TCEA1 - TCEA1 - Wikipedia

TCEA1
Protein TCEA1 PDB 1tfi.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarTCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, transkripsiyaning uzayish koeffitsienti A1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 601425 MGI: 1196624 HomoloGene: 55984 Generkartalar: TCEA1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 8 (odam)
Chr.Xromosoma 8 (odam)[1]
Xromosoma 8 (odam)
TCEA1 uchun genomik joylashuv
TCEA1 uchun genomik joylashuv
Band8q11.23Boshlang53,966,552 bp[1]
Oxiri54,022,456 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE TCEA1 216241 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_006756
NM_201437

NM_001159750
NM_001159751
NM_011541

RefSeq (oqsil)

NP_006747
NP_958845

NP_001153222
NP_001153223
NP_035671

Joylashuv (UCSC)Chr 8: 53.97 - 54.02 MbChr 1: 4.86 - 4.9 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Transkripsiya cho'zilish omili A oqsil 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi TCEA1 gen.[5][6][7]

Boshqa organizmlarda bu gen yaxshi tanilgan transkripsiyaning cho'zilish koeffitsienti II S (TFIIS). Bu, asosan, orqaga qarab cho'zilgan komplekslarni RNAP faol uchastkasida kesma hosil qilish orqali hal qilishga yordam beradi, shuning uchun reaktsiya yana mumkin bo'ladi. Shuningdek, u ökaryotikda uchraydi transkripsiyani oldindan tayyorlash kompleksi.[8] Arxeyadagi gomolog xuddi shu asosiy vazifani bajaradi, bakteriyalar esa gomologik bo'lmagan Gredan foydalanadi.[9]

O'zaro aloqalar

TCEA1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan GTF2H1[10][11] va POLR2A.[10][11][12]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000187735 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000033813 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ DiMarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren ST (Avgust 1996). "SII (TCEA) transkripsiyasining uzayish omili 3p22 -> p21.3 xromosomalariga mos keladi". Genomika. 36 (1): 185–8. doi:10.1006 / geno.1996.0443. PMID  8812434.
  6. ^ Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (1994 yil fevral). "TFIIS inson transkripsion cho'zilish omilini kodlovchi genning xarakteristikasi". Gen. 139 (2): 263–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90767-6. PMID  8112616.
  7. ^ "Entrez Gen: TCEA1 transkripsiyasini cho'zish koeffitsienti A (SII), 1".
  8. ^ Kim B, Nesvizskiy AI, Rani PG, Xahn S, Aebersold R, Ranish JA (oktyabr 2007). "TFIIS transkripsiyasini cho'zish koeffitsienti RNK polimeraza II preinitiatsiya komplekslarining tarkibiy qismidir". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 104 (41): 16068–73. doi:10.1073 / pnas.0704573104. PMC  2042163. PMID  17913884.
  9. ^ Robinson, Nikolas P.; Fouqueau, Tomas; Blombax, Fabian; Kakket, Gvenni; Karti, Elis E .; Matelska, Dorota M.; Ofer, Sapir; Pilotto, Simona; Phung, Duy Khanh; Verner, Finn (2018 yil 14-dekabr). "Arxeologik transkripsiyaning eng yaxshi tomoni". Hayot fanida paydo bo'layotgan mavzular. 2 (4): 517–533. doi:10.1042 / ETLS20180014.
  10. ^ a b Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S va boshq. (Oktyabr 1998). "FCP1, RNK-polimeraza IIO ning karboksil-terminal domenini deposforillaydigan inson oqsillari fosfatazasining RAP74-o'zaro ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID  9765293.
  11. ^ a b Pan G, Aso T, Greenblatt J (sentyabr 1997). "TFIIS va elongin A cho'zilish omillarining insonning RNK polimeraza II holofermenti bilan faollashuvi, promotorga xos initsiatsiyaga qodir va transkripsiya faollashtiruvchilariga ta'sirchanligi". Biologik kimyo jurnali. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID  9305922.
  12. ^ Kettenberger H, Armache KJ, Kramer P (2003 yil avgust). "RNK polimeraza II-TFIIS kompleksining arxitekturasi va mRNA parchalanishining ta'siri". Hujayra. 114 (3): 347–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID  12914699. S2CID  17184533.

Qo'shimcha o'qish