TP53BP1 - TP53BP1

TP53BP1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1GZH, 1KZY, 1XNI, 2G3R, 2IG0, 2LVM, 2MWO, 2MWP, 3LGF, 3LGL, 3LH0, 4CRI, 4RG2, 4X34, 5ECG
Identifikatorlar
Taxalluslar	TP53BP1, 53BP1, p202, p53BP1, TP53, TDRD30, o'sma oqsili p53 bog'lovchi oqsil 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 605230 MGI: 1351320 HomoloGene: 4137 Generkartalar: TP53BP1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 15 (odam)
Oxiri	43,510,728 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 2 (sichqoncha)
Oxiri	121,271,407 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • GO: 0001104 transkripsiyasi yadroliator faoliyati; • p53 majburiy; • RNK polimeraza II faollashtiruvchi transkripsiya faktorini bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • ubiqitin modifikatsiyasiga bog'liq bo'lgan histon bilan bog'lanish; • shikastlangan DNK bilan bog'lanish; • metil qilingan gistonni bog'lash; • telomerik DNKni bog'lash; • ketma-ketlikka xos DNK bilan bog'lanish; • histonni bog'lash;
Uyali komponent	• sitoplazma; • quyultirilgan xromosoma kinetoxori; • nukleoplazma; • xromosoma; • xromosoma, telomerik mintaqa; • xromosoma, sentromerik mintaqa; • kinetoxora; • yadro tanasi; • hujayra yadrosi; • yadro xromosomasi, telomerik mintaqa; • replikatsiya vilkasi; • ikki qatorli uzilish joyi; • DNKni tiklash kompleksi;
Biologik jarayon	• transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • rentgenga uyali javob; • DNKning shikastlanishini tekshirish punkti; • ketma-ketlikka xos DNKni bog'laydigan transkripsiya omilining faolligini ijobiy tartibga solish; • transkripsiya, DNK-andozali; • DNKning zararlanishini rag'batlantirishga uyali javob; • transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi; • DNKni tiklash; • oqsil gomoligomerizatsiyasi; • non-homologik qo'shilish orqali ikki zanjirli tanaffusni ta'mirlash; • izotiplarni almashtirishni ijobiy tartibga solish; • gomologik rekombinatsiya orqali ikki qatorli tanaffusni ta'mirlashni salbiy tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	7158
	27223
	ENSG00000067369
	ENSMUSG00000043909
	12888
	P70399
	NM_001141979; NM_001141980; NM_005657; NM_001355001
	NM_001290830; NM_013735
	NP_001135451; NP_001135452; NP_005648; NP_001341930
	NP_001277759; NP_038763
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

O'simta supressori p53-bog'lovchi oqsil 1 shuningdek, nomi bilan tanilgan p53-bog'lovchi oqsil 1 yoki 53BP1 a oqsil odamlarda kodlanganligi TP53BP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Klinik ahamiyati

53BP1 aksariyat hollarda kam ifodalangan uch marta salbiy ko'krak bezi saratoni.^[8]

DNKni tiklash

DNKning ikki simli sinishi (DSB) sitotoksik ziyon bo'lib, ular tomonidan tiklanishi mumkin gomologik rekombinatsion (HR) yo'lini yoki gomologik bo'lmagan qo'shilish (NHEJ) yo'li. NHEJ, HR dan tezroq bo'lsa ham, unchalik aniq emas. Ikkala yo'l o'rtasidagi dastlabki divergent qadam - bu rezektsiya va bu qadam ko'plab omillar bilan tartibga solinadi. Jumladan, BRCA1 va 53BP1 ikkita yo'l o'rtasidagi muvozanatni aniqlashda rol o'ynaydi.^[9]^[10] 53BP1 rezektsiyani cheklaydi va NHEJni targ'ib qiladi.

