Doksorubitsinning biosintezi - Biosynthesis of doxorubicin

Doksorubitsinning kimyoviy tuzilishi.

Doksorubitsin (DXR) 14-gidroksillangan versiyasi daunorubitsin, uning ichida DXR ning bevosita prekursori biosintez yo'l. Daunorubitsin a sifatida ko'proq topilgan tabiiy mahsulot chunki u bir necha xil tomonidan ishlab chiqariladi yovvoyi turi shtammlar ning streptomitsiyalar. Aksincha, faqat bitta noma'lumyovvoyi turi turlari, streptomitsiyalar peucetius pastki turlari sezyus ATCC 27952 dastlab keng tarqalgan doksorubitsin ishlab chiqarishga qodir ekanligi aniqlandi.[1] Ushbu shtamm Arkamone va boshqalar tomonidan yaratilgan. 1969 yilda mutatsiya a zo'riqish daunorubitsin ishlab chiqaradi, ammo DXR emas, hech bo'lmaganda aniqlanadigan miqdorda.[2] Keyinchalik Xatchinson guruhi buni maxsus atrof-muhit sharoitida yoki joriy etish orqali ko'rsatdi genetik modifikatsiyalar, ning boshqa turlari streptomitsiyalar doksorubitsin ishlab chiqarishi mumkin.[3] Uning guruhida ham bor klonlangan ko'plari genlar DXR ishlab chiqarish uchun zarur, garchi ularning barchasi to'liq tavsiflanmagan bo'lsa ham. 1996 yilda Strohl guruhi A, the doksini topdi, ajratdi va xarakterladi gen kodlash ferment daunorubitsinni DXR ga aylantiradigan narsa.[4] 1999 yilga kelib ular rekombinant Dox A, a ishlab chiqarishdi Sitoxrom P450 oksidaza va buni topdi kataliz qiladi DXR-da bir nechta qadamlar biosintez jumladan, daunorubitsinga olib boradigan qadamlar.[5] Bu juda muhim edi, chunki barcha daunorubitsin ishlab chiqaradigan shtammlar zarur ekanligi aniq bo'ldi genlar ikkalasining terapevtik jihatdan ahamiyati ko'proq bo'lgan DXR ishlab chiqarish. Xatchinson guruhi DXR rentabelligini oshirish usullarini ishlab chiqishga kirishdi fermentatsiya tijorat ishlab chiqarishida ishlatiladigan jarayon, faqat Dox A kodlashni joriy qilish bilan emas plazmidlar, shuningdek, o'chirish uchun mutatsiyalarni kiritish orqali fermentlar DXR prekursorlarini unchalik foydali bo'lmagan mahsulotlarga, masalan, bumitsinga o'xshash shunt qiladi glikozidlar.[1] Ba'zi uchta mutantlar ham haddan tashqari ifoda etilgan Dox A, DXR rentabelligini ikki baravar oshirishga muvaffaq bo'ldi. Bu akademik qiziqishdan ko'proqdir, chunki o'sha paytda DXR har bir kg uchun taxminan 1,37 million dollarni tashkil etgan va 1999 yilda ishlab chiqarish yiliga 225 kg ni tashkil etgan.[6] Ishlab chiqarishning yanada samaraliroq texnikasi narxni kg uchun 1,1 million dollarga tushirdi.lipozomal shakllantirish. DXR ishlab chiqarilishi mumkin bo'lsa-da yarim sintetik daunorubitsindan, jarayon o'z ichiga oladi elektrofil bromatsiya va bir necha qadam va hosil kam.[7] Daunorubitsin tomonidan ishlab chiqarilganligi sababli fermentatsiya, agar ideal bo'lsa bakteriyalar DXR sintezini yanada samarali yakunlashi mumkin.

