenberg, B. (2008). "O'tkir miyeloid leykemiyaning genetik heterojenligi bilan bog'liq ravishda mikro-RNK ekspressioni". Qon. 111 (10): 5078–5085. doi:10.1182 / qon-2008-01-133355. ISSN  0006-4971. PMID  18337557.
  60. ^ a b Garzon, R .; Garofalo, M .; Martelli, M. P.; Brizevits, R .; Vang, L .; Fernandez-Saymering, S.; Voliniya, S .; Liu, C.-G.; Shnittger, S .; Xaferlax, T .; Liso, A .; Diverio, D.; Manchini, M .; Meloni G.; Foa, R .; Martelli, M. F.; Mecucci, C .; Croce, C. M .; Falini, B. (2008). "Sitoplazmatik mutatsiyaga uchragan nukleofosminni o'z ichiga olgan o'tkir miyeloid leykemiyaning o'ziga xos mikroRNK imzosi". Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 105 (10): 3945–3950. Bibcode:2008 yil PNAS..105.3945G. doi:10.1073 / pnas.0800135105. ISSN  0027-8424. PMC  2268779. PMID  18308931.
  61. ^ Marcucci, Gido; Radmaxer, Maykl D. Maharri, Kati; Mrozek, Kshishtof; Ruppert, Emi S.; Paschka, Piter; Vukosavlyevich, Tamara; Uitman, Syuzan P.; Baldus, Klaudiya D.; Langer, nasroniy; Lyu, Chang-Gong; Kerol, Endryu J.; Pauell, Bayard L.; Garzon, Ramiro; Kros, Karlo M.; Kolits, Jonathan E.; Kaligiuri, Maykl A .; Larson, Richard A.; Bloomfild, Klara D. (2008). "Sitogenetik jihatdan normal o'tkir Miyeloid leykemiyada mikroRNK ifodasi". Nyu-England tibbiyot jurnali. 358 (18): 1919–1928. doi:10.1056 / NEJMoa074256. ISSN  0028-4793. PMID  18450603.
  62. ^ Kalin, Jorj Adrian; Ferracin, Manuela; Cimmino, Ameliya; Di Leva, Gianpiero; Shimizu, Masayoshi; Voychik, Silviya E.; Iorio, Marilena V.; Visone, Roza; Sever, Nurettin Ilfer; Fabbri, Myuller; Juliano, Rodolfo; Palumbo, Tiziana; Pichiorri, Flaviya; Roldo, Klaudiya; Garzon, Ramiro; Sevignani, Cinzia; Rassenti, Laura; Alder, Xansyuerg; Voliniya, Stefano; Lyu, Chang-gong; Kipps, Tomas J.; Negrini, Massimo; Croce, Carlo M. (2005). "Surunkali limfotsitik leykemiyada prognoz va progressiya bilan bog'liq bo'lgan MicroRNA imzosi". Nyu-England tibbiyot jurnali. 353 (17): 1793–1801. doi:10.1056 / NEJMoa050995. ISSN  0028-4793. PMID  16251535.
  63. ^ Karamuta, Stefano; Egyhazi, Suzanna; Rodolfo, Monika; Vitten, Daniela; Xansson, Yoxan; Larsson, Katarina; Lui, Veng-Onn (2010). "Xavfli melanomada mutatsion holat va omon qolish bilan bog'liq bo'lgan MicroRNA ifodalari". Tergov dermatologiyasi jurnali. 130 (8): 2062–2070. doi:10.1038 / jid.2010.63. ISSN  0022-202X. PMID  20357817.
  64. ^ Linsen, Sem E V; de Wit, Elzo; Yanssen, Jorj; Isitgich, Sheila; Chapman, Laura; Parkin, Rachael K; Fritz, Brayan; Vayman, Stacia K; de Bryuyn, Evart; Voest, Emil E; Kuersten, Skott; Tewari, Muneesh; Kuppen, Edvin (2009). "Kichik RNK raqamli gen ekspression profilining cheklashlari va imkoniyatlari". Tabiat usullari. 6 (7): 474–476. doi:10.1038 / nmeth0709-474. ISSN  1548-7091. PMID  19564845. S2CID  7953265.
  65. ^ Git, A .; Dvinge, X.; Salmon-Divon, M.; Osborne, M .; Kutter, C .; Hadfild, J .; Bertone, P .; Caldas, C. (2010). "Mikroarray profillashni, real vaqtda PCR va differentsial mikroRNK ekspresiyasini o'lchash uchun keyingi avlod ketma-ketligini texnologiyasini muntazam taqqoslash". RNK. 16 (5): 991–1006. doi:10.1261 / rna.1947110. ISSN  1355-8382. PMC  2856892. PMID  20360395.