O'zaro aloqalar

53BP1 ga ko'rsatildi jismoniy ta'sir o'tkazish bilan:

Histon H4 Lizin 20 da dimetilatlangan yoki monometil qilingan^[11]
Giston H2A yoki Histon H2A.X Lizin 15 da hamma joyda mavjud^[12]
p53^[13]^[14]^[15]^[16]
DYNLL1^[17]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000067369 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000043909 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Ivabuchi K, Bartel PL, Li B, Marraccino R, Fields S (iyun 1994). "Yovvoyi turdagi, ammo mutant bo'lmagan p53 bilan bog'langan ikkita hujayrali oqsil". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 91 (13): 6098–102. doi:10.1073 / pnas.91.13.6098. PMC 44145. PMID 8016121.
^ Ivabuchi K, Li B, Massa HF, Trask BJ, Sana T, Fields S (Okt 1998). "P53-bog'laydigan oqsillar, 53BP1 va 53BP2 tomonidan p53 vositachiligida transkripsiya aktivatsiyasini rag'batlantirish". Biologik kimyo jurnali. 273 (40): 26061–8. doi:10.1074 / jbc.273.40.26061. PMID 9748285.
^ "Entrez Gen: TP53BP1 o'sma oqsili p53 bog'lovchi oqsil 1".
^ Bouman P, Aly A, Eskandell JM, Pieterse M, Bartkova J, van der Gulden H, Xidding S, Tanasula M, Kulkarni A, Yang Q, Xaffti BG, Tommiska J, Blomqvist C, Drapkin R, Adams DJ, Nevanlinna H, Bartek J, Tarsounas M, Ganesan S, Jonkers J (iyun 2010). "53BP1 yo'qotilishi BRCA1 etishmovchiligini qutqaradi va uch marta manfiy va BRCA mutatsiyasiga uchragan ko'krak saratoni bilan bog'liq". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 17 (6): 688–95. doi:10.1038 / nsmb.1831. PMC 2912507. PMID 20453858.
^ Panier S, Boulton SJ (2014). "Ikki qatorli tanaffuslarni ta'mirlash: 53BP1 diqqat markaziga kiradi". Nat. Rev. Mol. Hujayra biol. 15 (1): 7–18. doi:10.1038 / nrm3719. PMID 24326623.
^ Li J, Xu X (2016). "DNKning ikki qatorli tanaffusini tiklash: yo'l tanlash haqida ertak". Acta Biochim. Biofiz. Gunoh. (Shanxay). 48 (7): 641–6. doi:10.1093 / abbs / gmw045. PMID 27217474.
^ Botuyan MV, Li J, Vard IM, Kim JE, Tompson JR, Chen J, Mer G (2006 yil dekabr). "DNKni tiklashda 53BP1 va Crb2 tomonidan histon H4-K20 ni metilatsiyalash holatiga xos tan olishining strukturaviy asoslari". Hujayra. 127 (7): 1361–73. doi:10.1016 / j.cell.2006.10.043. PMC 1804291. PMID 17190600.
^ Fradet-Turcotte A, Canny MD, Orthwein A, Leung CC, Huang H, Landry MC, Kitevski-LeBlanc J, Noordermeer SM, Sicheri F, Durocher D (iyun 2013). "53BP1 - bu DNKning shikastlanishiga olib keladigan H2A Lys 15 ubikuitin belgisini o'qiydi". Tabiat. 499 (7456): 50–4. doi:10.1038 / tabiat12318. PMC 3955401. PMID 23760478.
^ Derbyshire DJ, Basu BP, Serpell LC, Joo WS, Date T, Iwabuchi K, Doherty AJ (Iyul 2002). "Inson 53BP1 BRCT domenlarining kristalli tuzilishi p53 o'simta supressoriga bog'langan". EMBO jurnali. 21 (14): 3863–72. doi:10.1093 / emboj / cdf383. PMC 126127. PMID 12110597.
^ Ekblad CM, Fridler A, Veprintsev D, Weinberg RL, Itzhaki LS (Mar 2004). "BRCA1 va 53BP1 ning BRCT domenlarini taqqoslash: biofizik tahlil". Proteinli fan. 13 (3): 617–25. doi:10.1110 / ps.03461404. PMC 2286730. PMID 14978302.
^ Joo WS, Jeffri PD, Cantor SB, Finnin MS, Livingston DM, Pavletich NP (Mar 2002). "P53 bilan bog'langan 53BP1 BRCT mintaqasining tuzilishi va uni Brca1 BRCT tuzilishi bilan taqqoslash". Genlar va rivojlanish. 16 (5): 583–93. doi:10.1101 / gad.959202. PMC 155350. PMID 11877378.
^ Derbyshire DJ, Basu BP, Sana T, Ivabuchi K, Doherty AJ (2002 yil oktyabr). "P53 o'simta supressoriga bog'langan odam 53BP1 ning BRCT domenlarini tozalash, kristallanish va dastlabki rentgenologik tahlil". Acta Crystallographica bo'limi D. 58 (Pt 10 Pt 2): 1826-9. doi:10.1107 / S0907444902010910. PMID 12351827.
^ Lo KW, Kan HM, Chan LN, Xu WG, Van KP, Wu Z, Sheng M, Zhang M (Mar 2005). "8-kDa dynein yorug'lik zanjiri p53-biriktiruvchi oqsil 1 bilan bog'lanadi va DNKning shikastlanishidan kelib chiqqan p53 yadro birikmasiga vositachilik qiladi". Biologik kimyo jurnali. 280 (9): 8172–9. doi:10.1074 / jbc.M411408200. PMID 15611139.

