TRIM37 - TRIM37 - Wikipedia

TRIM37
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarTRIM37, MUL, POB1, TEF3, 37 ni o'z ichiga olgan uch tomonlama motif
Tashqi identifikatorlarOMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 Generkartalar: TRIM37
Gen joylashuvi (odam)
17-xromosoma (odam)
Chr.17-xromosoma (odam)[1]
17-xromosoma (odam)
TRIM37 uchun genomik joylashuv
TRIM37 uchun genomik joylashuv
Band17q22Boshlang58,982,638 bp[1]
Oxiri59,106,921 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE TRIM37 213009 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_197987
NM_001363025
NM_001363026
NM_001363027
NM_001363028

RefSeq (oqsil)

NP_932104
NP_001349954
NP_001349955
NP_001349956
NP_001349957

Joylashuv (UCSC)Chr 17: 58.98 - 59.11 MbChr 11: 87.13 - 87.22 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Uch tomonlama motifli protein 37 bu E3 ubikuitin ligaz tomonidan kodlangan odamlarda TRIM37 gen.[5][6][7][8]

Funktsiya

Bu gen a'zosini kodlaydi uch tomonlama motif (TRIM) oilasi, uning a'zolari turli xil uyali funktsiyalarda ishtirok etishadi, masalan, rivojlanish naqshlari va onkogenez. TRIM motifiga quyidagilar kiradi rux bilan bog'laydigan domenlar, RING barmoq mintaqasi, a B-quti motifi va a o'ralgan spiral domeni. RING barmog'i va B qutisi domenlari xelat rux va ular oqsil-oqsil va / yoki protein-nuklein kislota ta'sirida ishtirok etishi mumkin. Gen mutatsiyalari bilan bog'liq mulibrey (mushak-jigar-miya-ko'z) nanizm, bir nechta to'qimalarni o'z ichiga olgan autosomal retsessiv kasallik mezodermal kelib chiqishi. Shu bilan bir xil oqsilni kodlaydigan muqobil ravishda qo'shilgan transkript variantlari aniqlandi.[7] Bu mono- uchun javobgardirhamma joyda ning histon H2A at lizin 119, odatda bog'liq bo'lgan o'zgartirish transkripsiyaviy repressiya.[8][9]

Ko'krak bezi saratonidagi roli

17q23 xromosoma mintaqasi, unda TRIM37 gen joylashgani ko'krak bezi saratonining 40% gacha kuchayganligi isbotlangan.[10] TRIM37 oqsili ko'krakda rol o'ynaydi deb o'ylashadi saraton onkogenezi o'smani bostiruvchi genlar egallagan hududlarda H2A histonini hamma joyda tarqatish orqali.O'smani bostiruvchi genlarning bunday repressiyasi o'smaning paydo bo'lishi yoki mavjud bo'lgan o'smaning yanada tajovuzkor bo'lish ehtimolini oshiradi.[8]

O'zaro aloqalar

TRIM37 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan PRC1.[11] TRIM37 shuningdek, uning o'ziga xosligini va qachon o'zgarishini o'zgartirish uchun PRC2 bilan o'zaro aloqada ekanligi ko'rsatilgan TRIM37 haddan tashqari ta'sirlangan, gen ekspressionida ko'plab o'zgarishlar mavjud bo'lib, ular o'smani bostiruvchi genlarning sustlashishiga olib keladi.[8] Shuningdek, TRIM37, PRC2, PRC1 maqsadli genlar bilan birgalikda bog'lanib, natijada ularning transkripsiyaviy repressiyasiga olib kelishi ko'rsatilgan. Nokdaun TRIM37 RNK-interferentsiya orqali ifoda etish H2A ning hamma joyda tarqalishiga va PRC1 va PRC2 ning maqsadli genlardan ajralishiga olib kelishini ko'rsatdi. Ushbu o'zgarishlar maqsadli genning transkripsiyaviy faol bo'lishiga imkon beradi.[8]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000108395 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000018548 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Avela K, Lipsanen-Nyman M, Perheentupa J, Wallgren-Pettersson C, Marchand S, Fauré S va boshq. (1997 yil aprel). "Mulibrey nanizm genini 17q ga bog'lash va bog'lash-muvozanatsizlik tahlili orqali tayinlash". Amerika inson genetikasi jurnali. 60 (4): 896–902. PMC  1712467. PMID  9106536.
  6. ^ Avela K, Lipsanen-Nyman M, Idänheimo N, Seemanová E, Rosengren S, Mäkelä TP va boshq. (2000 yil iyul). "Yangi RING-B-box-Coiled-coil oqsilini kodlovchi gen mulibrey nanizmida mutatsiyaga uchragan". Tabiat genetikasi. 25 (3): 298–301. doi:10.1038/77053. PMID  10888877. S2CID  24257747.
  7. ^ a b "Entrez Gen: TRIM37 uch tomonlama motifli 37".
  8. ^ a b v d e Bhatnagar S, Gazin S, Chamberlain L, Ou J, Zhu X, Tushir JS va boshq. (2014 yil dekabr). "TRIM37 - bu yangi histon H2A ubikuitin ligaza va onkoprotein ko'krak bezi saratoni". Tabiat. 516 (7529): 116–20. Bibcode:2014 yil Noyabr 516..116B. doi:10.1038 / tabiat13955. PMC  4269325. PMID  25470042.
  9. ^ Weake VM, Workman JL (mart, 2008). "Gistonning hamma joyda tarqalishi: gen faolligini qo'zg'atish". Molekulyar hujayra. 29 (6): 653–63. doi:10.1016 / j.molcel.2008.02.014. PMID  18374642.
  10. ^ Sinkler, Kollin S.; Rouli, Metyu; Naderi, Ali; Couch, Fergus J. (2003-04-01). "17q23 Amplikon va ko'krak bezi saratoni". Ko'krak bezi saratonini o'rganish va davolash. 78 (3): 313–322. doi:10.1023 / A: 1023081624133. ISSN  1573-7217. PMID  12755490. S2CID  23751525.
  11. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N va boshq. (2005 yil oktyabr). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: O94972 (E3 ubikuitin-protein ligaz TRIM37) da PDBe-KB.