Betaarterivirus suid 1 - Betaarterivirus suid 1 - Wikipedia

Marvel Comics superqahramoni uchun qarang Moviy quloq.
Betaarterivirus suid 1
Viruslarning tasnifi e
(ochilmagan):Virus
Shohlik:Riboviriya
Qirollik:Orthornavirae
Filum:Pisuviricota
Sinf:Pisoniviritsetlar
Buyurtma:Nidovirales
Oila:Arteriviridae
Tur:Betaarterivirus
Subgenus:Eurpobartevirus
Turlar:
Betaarterivirus suid 1
Sinonimlar
  • Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi 1[1]
  • Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi[2]
  • Cho'chqa nafas olish va reproduktiv sindrom virusi[3]
  • Cho'chqaning bepushtligi va nafas olish sindromi virusi[4]

Betaarterivirus suid 1, avval Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi (PRRSV), a virus bu sabab bo'ladi kasallik ning cho'chqalar, deb nomlangan cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi (PRRS), shuningdek, nomi bilan tanilgan ko'k quloq cho'chqa kasalligi (ichida.) Xitoy, zhū láněr bìng 豬 藍 耳 病). Bu iqtisodiy jihatdan muhim, panzootik kasallik naslchilik naslidagi reproduktiv etishmovchilik va yosh cho'chqalarda nafas yo'llarining kasalligini keltirib chiqaradi. Dastlab "sirli cho'chqa kasalligi" va "sirli reproduktiv sindrom" deb nomlangan bu haqda birinchi marta 1987 yilda Shimoliy Amerika (2) va Markaziy Evropa (3). Kasallik Qo'shma Shtatlarning cho'chqa sanoati uchun yiliga 644 million dollarga tushadi va Evropadagi so'nggi hisob-kitoblarga ko'ra, bu har yili deyarli 1,5 milliard evro turadi.

Tasnifi

PRRSV kichkina, o'ralgan RNK virusi.[5] Uning tarkibida bitta simli, ijobiy sezgir RNK mavjud genom hajmi taxminan 15 ga teng kilobazalar.[6] Genom tarkibida to'qqiztasi mavjud ochiq o'qish ramkalari.[7][8]

PRRSV turkumga mansub Arterivirus, oila Arteriviridae, buyurtma Nidovirales.[9] Jinsning boshqa a'zolari Arterivirus quyidagilarni o'z ichiga oladi: ot arterit virusi, simiya gemorragik isitmasi virusi, tebranadigan possum kasalligi virusi va laktat dehidrogenaza ko'taruvchi virus.[6]

Suşlar

PRRSV ikkita asosiy turga bo'linadi, Evropa (shuningdek, 1-toifa deb ham ataladi) va Shimoliy Amerika (shuningdek, 2 turi sifatida ham tanilgan). Har bir PRRSV turi uchun prototip ketma-ketliklari aniqlandi. Evropa PRRSV uchun bu Lelystad virusi (LV), Shimoliy Amerika PRRSV uchun bu VR-2332. Evropa va Shimoliy Amerika PRRSV shtammlari o'xshash klinik simptomlarni keltirib chiqaradi, ammo ikkita alohida virusni anglatadi genotiplar uning genomlari taxminan 40% ga ajralib turadi va shu bilan ushbu virusning kelib chiqishi to'g'risida sir pardasini yaratadi. Turli joylardan ajratilgan viruslarning genetik o'zgarishi [10][11] unga qarshi vaktsinalarni ishlab chiqish qiyinligini oshiradi. Xuddi shunday, ushbu virusning yuqori mutatsion darajasi tufayli diagnostik PCRni aniqlash tahlillarini o'tkazish qiyin, qarang O'tkazib yuborilgan PRRS PCRni aniqlash xavfi.

2000-yillarning boshlarida Xitoyda Shimoliy Amerika genotipining yuqori patogen turi paydo bo'ldi. Ushbu HP-PRRSV shtami boshqa barcha shtammlarga qaraganda ko'proq zaharlidir va butun dunyo bo'ylab Osiyo mamlakatlarida katta yo'qotishlarga olib keladi. Keyinchalik o'rganish shuni ko'rsatdiki, Xitoyda shtammlar guruhining evolyutsiyasi tezlashdi.[12]

Klinik belgilar

PRRS bilan cho'chqa

Subklinik infektsiyalar tez-tez uchraydi, klinik belgilar podada vaqti-vaqti bilan yuzaga keladi. Klinik belgilar orasida abort qilish va o'lik yoki mumiyalangan homilani tug'ish kabi sovunlarda reproduktiv etishmovchilik, quloq va vulva siyanozi mavjud. Neonatal cho'chqalarda kasallik nafas olish qiyinlishuvini keltirib chiqaradi, shu bilan Glasser kasalligi kabi nafas olish yo'llari infektsiyalariga moyilligi oshadi.