Qo'shimcha o'qish

Choubey D, Lengyel P (1995 yil mart). "Interferonni keltirib chiqaradigan oqsilni (p202) retinoblastoma oqsiliga bog'lash". Biologik kimyo jurnali. 270 (11): 6134–40. doi:10.1074 / jbc.270.11.6134. PMID 7890747.
Choubey D, Li SJ, Datta B, Gutterman JU, Lengyel P (1996 yil oktyabr). "P202 tomonidan E2F vositachiligidagi transkripsiyaning inhibatsiyasi". EMBO jurnali. 15 (20): 5668–78. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00951.x. PMC 452311. PMID 8896460.
Datta B, Li B, Choubey D, Nallur G, Lengyel P (1996 yil noyabr). "p202, transkripsiyaning interferonli induktorli modulyatori, p53 o'simta supressor oqsili bilan transkripsiya faollashuvini inhibe qiladi va p53-biriktiruvchi oqsil 1 dan p202 bilan bog'langan segment bu inhibatsiyani engib chiqadi". Biologik kimyo jurnali. 271 (44): 27544–55. doi:10.1074 / jbc.271.44.27544. PMID 8910340.
Wen Y, Yan DH, Spohn B, Deng J, Lin SY, Hung MC (yanvar 2000). "Ko'krak bezi saraton hujayralarida interferonni keltirib chiqaradigan protein, p202 tomonidan o'smaning nekroz omiliga alfa ta'sirida paydo bo'lgan apoptozga o'smalarni bostirish va sezuvchanlik". Saraton kasalligini o'rganish. 60 (1): 42–6. PMID 10646849.
Xia Z, Morales JC, Dunphy WG, Carpenter PB (Yanvar 2001). "BRCT oqsilining hujayra tsiklining salbiy regulyatsiyasi va DNKning shikastlanishiga olib keladigan fosforillanishi 53BP1". Biologik kimyo jurnali. 276 (4): 2708–18. doi:10.1074 / jbc.M007665200. PMID 11042216.
Joo WS, Jeffri PD, Cantor SB, Finnin MS, Livingston DM, Pavletich NP (Mar 2002). "P53 bilan bog'langan 53BP1 BRCT mintaqasining tuzilishi va uni Brca1 BRCT tuzilishi bilan taqqoslash". Genlar va rivojlanish. 16 (5): 583–93. doi:10.1101 / gad.959202. PMC 155350. PMID 11877378.
Derbyshire DJ, Basu BP, Serpell LC, Joo WS, Date T, Iwabuchi K, Doherty AJ (Iyul 2002). "Inson 53BP1 BRCT domenlarining kristalli tuzilishi p53 o'simta supressoriga bog'langan". EMBO jurnali. 21 (14): 3863–72. doi:10.1093 / emboj / cdf383. PMC 126127. PMID 12110597.
Lay H, Lin L, Nadji M, Lay S, Trapido E, Men L (2002). "P53 o'simta supressor genidagi mutatsiyalar va ko'krak bezi saratonining erta boshlanishi". Saraton biologiyasi va terapiyasi. 1 (1): 31–6. doi:10.4161 / cbt.1.1.37. PMID 12170762.
Derbyshire DJ, Basu BP, Sana T, Ivabuchi K, Doherty AJ (2002 yil oktyabr). "P53 o'simta supressoriga bog'langan odam 53BP1 ning BRCT domenlarini tozalash, kristallanish va dastlabki rentgenologik tahlil". Acta Crystallographica bo'limi D. 58 (Pt 10 Pt 2): 1826-9. doi:10.1107 / S0907444902010910. PMID 12351827.