Umumiy nuqtai

The antrasiklin doksorubitsin (DXR) skeleti a tomonidan ishlab chiqarilgan II turdagi poliketid sintaz (PKS) ichida streptomyces peucetius. Birinchidan, 21-uglerodli dekaketid zanjiri (1. (1-rasm)) bitta 3-uglerodli propionil guruhidan sintez qilinadi. propionil-CoA va 9 ketma-ketlikdan olingan 9 ta 2-uglerodli birlik (takroriy ) dekarboksilik kondensatlar ning malonil-CoA. Har biri malonil-CoA o'sib borayotgan poliketid zanjiriga 2-uglerodli ketid birligini qo'shadi. Har bir qo'shimcha an dan tashkil topgan "minimal PKS" tomonidan katalizlanadi asil tashuvchisi oqsili (ACP), a ketosintaz (KS) / zanjir uzunlik koeffitsienti (CLF) heterodimer va a malonil-Koa: ACP asiltransferaza (MAT). (10-rasmning yuqori qismiga qarang.

Ushbu jarayon juda o'xshash yog 'kislotalari sintezi, tomonidan yog 'kislotasi sintezlari va I toifa uchun poliketid sintezi. Ammo, aksincha yog 'kislotasi sintez, keto guruhlari O'sib borayotgan poliketid zanjirining zanjiri cho'zilganda o'zgartirilmaydi va ular odatda to'liq bo'lmaydi kamaytirilgan. I turdagi PKS tizimlaridan farqli o'laroq, sintetik fermentlar (KS, CLF, ACP va AT) biriktirilmagan kovalent ravishda bir-biriga bog'langan va hatto poliketid zanjiri sintezining har bir bosqichida bog'liq bo'lib qolmasligi mumkin.

DXR ning 21-uglerodli dekaketid zanjiri qurib bo'lingandan so'ng, ketma-ket modifikatsiyalari amalga oshiriladi tetratsiklik antrasiklin aglikon (holda glikozid biriktirilgan).[8] The daunosamin amino shakar, qo'shilishi bilan faollashtiriladi Tiamin difosfat TDP, yana bir qator reaktsiyalarda yaratilgan.[9] U qo'shilgan antrasiklin birinchi ishlab chiqarish uchun aglikon va qo'shimcha modifikatsiyalar amalga oshiriladi daunorubitsin keyin DXR.[10]Kamida 3 ta gen klasterlari DXR uchun muhim biosintez: dps genlar belgilaydigan fermentlar chiziqli poliketid zanjiri sintezi va uning birinchi siklizatsiyasi uchun zarur bo'lgan dnr klasteri modifikatsiyaning qolgan modifikatsiyalari uchun javobgardir. antrasiklin tarkibiga kiruvchi dnm genlari va tuzilishi amino shakar, daunosamin, sintez. Bundan tashqari, "o'z-o'ziga qarshilik" to'plami mavjud genlar ning toksik ta'sirini kamaytirish uchun antrasiklin ishlab chiqarish bo'yicha organizm. Bitta mexanizm membrana sabab bo'lgan nasos oqish hujayradan DXR ning (dr lokuslar ).[11] Ushbu murakkab molekulalar faqat ma'lum sharoitlarda foydalidir va ishlab chiqarish uchun juda ko'p energiya talab etiladi, ularning sintezi qat'iy tartibga solinadi.[12]

Poliketid zanjiri sintezi

Doksorubitsin ixtisoslashgan mutaxassis tomonidan sintezlanadi poliketid sintaz.

DXR sintezidagi dastlabki voqea bu tanlovdir propionil-CoA starter birligi va uning dekarboksilik olingan ikki karbonli ketid birligiga qo'shimcha malonil-CoA beshta uglerodli B-ketovaleril ACP ni ishlab chiqarish. Beshta uglerod diketidi ACP uchun sistein sulfhidril KS faol saytidagi guruh, tomonidan tioester almashinuvi va ACP zanjirdan ajralib chiqadi. Bepul ACP boshqasini oladi malonat guruhi malonil-CoA, shuningdek tomonidan tioester almashinuvi, ozod qilinishi bilan CoA.

