SLX4IP - SLX4IP

SLX4IP
Identifikatorlar
TaxalluslarSLX4IP, C20orf94, bA204H22.1, bA254M13.1, dJ1099D15.3, SLX4 o'zaro ta'sir oqsili
Tashqi identifikatorlarOMIM: 615958 MGI: 1921493 HomoloGene: 49913 Generkartalar: SLX4IP
Gen joylashuvi (odam)
20-xromosoma (odam)
Chr.20-xromosoma (odam)[1]
20-xromosoma (odam)
SLX4IP uchun genomik joylashuv
SLX4IP uchun genomik joylashuv
Band20p12.2Boshlang10,435,303 bp[1]
Oxiri10,636,829 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

128710

74243

Ansambl

ENSG00000149346

ENSMUSG00000027281

UniProt

Q5VYV7

Q9D7Y9

RefSeq (mRNA)

NM_001009608

RefSeq (oqsil)

NP_001009608

Joylashuv (UCSC)Chr 20: 10.44 - 10.64 MbChr 2: 136.89 - 137.07 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

SLX4 o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil a oqsil odamlarda SLX4IP tomonidan kodlangan gen.[5]

Funktsiya

SLX4 o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil (SLX4IP) a da mavjud monomerik shaklini hosil qiladi va bilan o'zaro ta'sir qiladi SLX4 -XPF -ERCC1 a ni yig'ish uchun javob beradigan multiprotein kompleksi Holliday birlashmasining rezolyutsiyasi DNKni tiklash va parvarish qilish rolida.[6]

SLX4IP ning to'g'ridan-to'g'ri o'zaro ta'sir ko'rsatishi ko'rsatilgan N-terminal oxiri SLX4 bir nechta DNK tuzilishiga xos bo'lgan endonukleazlarni muvofiqlashtirishda rol o'ynaydigan oqsil.[7]

SLX4IP-ning alternativ uzunlikni nazorat qilishda ishtirok etishi ham isbotlangan telomerlar, uning to'planishi va bilan o'zaro ta'siri orqali SLX4, BLM va XPF oqsillar.[8]

Joylashuvi va ifodasi

SLX4IP geni (p) ning qisqa qo'lida joylashgan 20-xromosoma 12.2 pozitsiyasida (20p12.2).[9] Insonning SLX4IP genida 14 ta mavjud exons, cDNA plyus ipiga yo'naltirilgan 204000 tayanch juftligini tashkil etadi.[9] Ushbu molekulyar massasi 45,552 bo'lgan 408 aminokislotadan iborat oqsil uchun kodlar Daltons.[10]

Gomologlar SLX4IP genining odam bo'lmagan turlarida, shu jumladan sichqonlar, kalamushlar, qurbaqalar, tovuqlar, itlar, rezus maymunlari va shimpanzelarda saqlanib qolganligi aniqlandi.[11] Ortologlar inson uchun SLX4IP geni uchun boshqa 283 organizmda ham aniqlangan.[11]

SLX4IP oqsili terida va moyakda eng yuqori darajada, 26 ta boshqa to'qimalarda ifoda etilgan.[12]

Klinik ahamiyati

Saraton

O'tkir limfoblastik leykemiya

SLX4IP ning 5 ’mintaqasini somatik va monoallelli deletsiyalari bolalik bilan kasallanganlarning 30 foizida kuzatilgan. o'tkir limfoblastik leykemiya (ALL) va holatlarda ETV6 /RUNX1 - qayta tashkil etilgan o'tkir limfoblastik leykemiya, 60% dan ortiq hollarda deletsiya aniqlandi.[13] SLX4IP ning to'xtash nuqtalarini tahlil qilib, xarakterli noqonuniy V (D) J vositachilik bilan rekombinatsiya aniqlandi.[13] Ushbu o'chirishlar erkak jinsiga nisbatan sezilarli darajada noaniq ekanligi aniqlandi.[13]

