YTH protein domeni - YTH protein domain
| YTH protein domeni | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | YTH | ||||||||
| Pfam | PF04146 | ||||||||
| Pfam klan | CL0178 | ||||||||
| InterPro | IPR007275 | ||||||||
| |||||||||
Molekulyar biologiyada protein domeni, YTH tanlab olib tashlanganligi ko'rsatilgan YTH oilasining a'zosini anglatadi stenogrammalar ning mayoz - o'ziga xos genlar ifoda etilgan yilda mitotik hujayralar.[1]
Bu protein domeni, YTH-domeni saqlanib qolgan hamma uchun eukaryotlar va buni taklif qiladi saqlanib qolgan C-terminal mintaqasi uzatishda muhim rol o'ynaydi sitosolik Ca signallari yadro, shu bilan tartibga solish gen ekspressioni.[2]
Funktsiya / mexanizm
Yuqorida taxmin qilingan ökaryotik YTH-oila a'zolari bostirishning o'xshash mexanizmlariga jalb qilinishi mumkin genlarni tartibga solish gametogenez yoki umumiy sukunat paytida. The kalamush oqsil YT521-B, SWISSPROT, bu tirozin-fosforillangan yadro oqsili, ya'ni o'zaro ta'sir qiladi yadro transkriptosomal qismi iskala bilan ilova omil B va 68kDa Src substrat davomida bog'liq mitoz, Sam68. In Vivo jonli ravishda biriktirish tahlillar YT521-B alternativini modulyatsiya qilishini namoyish etdi qo'shilish sayti kontsentratsiyaga bog'liq ravishda tanlov.[3] Bundan tashqari, YTH domeni RNK bilan bog'lanishda muhim rol o'ynaydi. [4]
Tuzilishi
Domen to'rtta o'z ichiga olgan aralash alfa / beta-katlama bo'lishi taxmin qilinmoqda alfa spirallari va oltita beta-strandlar.[4]
O'simlik
Yilda o'simlik hujayralar ekologik ogohlantirishlar, bu yorug'lik, patogenlar, gormonlar va abiotik stresslar, o'zgarishlarni keltirib chiqaradi sitosolik kaltsiy miqdori, ammo sitosol-yadroli Ca-signalizatsiya yo'li haqida juda oz narsa ma'lum; qayerda genlarni tartibga solish ga to'g'ri javob berish uchun paydo bo'ladi stress. Ikkita roman namoyish etildi Arabidopsis taliana (Sichqoncha qulog'i sarig'i) oqsillar, (ECT1 va ECT2), xususan bilan bog'liq Kalsineurin Ser / Thr a'zosi bo'lgan B-o'xshash o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil Kinase1 (CIPK1) oqsil kinazalari bu o'zaro ta'sir qilish kalsineurin B ga o'xshash Ca-biriktiruvchi bilan oqsillar. Ushbu ikkita oqsil juda o'xshash C-terminal mintaqasini o'z ichiga oladi (180 aminokislotalar uzunligi bo'yicha, 81% o'xshashlik), bu CIPK1 va translokatsiya uchun yadro.
Adabiyotlar
- ^ Harigaya Y, Tanaka H, Yamanaka S, Tanaka K, Vatanabe Y, Tsutsumi C, Chikashige Y, Xiraoka Y, Yamashita A, Yamamoto M (iyul 2006). "RNK-messenjerini selektiv ravishda yo'q qilish bevaqt meyoz kasalligini oldini oladi". Tabiat. 442 (7098): 45–50. doi:10.1038 / nature04881. PMID 16823445. S2CID 4383571.
- ^ Ok SH, Jeong HJ, Bae JM, Shin JS, Luan S, Kim KN (sentyabr 2005). "Arabidopsisdagi yangi CIPK1 bilan bog'liq oqsillar yadro lokalizatsiyasiga vositachilik qiladigan evolyutsion tarzda saqlanib qolgan C-terminal mintaqasini o'z ichiga oladi". O'simliklar fizioli. 139 (1): 138–50. doi:10.1104 / pp.105.065649. PMC 1203364. PMID 16113215.
- ^ Xartmann AM, Nayler O, Shvayger FW, Obermeier A, Stamm S (1999 yil noyabr). "Sam68 ning YT521-B biriktiruvchi faktor bilan yadro nuqtalaridagi o'zaro ta'siri va koalizatsiyasi S59 oilaviy kinaz p59 (fyn) tomonidan tartibga solinadi". Mol. Biol. Hujayra. 10 (11): 3909–26. doi:10.1091 / mbc.10.11.3909. PMC 25688. PMID 10564280.
- ^ a b Stoilov P, Rafalska I, Stamm S (oktyabr 2002). "YTH: yadro oqsillarida yangi domen". Biokimyo tendentsiyalari. Ilmiy ish. 27 (10): 495–7. doi:10.1016 / S0968-0004 (02) 02189-8. PMID 12368078.