Shakl 1. 2-uglerodli dekaketid zanjiri sintezi mexanizmi va keyinchalik katlama va doksorubitsin kashshofi, b-rhodomitsinon ishlab chiqarish uchun modifikatsiyalar.

ACP yangisini olib keladi malonat qaerda KS ning faol saytiga dekarboksillangan, ehtimol CLF yordamida subbirlik va 7 ta uglerodli triketid ishlab chiqarish uchun qo'shilib, endi ACP ga o'rnatildi (1-rasmning yuqori qismiga qarang). Shunga qaramay ACP zanjirni KS kichik birligiga uzatadi va jarayon dekaketid tugaguniga qadar takroriy takrorlanadi.

Ko'pgina II turdagi tizimlarda boshlang'ich voqea AC ning etkazib berishidir atsetat dan olingan birlik atsetil-KoA, uchun faol sayt ketosintaz (KS) subbirlik KS / CLF heterodimerining II tip PKS tizimlari uchun standart rejim asetatning primer birligi sifatida qo'shilishidir va bu "minimal PKS" DXR uchun amal qiladi. Boshqacha qilib aytganda, ushbu tizimdan KS / CLF / ACP (Dps A, B va G) ta'siri 21- hosil qilmaydi.uglerod dekaketidlar, ammo uning o'rniga 20 uglerodli dekaketidlar, chunki asetat "afzal" boshlovchi hisoblanadi. Belgilash jarayoni propionat to'liq tushunilmagan, ammo bu propionil-KoA uchun selektiv ketosintaz yoki asiltransferaza vazifasini o'tashi mumkin bo'lgan Dps C qo'shimcha oqsiliga bog'liqligi aniq va ehtimol Dps D o'z hissasini qo'shadi.[13][14]

In vitro sharoitda poliketid ishlab chiqarish uchun maxsus MAT tarqatilishi mumkinligi aniqlandi.[15] PKS MAT-ni o'zidan "qarz" qilishi mumkin yog 'kislotasi sintazasi va bu ACPni qabul qilishning asosiy usuli bo'lishi mumkin malonat guruhi DXR biosintezida. Bundan tashqari, ajoyib dalillar mavjud [16] bu "o'z-o'zini malonilatsiya" II turdagi ACPlarga xos xususiyatdir. Xulosa qilib aytganda, berilgan II turdagi PKS o'zining MAT (lar) ini taqdim qilishi mumkin, u FASdan qarz olishi yoki ACP "o'z-o'zini malonilat" qilishi mumkin.

Xuddi shu KS / CLF / ACP uchlamchi kompleksi butun katalitik tsikl davomida to'liq uzunlikdagi poliketid zanjirining o'sishini kuchaytiradimi yoki ACP har bir kondensatsiya reaktsiyasidan keyin ajralib chiqadimi, noma'lum.[17] 2.0 -Å KS / CLF dps-lariga juda o'xshash aktinorodin KS / CLF rezolyutsiyasi tuzilishi poliketidlarning cho'zilganligini ko'rsatadi. amfipatik KS va CLF subbirliklarining interfeysida hosil bo'lgan tunnel.[18] Tunnel taxminan 17-Å uzoq va bir tomoni ko'p zaryadlangan aminokislotalar qoldiqlari stabillashadigan ko'rinadi karbonil zanjirning guruhlari, boshqa tomon esa hidrofob. Ushbu tuzilma ikkala subbirlik zanjirni cho'zish uchun nima uchun zarurligini va reaktiv o'sib boruvchi zanjirni tasodifiy ta'sirdan qanday himoya qilishini tushuntiradi o'z-o'zidan reaktsiyalar u tartibli siklizatsiya uchun to'g'ri joylashguncha. Tuzilishi, shuningdek, zanjir uzunligini tartibga solish mexanizmini taklif qiladi. Aminokislota yon guruhlar tunnelga cho'zilib, "darvoza" vazifasini bajaradi. Bir nechta katta miqdordagi qoldiqlar zanjir orqali o'tib ketishi mumkin, bu esa tugatishga olib keladi. Ushbu struktura asosida tunnel qoldiqlariga kiritilgan o'zgartirishlar yakuniy mahsulotning zanjir uzunligini o'zgartira oldi.[19] Final kondensatsiya poliketid zanjirining "tokka" tushishiga olib keladi molekula ichi C-12 hujumi metilen karbanion tomonidan yaratilgan ferment katalizlangan proton olib tashlash va barqarorlashtirish elektrostatik tunneldagi o'zaro ta'sirlar, C-7 da karbonil (1-rasmda 3 ga qarang). Ushbu tunnel molekula ichiga yordam berdi aldol kondensatsiyasi zanjir hali ham tunnelda bo'lganida birinchi siklizatsiyani ta'minlaydi. Xuddi shu C-7 / C-12 hujumi biosintez shunga o'xshash tarzda DXR.