Telomeralarni alternativ ravishda uzaytirish

Saraton hujayralari cheklanishsiz ko'payish qobiliyatini saqlab qolish uchun ular tartibga solinishi mumkin telomerlar sifatida ma'lum bo'lgan jarayon orqali rekombinatsiya orqali ularning xromosomalarini telomerlarning muqobil cho'zilishi (ALT).[14] Ushbu rekombinatsiyaning past darajadagi antagonizatsiyasi tufayli ALT telomerlarida SLX4IP to'planishini talab qilishi ko'rsatilgan. BLM faoliyat.[8] BLM telomerlarning kengaytirilishi uchun javobgardir, chunki u RecQ homologik rekombinatsiya va DNKning replikatsiyasi uchun muhim bo'lgan helikaz.[15]

Interstrand o'zaro bog'lanishini ta'mirlash

DNKda, Interstrand o'zaro bog'lanishlari (ICL) yuqori toksikligi tufayli ta'mirlanishi kerak, ko'pincha bu kabi kasalliklarga olib keladi Fankoni anemiyasi.[16] SLX4IP SLX4 va XPF-ERCC1 komplekslarini bir vaqtning o'zida bog'lab turishi tufayli SLX4-XPF-ERCC1 kompleksining ICL ta'mirlash funktsiyalarida muhim rol o'ynaydi, bu esa kompleksning barqarorligini saqlaydi va SLX4 va XPF-ERCC1 mintaqalari o'rtasidagi o'zaro ta'sirga yordam beradi. .[6][17] SLX4IP davolash qilingan hujayralardan bo'shatilganda, ular hujayralar tsiklining G2 / M bosqichida to'planib, bu erda ICLni ta'mirlash paytida ta'til birikmalarining rezolyutsiyasi muntazam ravishda yuzaga keladi.[17][18]