Laboratoriya diagnostikasi

Laboratoriya asosida tashxislash testlari PRRS virusi 1980-yillarning oxirlarida dastlabki kashf etilgandan beri sezilarli darajada rivojlandi. Dastlab virusli madaniyat sarum yoki to'qima namunalarida PRRSV ni tasdiqlash uchun ishlatilgan. Ushbu jarayon virusni in-vitro hujayra liniyalarida 3-14 kun yoki undan ko'proq vaqt davomida o'stirishni o'z ichiga oladi. Agar sitopatik ta'sir madaniyat paytida kuzatiladi, madaniyat PRRS virusi sifatida tasdiqlanadi to'g'ridan-to'g'ri lyuminestsent antikor yoki namunani PRRSV borligi uchun ijobiy deb xabar berishdan oldin tasdiqlashning boshqa usuli.

1990-yillarning oxirida, ichki PCR virusni aniqlash uchun ishlatilgan, chunki u ichki bo'lmagan PCRga nisbatan sezgirlikni yaxshilagan.[13] Hozir, miqdoriy PCR O'rnatilgan PCRga qaraganda yaxshi yoki yaxshi sezgirlikni, laboratoriyada tez aylanish vaqtini va yopiq quvurli amplifikatsiya orqali o'zaro ifloslanishning past ko'rsatkichlarini taklif qildi.

15 kb genomga ega bo'lgan RNK virusi sifatida PRRS vaqt o'tishi bilan cho'chqa cho'chqasidan yuqishi sababli nisbatan yuqori tezlikda mutatsiyaga uchraydi.[14] PRRSV nukleotid o'rnini bosishning hisoblangan darajasi hozirgacha RNK virusi bo'yicha eng yuqori ko'rsatkich. U 4.7-9.8 x 10 ga teng−2 / sayt / yil.[15]

Garchi miqdoriy PCR Hozir ishlatilgan testlar yuqori darajaga ega sezgirlik va o'ziga xoslik, bu yaxshilanishlar ba'zilari bilan birga keldi xavf shuningdek. Miqdor PCR Taq-man kimyosidan foydalanish moyil noto'g'ri-salbiy natijada virus mutatsiyaga uchraydi.[16][17][18] Noto'g'ri salbiy natija, test virusning mavjudligini aniqlay olmaganda paydo bo'ladi. Tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, hatto a bitta asosiy juftlik o'zgarishi etiketli prob ostidagi virusli RNKda aniqlanishning buzilishi mumkin.[16] Noto'g'ri manfiyning ushbu o'ziga xos manbasi laboratoriya tomonidan operatorning xatosi bilan bog'liq emas va sinov paytida ma'lum emas.

Quyidagi stsenariy ushbu xavfning cho'chqa go'shti ishlab chiqaruvchilari va laboratoriyalari uchun qanday xavf tug'dirishi mumkinligini ko'rsatadi:

→ Bir podada aylanish jarayonida PRRS virusining turi mutatsiyaga uchraydi. Ushbu shtamm tarqaladi va podada ustun turga aylanadi.

