SOBER1 - SOBER1 - Wikipedia

AtSOBER1.png
Ning kristalli tuzilishi Arabidopsis talianasi SOBER1, PDB kodi 6avv. Alfa spirallari qizil, beta iplari oltindan, katalitik sayt qoldiqlari qora rangda.
Identifikatorlar
BelgilarSOBER1
InterProIPR029058
KATH6avv
SCOP26avv / QOIDA / SUPFAM

SOBER1 bu ferment bu kataliz qiladi ning biokimyoviy reaktsiyasi deatsetilatsiya.[1] SOBER (Sbosim o'tkazgich of AvrBsT-elitsenziyalangan r1) oqsil bu saqlanib qolgan o'simliklarda va u o'simlikning qobiliyatini bostiradi yuqori sezgir javob aniq infektsiyaga qarshi patogen effektor oqsillari YopJ oilasidan.[2] SOBER1 ga tegishli superfamily oqsil ning a / b gidrolazalar va kanonikaga ega serin /histidin /aspartat katalitik uchlik deatsetilatsiya reaktsiyasini amalga oshirish. SOBER1 potentsiali to'g'risida qarama-qarshi xabarlar kelib tushdi fosfolipaza bir tadqiqot da'vo bilan faoliyat fosfolipaza A2 oqsilning faolligi[3] va yana bir tadqiqot natijani ko'paytira olmaydigan.[1]

Asil-oqsilli tioesterazalar bilan aloqasi

SOBER1 oilasining a'zolari yaqin qarindoshlar deb hisoblanadi asil-oqsilli tioesterazalar, ularning fikriga ko'ra oqsil tuzilishi.[2] Biroq, ularning o'zgarishi aminokislotalar ketma-ketligi SOBER1 ning biokimyoviy xususiyatlarini deatsetilaza hosil qiladi; xususan hidrofob Asil-oqsilli tioesterazalarda mavjud bo'lgan tunnel, SOBER1 ning qopqoq tuzilishidagi qo'shimcha aminokislotalar ta'sirida buzilib, bog'lash uchun yangi sirt hosil qiladi. atsetil guruhi.[1]

Protein qopqog'idagi qo'shimcha aminokislotalarni ajratib ko'rsatadigan SOBER1 deatsetilaza funktsiyasi mexanizmi. Tabiat aloqalari 8(1): 2201, Creative Commons Attribution 4.0 Xalqaro litsenziyasi, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Maqsadlar

Hozirgacha quyidagi oqsillar SOBER1 ekanligi aniqlandi maqsadlar: AvrBsT; ACIP1.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v Bürger M, Villijdan avvalgi, Chori J (dekabr 2017). "Hidrofobik langar mexanizmi deatsetilaza oilasini belgilaydi, u YopJ effektorlariga qarshi xost javobini bostiradi". Tabiat aloqalari. 8 (1): 2201. doi:10.1038 / s41467-017-02347-w. PMC  5736716. PMID  29259199.
  2. ^ a b Cunnac S, Wilson A, Nuwer J, Kirik A, Baranage G, Mudgett MB (fevral 2007). "Konservalangan karboksilesteraz - bu Arabidopsisdagi AVRBST-ELISITED RESISTANCE ning supressori". O'simlik hujayrasi. 19 (2): 688–705. doi:10.1105 / tpc.106.048710. PMC  1867326. PMID  17293566.
  3. ^ Kirik A, Mudgett MB (2009 yil dekabr). "SOBER1 fosfolipaza faolligi AvrBsT bakterial effektoriga javoban fosfatidat kislota to'planishi va o'simlik immunitetini bostiradi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 106 (48): 20532–7. doi:10.1073 / pnas.0903859106. PMC  2787154. PMID  19918071.