OIV-1

The OIV-1 yordamchi oqsil Vpr mezbon hujayralarning tabiiy tsikli orqali rivojlanishini kuchli darajada to'xtatadi G2 / M o'tish bosqichi.[19] Ushbu hibsga olish SLX4 konstruksiyasiga xos bo'lgan muddatidan oldin faollashtirilishidan kelib chiqqan endonukleaza SLX4IP to'g'ridan-to'g'ri o'zaro ta'sir qiladigan murakkab.[20] Ushbu tadqiqot natijasida SLX4 kompleksi salbiy regulyatsiyasi tufayli tug'ma immunitetni boshqarishda ishtirok etishi aniqlandi 1 turdagi interferon o'z-o'zidan paydo bo'lganida ham, OIV-1 vositachiligida ham ishlab chiqarish.[20]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000149346 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027281 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ "Entrez Gen: SLX4 o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil".
  6. ^ a b Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Konnell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (iyul 2009). "Sutemizuvchilar BTBD12 / SLX4 Holliday birikmasi relevazasini yig'adi va DNKni tiklash uchun talab qilinadi". Hujayra. 138 (1): 63–77. doi:10.1016 / j.cell.2009.06.030. PMC  2720686. PMID  19596235.
  7. ^ Fekairi S, Scaglione S, Chahwan C, Teylor ER, Tissier A, Coulon S va boshq. (2009 yil iyul). "Human SLX4 - bu ko'p sonli DNKni tiklash / rekombinatsiyalashgan endonukleazalarni bog'laydigan Holliday birikmasi rezolyazasi subbirligi". Hujayra. 138 (1): 78–89. doi:10.1016 / j.cell.2009.06.029. PMC  2861413. PMID  19596236.
  8. ^ a b Panier S, Maric M, Hewitt G, Mason-Osann E, Gali H, Dai A va boshq. (Oktyabr 2019). "SLX4IP ALT-ga texnik xizmat ko'rsatish paytida noto'g'ri BLM faoliyatini antagonize qiladi". Molekulyar hujayra. 76 (1): 27-43.e11. doi:10.1016 / j.molcel.2019.07.010. PMC  6863466. PMID  31447390.
  9. ^ a b "SLX4IP SLX4 o'zaro ta'sir oqsili [Homo sapiens (odam)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2019-10-31.
  10. ^ "SLX4IP - Protein SLX4IP - Homo sapiens (Inson) - SLX4IP geni va oqsili". www.uniprot.org. Olingan 2019-10-31.
  11. ^ a b "Gen: SLX4IP (ENSG00000149346) - Xulosa - Homo sapiens - Ensembl genom brauzeri 98". asia.ensembl.org. Olingan 2019-10-31.
  12. ^ Fagerberg L, Hallström BM, Oksvold P, Kampf C, Dyureinovich D, Odeberg J va boshq. (2014 yil fevral). "Transkriptomiklar va antitellarga asoslangan proteomikalarni genomik integratsiyasi orqali inson to'qimalariga xos ekspresiyasini tahlil qilish". Molekulyar va uyali proteomika. 13 (2): 397–406. doi:10.1074 / mcp.M113.035600. PMC  3916642. PMID  24309898.
  13. ^ a b v Meissner B, Bartram T, Ekkert C, Trka J, Panzer-Grümayer R, Hermanova I va boshq. (2014 yil fevral). "SLX4IPni bolalikdagi o'tkir limfoblastik leykemiyada noqonuniy V (D) J vositachiligidagi rekombinatsiya bilan tez-tez va jinsga asoslangan o'chirish". Inson molekulyar genetikasi. 23 (3): 590–601. doi:10.1093 / hmg / ddt447. PMID  24045615.
  14. ^ Bryan TM, Englezou A, Dalla-Pozza L, Dunham MA, Reddel RR (noyabr 1997). "Inson o'smalari va o'simtadan kelib chiqqan hujayra chiziqlarida telomer uzunligini saqlashning muqobil mexanizmi uchun dalillar". Tabiat tibbiyoti. 3 (11): 1271–4. doi:10.1038 / nm1197-1271. PMID  9359704. S2CID  10220776.
  15. ^ Bhattacharyya S, Keirsey J, Rassell B, Kavecansky J, Lillard-Wetherell K, Tahmaseb K va boshq. (2009 yil may). "Telomeraza bilan bog'liq oqsil 1, HSP90 va topoizomeraza IIalfa to'g'ridan-to'g'ri ALM yordamida abadiylashtirilgan hujayralardagi BLM helikaz bilan birikadi va telomerik DNK substratlari yordamida uning helikaz faolligini modulyatsiya qiladi". Biologik kimyo jurnali. 284 (22): 14966–77. doi:10.1074 / jbc.m900195200. PMC  2685679. PMID  19329795.
  16. ^ Xashimoto S, Anay X, Xanada K (2016-05-01). "Interstrand DNKning o'zaro bog'lanishini tiklash mexanizmi va odamning buzilishi". Genlar va atrof-muhit. 38 (1): 9. doi:10.1186 / s41021-016-0037-9. PMC  4918140. PMID  27350828.
  17. ^ a b Chjan X, Chen Z, Ye Y, Ye Z, Cao D, Xiong Y va boshq. (Noyabr 2019). "SLX4IP o'zaro bog'lanishni ta'mirlashni rag'batlantirish uchun SLX4 va XPF-ERCC1 bilan ishlaydi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 47 (19): 10181–10201. doi:10.1093 / nar / gkz769. PMC  6821277. PMID  31495888.
  18. ^ McHugh PJ, Sarkar S (may 2006). "Hujayra tsiklidagi DNK oralig'idagi o'zaro bog'liqlikni tiklash: G1 fazasida polimeraza zeta uchun hal qiluvchi rol". Hujayra aylanishi. 5 (10): 1044–7. doi:10.4161 / cc.5.10.2763. PMID  16687932.
  19. ^ Connor RI, Chen BK, Choe S, Landau NR (1995 yil fevral). "Vpr mononukleer fagotsitlarda odamning immunitet tanqisligi virusining 1-turini samarali takrorlash uchun talab qilinadi". Virusologiya. 206 (2): 935–44. doi:10.1006 / viro.1995.1016. PMID  7531918.
  20. ^ a b Laguette N, Bregnard C, Hue P, Basbous J, Yatim A, Larroque M va boshq. (2014 yil yanvar). "SLX4 kompleksining Vpr tomonidan muddatidan oldin faollashishi G2 / M to'xtashiga va tug'ma immunitet sezgirligidan qochishga yordam beradi". Hujayra. 156 (1–2): 134–45. doi:10.1016 / j.cell.2013.12.011. PMID  24412650.

Qo'shimcha o'qish