→ Veterinariya shifoxonasi ichidagi (aytaylik, 30 ta) hayvonlar orasida yoki klinik belgilarga reaktsiya sifatida yoki sog'liqni saqlashni muntazam ravishda kuzatish paytida tasodifiy statistikani oladi. 30 ta hayvon tanlangan bo'lsa ham, mutant shtamm barcha namunalarda PRRSV ning ko'p qismini tashkil qiladi. Namunalar PRRS uchun veterinariya diagnostika laboratoriyasiga topshiriladi miqdoriy PCR tez tashxis qo'yish uchun test o'tkazish.
→ Virusli RNKdagi mutatsiya, zond bog'langan virusning kichik mintaqalarida (larida) sodir bo'lgan, shuning uchun laboratoriya signal topmaydi va PRRS virusi yo'qligi uchun namunalarni "salbiy" deb hisoblaydi.
→ Veterinariya laboratoriyasiga yuborilgan tegishli namunalardan boshqa etiologik vositalarni tasdiqlovchi dalillarni topdi va bu fermada klinik belgilarning sababi bo'lishi kerak deb taxmin qildi. Hayvon egalariga, cho'chqalarni namunali fermadan 5000 PRRS-sodda hayvonlar yashaydigan boshqa saytga jo'natishni davom ettirishlari mumkinligi aytilgan.
→ Virus yangi podada aylanib yurganida, mutant virusining ko'proq nusxalari tarqalmoqda. Keyingi namunalar PRRS-salbiy natijalarga olib keladi va natijada klinik belgilar veterinarni boshqa PRRSV test usullarini o'rganishga majbur qiladi. Boshqa usullar PRRSV fermer xo'jaligida belgilar paydo bo'lishini tasdiqlaganida laboratoriya bilan bog'lanamiz.
→ Ushbu nuqtada laboratoriya virusni ajratishga urinishi mumkin (eng yaxshisi 1 hafta), undan RNKni ketma-ketligi (1 hafta) va aniqlanish tahlilida ishlatilgan TaqMan zondlari bilan o'tkazilgan matchlar ketma-ketligini tahlil qilish (1 hafta). ). Endi tahlil zondasi ushbu yangi variantni aniqlashga imkon berish uchun qayta ishlab chiqilishi kerak, shu bilan birga boshqa barcha ma'lum shtammlarga sezgir bo'lib qoladi. Qayta ishlab chiqilgan tahlilni optimallashtirish va tasdiqlash keyinchalik ancha vaqt talab qilishi mumkin.
→ Ayni paytda, indeks ishi suruv endi virus tarqalishini boshqarish uchun qanday boshqarish usullaridan foydalanilishini aniqlash uchun PCR dan foydalana olmaydi. Sinov yangilanmaguncha va tatbiq etilmaguncha, veterinariya tekshiruvi uchun diagnostika laboratoriyasidan foydalanishda davom eta olmaydi, shuning uchun namunalar boshqa joyga yuboriladi va laboratoriyaga bo'lgan ishonch kamayadi.

Ushbu ketma-ket tadbirlar veterinariya, diagnostika laboratoriyasi va hayvon egalari uchun umidsiz va qimmat tadbirdir. Qo'shma Shtatlardagi ko'plab laboratoriyalar o'z laboratoriyalaridan foydalanadilar miqdoriy PCR boshqa diagnostika laboratoriyalariga yangi shtammlar sababli test muvaffaqiyatsizliklarining usuli va aloqasi qiyin. Natijada, yangi shtammlar to'g'risida olingan ma'lumotlar ko'plab diagnostika laboratoriyalarida qo'llanilmaydi. Sinovlarning narxi va yangi virusni tezkor ravishda aniqlash tufayli, PCRning o'zi ko'pincha asosiy skrining vositasi sifatida ishlatiladi. Bitta diagnostik tekshiruvga ortiqcha ishonish (ulardan hech biri 100% sezgir va o'ziga xos emas), muammo hal etilayotganda virus tarqalishining uzoqroq muddatiga olib keladi.

Veterinariya shifokori va ishlab chiqaruvchi

Veterinariya shifokorlari klinik belgilarga diqqat bilan e'tibor berish va bir nechta PRRS diagnostik testlaridan foydalanish orqali ushbu xavf ta'sirini kamaytirishi mumkin. Laboratoriya bilan erta aloqada bo'lish juda zarur, chunki ko'pincha boshqa namunalarni mavjud namunalarda tezda ishlatish mumkin. PRRS virusi mutatsiyasining tezligini hisobga olgan holda, muqobil laboratoriya va testlarni tanlashni o'z ichiga olgan noto'g'ri salbiy hodisalar uchun favqulodda vaziyat rejalari ishlab chiqilishi kerak, boshqa tomondan, fermer xo'jaliklarida PRGSV infektsiyasining ta'sirini kamaytirish, SGK1 va TAP1 chorvachilikda naslchilikka chidamli fenotiplarni qo'llab-quvvatlaydigan chatishtirish va / yoki selektsiya sxemalarida amalga oshirilishi mumkin, chunki ular tirik va yo'qolgan cho'chqalarning barqaror sonini saqlashga hissa qo'shadi, ayniqsa, mumiyaliklar, epidemiyaga qaramay; yaqinda tasvirlanganidek Laplana va boshqalar 2020 yil.[19]

Diagnostika laboratoriyasi

Ba'zi laboratoriyalar tijorat asosida ishlab chiqilgan va texnik xizmat ko'rsatishga o'tdilar miqdoriy PCR assaylar, bu tahliliy yangilanishlar ishini ichki ishlab chiqilgan tahlillarga nisbatan katta qo'shimcha xarajatlarga ega bo'lsa ham, uchinchi tomonga o'tkazadi. So'nggi yillarda ushbu strategiya yangi variantlarga iloji boricha tezroq javob berishga imkon berdi (nashr qilinmagan). Tijorat ishlab chiqaruvchilari tomonidan bir nechta laboratoriyalarda tahlil yangilanishlaridan foydalangan holda, barcha mijozlar laboratoriyalari uchun aniqlash qobiliyatlari yaxshilanishi mumkin. Ushbu yondashuvning boshqa tomoni shundaki, agar barcha laboratoriyalarda bir xil tahlil o'tkazilsa, muqobil tahlil zarur bo'lganda veterinariya shifokorlari uchun cheklangan imkoniyatlar mavjud.

