W-box - W-box - Wikipedia

The W qutisi a deoksiribonuklein kislotasi (DNK) cis-tartibga solish elementi ketma-ketligi, (T) TGAC (C / T), qaysi tomonidan tan olingan WRKY transkripsiyasi omillari.[1][2]

W-box elementining o'simlik turlari bo'yicha ishlashi va saqlanishi jelni siljitish tajribalari, tasodifiy bog'lanish joyini tanlash, xamirturushli bitta gibridli ekranlar va ko'plab turli xil WRKY oqsillari bilan birgalikda transfektsiya tahlillari bilan ko'rsatildi. Silikonda- o'simliklarni ishlab chiqaruvchilarning funktsional tadqiqotlari bilan birgalikda asoslangan tadqiqotlar stressni keltirib chiqaradigan promotorlarda W qutilarining klasterlarini aniqladi. WRKY oqsillarini W-qutilarga bog'lab turishi, boshqa o'simlik jarayonlari, masalan, unib chiqish kabi biotik va abiotik stress ta'sirining xususiyatidir.[3] Bundan tashqari, bir nechta W-qutilar transkripsiyada sinergetik ta'sir ko'rsatishi ko'rsatilgan.

Deyarli barcha WRKY transkripsiyasi omillari imtiyozli ravishda W-qutilariga bog'lanadi va ular kashf etilganidan buyon ularning maqsadli genlari targ'ibotchilari uchun o'ziga xosligini qanday ko'rsatishi haqida savol tug'dirdi.[2] Ciolkowski va boshq. (2008) shuni ko'rsatdiki, W-box yadrosi zarur bo'lsa-da, ulashgan joylar afzalligini aniqlashda qo'shni ketma-ketliklar ham rol o'ynaydi.[4] So'nggi dalillar shuni ko'rsatadiki, TGAC yadrosi a dan tashkil topgan darajada buzilgan guanin adenin sitozin (GAC) yadrosi va yuqori timin va quyi oqim pirimidin yonma-yon ketma-ketliklar ma'lum WRKY omillari tomonidan tan olinishini belgilashga yordam beradi.[5] WRKY oqsillari domenining asosiy qoldiqlari ham fosfat umurtqasini taniydi deb ishoniladi cis-element.[5]

Yaqinda Yamasaki va boshq. Arabidopsis WRKY4 ning C-terminalli WRKY domenining eritma tuzilishini NMR tomonidan W-box DNK bilan kompleksda aniqladilar.[6] Ular to'rt ipli b-varaq DNKning katta chuqurchasiga ular b-xanjar deb nomlangan tuzilishga kirganligini, bu erda DNKning spiral ayvoniga deyarli perpendikulyar bo'lganligini aniqladilar. Konservalangan WRKYGQK imzo motifidagi aminokislotalar taxmin qilinganidek, W-box DNK bilan bog'laning.

Tashqi havolalar va foydali manbalar

Adabiyotlar

  1. ^ Rushton, Pol; Makdonald, X.; Xutli, A.K .; Lazarus, CM; Xuli, R (1995). "DNK bilan bog'langan yangi oqsillar oilasi a'zolari alfa-Amy2 genlarining promotorlarida saqlanib qolgan sis-element bilan bog'lanadi". O'simliklar molekulyar biologiyasi. 29: 29: 691–702. doi:10.1007 / bf00041160. PMID  8541496.
  2. ^ a b Rushton PJ, Somssich IE, Ringler P, Shen QJ (may 2010). "WRKY transkripsiyasi omillari". Trends Plant Sci. 15 (5): 247–58. doi:10.1016 / j.tplants.2010.02.006. PMID  20304701.
  3. ^ Rushton, Pol. "Doktor Pol Rastonning laboratoriyasi". wordpress.com. Olingan 17 iyun 2013.
  4. ^ Ciolkovski, I .; Vanke D; Birkenbihl RP; Somssich IE. (2008). "WRKY transkripsiyasi omillarining DNK bilan biriktiruvchi selektivligi bo'yicha tadqiqotlar WRKY-domen funktsiyasiga strukturaviy maslahatlar beradi". Mol biol o'simlik. 68: 81–92. doi:10.1007 / s11103-008-9353-1. PMC  2493524. PMID  18523729.
  5. ^ a b Tovar belgisi; Baliqchi; Xarter; Kolbaxer; Vanke (2013). "WRKY transkripsiyasi omillarining evolyutsion konservalangan DNK bilan bog'lash xususiyatlarini molekulyar dinamikasi va in vitro bog'lanish tahlillari orqali yoritib berish". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 41 (21): 9764–9778. doi:10.1093 / nar / gkt732. PMC  3834811. PMID  23975197.
  6. ^ Yamasaki, K .; Kigawa T; Vatanabe S; Inoue M; Yamasaki T; Seki M; Shinozaki K; Yokoyama S. (2012). "Arabidopsis WRKY transkripsiyasi faktori bilan ketma-ketlikka xos DNKni aniqlashning strukturaviy asoslari". J. Biol. Kimyoviy. 287: 7683–91. doi:10.1074 / jbc.M111.279844. PMC  3293589. PMID  22219184.

Shuningdek qarang