Vang B, Matsuoka S, Carpenter PB, Elledge SJ (noyabr 2002). "53BP1, DNKning shikastlanishini nazorat qilish punktining vositachisi". Ilm-fan. 298 (5597): 1435–8. doi:10.1126 / science.1076182. PMID 12364621.
Richie CT, Peterson C, Lu T, Hittelman WN, Carpenter PB, Legerski RJ (2002 yil dekabr). "hSnm1 DNK zararlanishidan oldin va keyin 53BP1 bilan kokalizatsiyalanadi va jismonan birikadi". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (24): 8635–47. doi:10.1128 / MCB.22.24.8635-8647.2002. PMC 139863. PMID 12446782.
DiTullio RA, Mochan TA, Venere M, Bartkova J, Seheded M, Bartek J, Halazonetis TD (Dekabr 2002). "53BP1 inson saratonida konstruktiv ravishda faollashtirilgan ATMga bog'liq tekshiruv yo'lida ishlaydi". Tabiat hujayralari biologiyasi. 4 (12): 998–1002. doi:10.1038 / ncb892. PMID 12447382.
Fernandez-Capetillo O, Chen HT, Celeste A, I bo'lim, Romanienko PJ, Morales JC, Naka K, Xia Z, Camerini-Otero RD, Motoyama N, Carpenter PB, Bonner WM, Chen J, Nussenzweig A (dekabr 2002). "H2AX va 53BP1 histonlari yordamida DNKning shikastlanishidan kelib chiqqan G2-M nazorat nuqtasini faollashtirish". Tabiat hujayralari biologiyasi. 4 (12): 993–7. doi:10.1038 / ncb884. PMID 12447390.
Peng A, Chen PL (2003 yil mart). "NFBD1, xuddi 53BP1 kabi, DNKning zararlanishiga javoban Chk2 fosforilatsiyasini vositachilik qiladigan erta va ortiqcha transduser". Biologik kimyo jurnali. 278 (11): 8873–6. doi:10.1074 / jbc.C300001200. PMID 12551934.
Styuart GS, Vang B, Bignell CR, Teylor AM, Elliz SJ (2003 yil fevral). "MDC1 - bu sutemizuvchilarning DNK zararlanishini tekshirish punktining vositachisi". Tabiat. 421 (6926): 961–6. doi:10.1038 / nature01446. PMID 12607005.
Yan DH, Abramian A, Li Z, Ding Y, Ven Y, Liu TJ, Xant K (2003 yil mart). "P202, interferonni keltirib chiqaradigan protein, prostata saratoni hujayralarida E2F1 vositachiligidagi apoptozni inhibe qiladi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlar bo'yicha aloqa. 303 (1): 219–22. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00320-6. PMID 12646190.
Kao GD, McKenna WG, Guenther MG, Muschel RJ, Lazar MA, Yen TJ (2003 yil mart). "Giston deatsetilaza 4 53BP1 bilan ta'sir o'tkazib, DNKning zararlanishiga vositachilik qiladi". Hujayra biologiyasi jurnali. 160 (7): 1017–27. doi:10.1083 / jcb.200209065. PMC 2172769. PMID 12668657.
Caldwell RB, Braselmann H, Schoetz U, Heuer S, Scherthan H, Zitzelsberger H (2016 yil 4-iyul). "Pozitiv Cofactor 4 (PC4) DT40 hujayralarida DNKni tiklash yo'lini qayta yo'naltirish uchun juda muhimdir". Ilmiy ish. Rep. 6: 28890. doi:10.1038 / srep28890. PMC 4931448. PMID 27374870.