Tergov paytida ilgari joylashtirilgan PCR kabi texnologiyalar ko'pincha chaqiriladi agar laboratoriya ularni bajarish imkoniyatini saqlab qolgan bo'lsa. Ushbu oldingi usullardan foydalangan holda, laboratoriya xodimlari aniqroq aniqlash qobiliyatlari tufayli yangi shtammni tezroq aniqlaydilar.

Boshqaruv

Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi (PRRS) - bu murakkab kasallik. O'zgartirilgan jonli vaktsinalar (MLV) vaktsinalari uni nazorat qilishning asosiy immunologik vositasidir.[20][21]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ "2017.012-015S" (XLSX). Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mita. Olingan 23 sentyabr 2019. Nidovirales Arteriviridae Porartevirus Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi 1 0 M96262.2 Nidovirales Arnidovirineae Arteriviridae Variarterivirinae Betaarterivirus Eurpobartevirus Betaarterivirus suid 1 0 M96262.2 PRRSV-1 turlarini qayta nomlash va ko'chirish
  2. ^ Brinton, M. A .; va boshq. (2015 yil 10-noyabr). "Oilada Arteriviridae 10 turni yarating (1 ta tayinlanmagan, 9 ta turda Arterivirus) va bitta turni qayta nomlash " (PDF). Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mita. Olingan 23 sentyabr 2019.
  3. ^ ICTV 8th Report Fauquet, C., Mayo, MA, Maniloff, J., Desselberger, U. and Ball, LA, Eds. (2005). Virus taksonomiyasi: Xalqaro viruslar taksonomiyasi qo'mitasining sakkizinchi ma'ruzasi. Elsevier Academic Press. https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%208th%20Report.pdf
  4. ^ ICTV 7-hisoboti van Regenmortel, MHV, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Carstens, EB, Estes, MK, Lemon, SM, Maniloff, J., Mayo, MA, McGeoch, DJ, Pringle, CR va Wickner, RB (2000) ). Viruslar sistematikasi. Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mitaning ettinchi ma'ruzasi. Academic Press, San-Diego.1162 bet. https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%207th%20Report.pdf
  5. ^ Pileri, E; Mateu, E (28 oktyabr 2016). "Cho'chqalar va fermer xo'jaliklari o'rtasida tarqaladigan cho'chqa reproduktiv va nafas olish sindromi virusini ko'rib chiqish va emlashga ta'siri". Veterinariya tadqiqotlari. 47 (1): 108. doi:10.1186 / s13567-016-0391-4. PMC  5086057. PMID  27793195.
  6. ^ a b Kappes, MA; Faaberg, KS (may, 2015). "PRRSV tuzilishi, replikatsiyasi va rekombinatsiyasi: fenotipning kelib chiqishi va genotip xilma-xilligi". Virusologiya. 479–480: 475–86. doi:10.1016 / j.virol.2015.02.012. PMID  25759097.
  7. ^ Meulenberg, J. J .; Xulst, M. M .; de Meijer, E. J.; Moonen, P. L .; den Besten, A .; de Kluyver, E. P.; Vensvoort, G.; Moormann, R. J. (yanvar 1993). "Cho'chqa epidemiyasi aborti va nafas olish sindromi (PEARS) ning qo'zg'atuvchisi Lelystad virusi LDV va EAV bilan bog'liq". Virusologiya. 192 (1): 62–72. doi:10.1006 / viro.1993.1008. PMC  7173055. PMID  8517032.
  8. ^ Li, C .; Yoo, D. (noyabr 2005). "Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi kichkina konvert oqsilining sistein qoldiqlari virus yuqtirish uchun muhim emas". Umumiy virusologiya jurnali. 86 (11): 3091–6. doi:10.1099 / vir.0.81160-0. PMID  16227232.
  9. ^ Balasuriya va Snayder (2008). "Arteriviruslar". Hayvonlarning viruslari: Molekulyar biologiya. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-22-6.