12-deoksialalkon kislotasiga o'tish

21-uglerodli dekaketid 3 bosqichda DXR biosintezidagi birinchi erkin oson ajratilgan oraliq bo'lgan 12-deoksialalkonik kislota (5) ga aylanadi. Ushbu bosqichlar dpsdagi oxirgi 3 ferment tomonidan katalizlanadi gen klasteri va ularning bir qismi hisoblanadi poliketid sintaz.

Dekaketid hali ham KS / CLF hetero bilan bog'liq bo'lsa-dadimer 9-karbonil guruhi yordamida 9-ketoreduktaza yordamida Dps E kamayadi NADPH sifatida kamaytiruvchi vosita /gidrid donor. Dps F, "birinchi qo'ng'iroq siklaza ”/ Aromataz, juda o'ziga xos va ilgari C-9 keto-qaytarilishini talab qiladigan C-7 / C-12 siklazalar oilasida.[20] Ushbu ikki reaktsiya, poliketid zanjiri hali ham qisman KS / CLF tunnelida bo'lganida va zanjirni kovalent bog'lanishidan KS yoki ACP ga nima ajratib turishi ma'lum bo'lmagan paytda sodir bo'lishi seziladi. Agar Dps F siklaza tomonidan inaktiv qilinadi mutatsiyalar yoki genlarni yo'q qilish, zanjir velosipedga aylanadi o'z-o'zidan yilda tasodifiy moda. Shunday qilib, Dps F tasodifiy bo'lmagan siklizatsiyani ta'minlash uchun "shaperone" yoki poliketidni katlamada yordam beradi, deb o'ylashadi, bu reaktsiya energetik jihatdan qulay va keyingi natijalarga olib keladi. suvsizlanish va natijada aromatizatsiya.[21]

Keyin, Dps Y regioselektiv ravishda keyingi ikkitasining shakllanishiga yordam beradi uglerod-uglerod aloqalari va keyin kataliz qiladi suvsizlanish olib boradi aromatizatsiya berish uchun uzuklardan biri (5).

B-rodomitsinonga o'tish

Keyingi reaktsiyalarni dnrdan chiqqan fermentlar katalizlaydi gen klasteri. Dnr G, C-12 oksigenaza (raqamlash uchun (5) ga qarang) a keto guruhi foydalanish molekulyar kislorod. Bu "antron turi oksigenaza "deb nomlangan kinon - monooksigenazni shakllantirish, ularning aksariyati "tikuvchilik" fermentlar "ichida biosintez ning bir nechta turlari xushbo'y poliketid antibiotiklar. Ularda yo'q kofaktorlar: yo'q flavinlar, metallar yoki energiya manbalari. Ularning mexanizm yomon tushunilgan, ammo "oqsil radikal ".[22]