Tashqi havolalar

Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: 12888 (TP53-bog'lovchi oqsil 1) da PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000067369 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000043909 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8016121-5] Ivabuchi K, Bartel PL, Li B, Marraccino R, Fields S (iyun 1994). "Yovvoyi turdagi, ammo mutant bo'lmagan p53 bilan bog'langan ikkita hujayrali oqsil". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 91 (13): 6098–102. doi:10.1073 / pnas.91.13.6098. PMC 44145. PMID 8016121.

[pmid9748285-6] Ivabuchi K, Li B, Massa HF, Trask BJ, Sana T, Fields S (Okt 1998). "P53-bog'laydigan oqsillar, 53BP1 va 53BP2 tomonidan p53 vositachiligida transkripsiya aktivatsiyasini rag'batlantirish". Biologik kimyo jurnali. 273 (40): 26061–8. doi:10.1074 / jbc.273.40.26061. PMID 9748285.

[7] "Entrez Gen: TP53BP1 o'sma oqsili p53 bog'lovchi oqsil 1".

[pmid20453858-8] Bouman P, Aly A, Eskandell JM, Pieterse M, Bartkova J, van der Gulden H, Xidding S, Tanasula M, Kulkarni A, Yang Q, Xaffti BG, Tommiska J, Blomqvist C, Drapkin R, Adams DJ, Nevanlinna H, Bartek J, Tarsounas M, Ganesan S, Jonkers J (iyun 2010). "53BP1 yo'qotilishi BRCA1 etishmovchiligini qutqaradi va uch marta manfiy va BRCA mutatsiyasiga uchragan ko'krak saratoni bilan bog'liq". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 17 (6): 688–95. doi:10.1038 / nsmb.1831. PMC 2912507. PMID 20453858.

[pmid24326623-9] Panier S, Boulton SJ (2014). "Ikki qatorli tanaffuslarni ta'mirlash: 53BP1 diqqat markaziga kiradi". Nat. Rev. Mol. Hujayra biol. 15 (1): 7–18. doi:10.1038 / nrm3719. PMID 24326623.

[pmid27217474-10] Li J, Xu X (2016). "DNKning ikki qatorli tanaffusini tiklash: yo'l tanlash haqida ertak". Acta Biochim. Biofiz. Gunoh. (Shanxay). 48 (7): 641–6. doi:10.1093 / abbs / gmw045. PMID 27217474.

[pmid17190600-11] Botuyan MV, Li J, Vard IM, Kim JE, Tompson JR, Chen J, Mer G (2006 yil dekabr). "DNKni tiklashda 53BP1 va Crb2 tomonidan histon H4-K20 ni metilatsiyalash holatiga xos tan olishining strukturaviy asoslari". Hujayra. 127 (7): 1361–73. doi:10.1016 / j.cell.2006.10.043. PMC 1804291. PMID 17190600.

[pmid23760478-12] Fradet-Turcotte A, Canny MD, Orthwein A, Leung CC, Huang H, Landry MC, Kitevski-LeBlanc J, Noordermeer SM, Sicheri F, Durocher D (iyun 2013). "53BP1 - bu DNKning shikastlanishiga olib keladigan H2A Lys 15 ubikuitin belgisini o'qiydi". Tabiat. 499 (7456): 50–4. doi:10.1038 / tabiat12318. PMC 3955401. PMID 23760478.

[pmid12110597-13] Derbyshire DJ, Basu BP, Serpell LC, Joo WS, Date T, Iwabuchi K, Doherty AJ (Iyul 2002). "Inson 53BP1 BRCT domenlarining kristalli tuzilishi p53 o'simta supressoriga bog'langan". EMBO jurnali. 21 (14): 3863–72. doi:10.1093 / emboj / cdf383. PMC 126127. PMID 12110597.

[pmid14978302-14] Ekblad CM, Fridler A, Veprintsev D, Weinberg RL, Itzhaki LS (Mar 2004). "BRCA1 va 53BP1 ning BRCT domenlarini taqqoslash: biofizik tahlil". Proteinli fan. 13 (3): 617–25. doi:10.1110 / ps.03461404. PMC 2286730. PMID 14978302.

[pmid11877378-15] Joo WS, Jeffri PD, Cantor SB, Finnin MS, Livingston DM, Pavletich NP (Mar 2002). "P53 bilan bog'langan 53BP1 BRCT mintaqasining tuzilishi va uni Brca1 BRCT tuzilishi bilan taqqoslash". Genlar va rivojlanish. 16 (5): 583–93. doi:10.1101 / gad.959202. PMC 155350. PMID 11877378.

[pmid12351827-16] Derbyshire DJ, Basu BP, Sana T, Ivabuchi K, Doherty AJ (2002 yil oktyabr). "P53 o'simta supressoriga bog'langan odam 53BP1 ning BRCT domenlarini tozalash, kristallanish va dastlabki rentgenologik tahlil". Acta Crystallographica bo'limi D. 58 (Pt 10 Pt 2): 1826-9. doi:10.1107 / S0907444902010910. PMID 12351827.

[pmid15611139-17] Lo KW, Kan HM, Chan LN, Xu WG, Van KP, Wu Z, Sheng M, Zhang M (Mar 2005). "8-kDa dynein yorug'lik zanjiri p53-biriktiruvchi oqsil 1 bilan bog'lanadi va DNKning shikastlanishidan kelib chiqqan p53 yadro birikmasiga vositachilik qiladi". Biologik kimyo jurnali. 280 (9): 8172–9. doi:10.1074 / jbc.M411408200. PMID 15611139.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]