  10. ^ Shi M, Lam TT, Hon CC, Murtaugh MP, Devies PR, Hui RK, Li J, Vong LT, Yip CW, Jiang JW, Leung FC (sentyabr 2010). "Shimoliy Amerikadagi cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi viruslari 2-turi, filogeniyaga asoslangan evolyutsion, demografik va geografik diseksiya". Virusologiya jurnali. 84 (17): 8700–8711. doi:10.1128 / JVI.02551-09. PMC  2919017. PMID  20554771.
  11. ^ Paploski IA, Corzo C, Rovira A, Murtaugh MP, Sanhueza JM, Vilalta C, Shreder DC, VanderWaal K (noyabr 2019). "Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusi bilan birgalikda aylanadigan nasllarning vaqtinchalik dinamikasi". Mikrobiologiyadagi chegara. 1 (10): 2486. doi:10.3389 / fmicb.2019.02486. PMC  6839445. PMID  31736919.
  12. ^ Song J, Shen D, Cui J, Zhao B (2010 yil oktyabr). "Xitoyda so'nggi avj olish paytida PRRSV ning tezlashtirilgan evolyutsiyasi". Virus genlari. 41 (2): 241–5. doi:10.1007 / s11262-010-0507-2. PMID  20652733.
  13. ^ Kristofer-Xennings, Jeyn; va boshq. (1995 yil iyul). "PCR yordamida cho'chqa reproduktiv va nafas olish sindromi virusini cho'chqa urug'i urug'idan aniqlash". Klinik mikrobiologiya jurnali. 33 (7): 1730–1734. doi:10.1128 / JCM.33.7.1730-1734.1995. PMC  228258. PMID  7665637.
  14. ^ Shi, Mang; va boshq. (2010). "PRRSV ning molekulyar epidemiologiyasi: filogenik istiqbol". Viruslarni o'rganish. 154 (1–2): 7–17. doi:10.1016 / j.virusres.2010.08.014. PMID  20837072.
  15. ^ Murtau, Maykl; va boshq. (2010). "Cho'chqaning reproduktiv va nafas olish sindromi virusining tobora kengayib borayotgan xilma-xilligi". Viruslarni o'rganish. 154 (1–2): 18–30. doi:10.1016 / j.virusres.2010.08.015. PMID  20801173.
  16. ^ a b Klungtong, Chonticha; va boshq. (2010). "A / H1N1 / 2009 pandemik grippining sezgirligiga primer va prob-shablon nomuvofiqliklarining real vaqtda RT-PCR virusi aniqlanishining ta'siri". Klinik virusologiya jurnali. 48 (2): 91–95. doi:10.1016 / j.jcv.2010.03.012. PMID  20413345.
  17. ^ Peyn, Maykl; va boshq. (Avgust 2010). "Roche Cobas AmpliPrep / Cobas TaqMan OIV-1 testini baholash va tahlil natijalariga ta'sir ko'rsatadigan noyob polimorfizmlarni aniqlash". Klinik mikrobiologiya jurnali. 48 (8): 2852–2858. doi:10.1128 / JCM.00776-10. PMC  2916612. PMID  20573864.
  18. ^ Toplak, I .; va boshq. (2011). "Sloveniyada PRRSV ning genetik jihatdan xilma-xilligini aniqlash va to'rtta molekulyar testning sezgirligiga ta'siri". Virusli usullar jurnali. 179 (1): 51–56. doi:10.1016 / j.jviromet.2011.09.019. PMID  22001545.
  19. ^ Laplana, Marina. "Reproduktiv sho'rlarda PRRSV tarqalishi paytida SGK1 va TAP1 DNK markerlarining chidamliligi ta'siri". Hayvonlar. 10 (5): 902. doi:10.3390 / ani10050902. PMID  32456052.
  20. ^ Kruz, Jazmina L.G.; Zuniga, Soniya; Becares, Martina; Sola, Izabel; Ceriani, Xuan E.; Plana, Xuan; Enjuanes, Luis (2010). "PRRSV dan himoya qilish uchun vektorli vaktsinalar". Viruslarni o'rganish. 154 (1–2): 150–160. doi:10.1016 / j.virusres.2010.06.017. PMC  7114413. PMID  20600388.
  21. ^ Renukaradxya, GJ; Men, XJ; Kalvert, JG; Uyingizda, M; Lager, KM (2015). "Jonli cho'chqa reproduktiv va nafas olish sindromi virusiga qarshi emlashlar: hozirgi holati va kelajakdagi yo'nalishi". Vaktsina. 33 (33): 4069–80. doi:10.1016 / j.vaccine.2015.06.092. PMID  26148878.

Tashqi havolalar