NBPF19 - NBPF19

NBPF19
Identifikatorlar
TaxalluslarNBPF19, NBPF a'zosi 19
Tashqi identifikatorlarOMIM: 614006 HomoloGene: 41035 Generkartalar: NBPF19
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
NBPF19 uchun genomik joylashuv
NBPF19 uchun genomik joylashuv
Band1q21.2Boshlang149,475,338 bp[1]
Oxiri149,556,361 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

101060226

n / a

Ansambl

ENSG00000271383

n / a

UniProt

Q7Z3S9

n / a

RefSeq (mRNA)

NM_001351365

n / a

RefSeq (oqsil)

NP_001350936
NP_001350937

n / a

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 149.48 - 149.56 Mbn / a
PubMed qidirmoq[2]n / a
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash

Neuroblastoma sindirish punkti 19, yoki NBPF19, a oqsil bu ichida odamlar NBPF19 tomonidan kodlangan gen.[3] Ushbu oqsil neyroblastoma sindirish nuqtasi oqsillari oilasiga kiradi.[4]

Gen

NBPF19 geni odamlarda oqsillarni kodlovchi gen hisoblanadi. U barcha intronlar va ekzonslarni o'z ichiga olgan 80,464 bazadan iborat. U 1q21.2 lokusda 1-xromosomaning musbat ipida joylashgan.[5]

NBPF19-ning EST profil ma'lumotlari, to'qima va sog'liq holatini ifodalash ma'lumotlarini ko'rsatadi.[6]

Ifoda

est NBPF19 ning profillanishi uni hamma joyda ko'p miqdordagi inson to'qimalarida beqiyos darajada ifoda etilishini ko'rsatadi. U nisbatan yuqori miqdorlarda ifodalanadi teri, limfoid organlar (limfa tugunlari, taloq ) va jinsiy bezlar (tuxumdon, moyaklar ).[5]

Stenogramma

Odamlarda NBPF19 ning mRNA transkripti 13190 ga teng asoslar uzoq.[7] Ikkita taxmin qilingan muqobil qo'shilish izoformalari mavjud, ammo hech biri eksperimental tarzda kuzatilmagan.[8]

Oqsil

NBPF19 transkriptining oqsilli mahsuloti 3843 aminokislotadan va og'irligi 440,5 kD dan iborat.[8][9] Unda noma'lum funktsiyaga ega bo'lgan 45 ta DUF1220 domeni mavjud, ammo ular evolyutsion o'zgarishlar bilan bog'liq va odamlardan evolyutsion ravishda tobora uzoqlashib borayotgan turlar sonining kamayishi.[10]

NBPF19 oqsilining takrorlanadigan fosforillanish sxemasi.[11]

Tuzilishi

NBPF19-ning translyatsiya qilinganidan so'ng ko'plab modifikatsiyalari kutilmoqda, eng muhimi fosforillanish va sumoylyatsiya. Oqsil serin, treonin va tirozin qoldiqlarida fosforillanadi va chap tomonda ko'rsatilgan rasmda takrorlanadigan shaklda.[11] Proteinlar ketma-ketligi ichida sumolyatsiya joylari bo'lishi mumkin bo'lgan 14 ta takrorlanadigan takrorlanish mavjud.[12]

NBPF19 ning uchinchi tuzilishi taxminan 50% o'ralgan spiral va 40% bo'lishi taxmin qilinmoqda. alfa spiral.[13] Signal peptidi yoki transmembran domenlari mavjud emas.[14] NBPF19 ehtimol mahalliylashtirilgan bo'lishi mumkin yadro uning 5 'terminali yaqinida yadro lokalizatsiya signalining mavjudligi sababli.[15]

Gomologiya

NBPF19 - bu odamlarda oqsillarning neyroblastoma sindirish punktining aniqlangan 26 a'zosidan biri. Ushbu oqsillarning ketma-ket o'xshashligi asosan DUF1220 domenlarini saqlash bilan cheklanadi.[8] Bir-biriga juda o'xshash paraloglar quyida keltirilgan:

Tanlangan NBPF19 Paraloglari
Gen nomiKirish raqamiUzunlik (aa)Ketma-ket identifikatsiya
NBPF14NP_056198.2281996%
NBPF20NP_001265196520793%
NBPF10CAM23768461293%
NBPF12NP_001265070.1145792%
NBPF1NP_060410.2121491%
NBPF26NP_001338301.1136675%

NBPF19 odamlardan tashqarida yaxshi saqlanmaydi va har qanday sezilarli konservatsiya o'tgan primatlar va sutemizuvchilarga ta'sir qilmaydi.[16] Tanlangan turlar o'xshashlikning qisqa ketma-ketliklariga ega va quyida keltirilgan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000271383 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  3. ^ "Entrez Gen: NBPF a'zosi 19". Olingan 2018-05-04.
  4. ^ Vandepoele K, Van Roy N, Stes K, Speleman F, van Roy F (2005 yil noyabr). "NBPF yangi genlar oilasi: primat evolyutsiyasi paytida genlarning takrorlanishi natijasida hosil bo'lgan murakkab tuzilish". Molekulyar biologiya va evolyutsiya. 22 (11): 2265–74. doi:10.1093 / molbev / msi222. PMID  16079250.
  5. ^ a b "NBPF19 NBPF a'zosi 19 [Homo sapiens (odam)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2018-05-05.
  6. ^ "Uy - UniGene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2018-05-05.
  7. ^ "Homo sapiens NBPF a'zosi 19 (NBPF19), mRNA - Nukleotid - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2018-05-05.
  8. ^ a b v "neyroblastoma sindirish nuqtasi oila a'zosi 19 [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2018-05-05.
  9. ^ EMBL-EBI. "SAPS natijalari". www.ebi.ac.uk. Olingan 2018-05-05.
  10. ^ O'Bleness MS, Dikkens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Vaykoff GJ, Sikela JM (sentyabr 2012). "DUF1220 oqsil domenlarining evolyutsion tarixi va genom tashkiloti". G3. 2 (9): 977–86. doi:10.1534 / g3.112.003061. PMC  3429928. PMID  22973535.
  11. ^ a b "NetPhos 3.1 Server". www.cbs.dtu.dk. Olingan 2018-05-05.
  12. ^ "SUMOplot ™ tahlil dasturi | Abgent". www.abgent.com. Olingan 2018-05-05.
  13. ^ "Proteinning ikkilamchi tuzilishini taxmin qilish serveri". crdd.osdd.net. Olingan 2018-05-05.
  14. ^ "Fobiya". phobius.sbc.su.se. Olingan 2018-05-05.
  15. ^ "NLS xaritasi". nls-mapper.iab.keio.ac.jp. Olingan 2018-05-05.
  16. ^ "BLAST: Mahalliy tekislash bo'yicha asosiy qidiruv vositasi". blast.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2018-05-06.

Qo'shimcha o'qish