Alkalonik kislota (6), a kinon, bo'ladi mahsulot. Dnr C, alkalonik kislota-O-metiltransferaza metilatlar The karboksilik kislota oxiri molekula shakllantirish Ester, foydalanib S-adenosil metionin (SAM) sifatida kofaktor /metil guruhi donor. Mahsulot alkalonik kislota metil esteridir (7). The metil guruhi keyinchalik olib tashlanadi, ammo u terminalga hujumini engillashtiradigan qo'shni metilen ko'prigini faollashtirishga xizmat qiladi karbonil guruh, DnrD tomonidan katalizlangan reaktsiya.

Dnr D, to'rtinchi halqa siklazasi (AAME siklaza) an-ni katalizlaydi molekula ichi aldol qo'shilishi reaktsiya. Hech qanday kofaktor talab qilinmaydi va na aromatizatsiya, na suvsizlanish sodir bo'ladi. Oddiy tayanch katalizlangan mexanizm taklif etiladi.[23] Mahsulot aklaviketon (8).

Dnr H, aklaviketon reduktaza, stereospetsifik ravishda aklavinon berish uchun yangi to'rtinchi halqaning 17-keto guruhini 17-OH guruhiga kamaytiradi (9). Bu yangisini taqdim etadi chiral markazi va NADPH kofaktor hisoblanadi.

Dnr F, aklavinone-11-gidroksilaza, a FAD monooksigenaza ishlatadigan NADPH faollashtirish molekulyar kislorod keyingi uchun gidroksillanish. b-rodomitsinon (10) mahsulotdir.[24]

Doksorubitsinga o'tish

Dnr S, daunosamin glikoziltransferaza kataliz qiladi TDP qo'shilishi faollashtirildi glikozid, L-daunosamin -TDP rodomitsin D berish uchun b-rodomitsinonga (2-rasm). TDP ning chiqarilishi reaktsiyani oldinga siljitadi. Ferment bor ketma-ketlik o'xshashligi PKS II turiga qo'shilgan boshqa "noodatiy shakar" larning glikoziltransferazlariga xushbo'y mahsulotlar.[25]

Shakl 2. b-rodomitsinonning glikosilatsiyasi va keyinchalik doksorubitsinga aylanishi

Dnr P, rodomitsin D metilesteraza, o'chiradi metil guruhi ilgari DnrC tomonidan qo'shilgan. Dastlab u qo'shni metilen ko'prigini faollashtirishga xizmat qildi va bundan keyin uning oldini oldi karboksil guruhi C-10 uglerodini tark etishi (2-rasmga qarang). Edi karboksil guruh bo'lmagan esterlangan to'rtinchi halqa siklizatsiyasidan oldin, [ CO2 a shakllanishi tomonidan afzal ko'rilgan bo'lar edi velosiped xushbo'y tizim. C-7 pasayishidan keyin va glikosilatsiya, C-8 metilen ko'prigi endi faollashtirilmagan deprotonatsiya, shu bilan aromatizatsiyani kamroq qilish.[23] Ajratib bo'lmaydigan narsalarga e'tibor bering oraliq, raqamlash bilan, 2-rasmdagi 3-molekula. Raqamlash tizimi juda g'alati va dastlabki nomenklaturaning izi. The dekarboksilatsiya ning oraliq o'z-o'zidan yoki Dnr P ta'sirida paydo bo'lib, 13-deoksikarminomitsinni beradi.

A kristall tuzilishi, bog'langan mahsulotlar bilan, aklacinomitsin metilesteraza, 53% bo'lgan [ferment] ketma-ketlik gomologiyasi Dnr P ga, dan streptomitsiyalar binafsha rang, hal qilindi.[26] U xuddi shu reaktsiyani katalizatsiyalashga qodir va klassikadan foydalanadi Ser -Uning -Asp katalitik uchlik bilan serin vazifasini bajaruvchi nukleofil va gly -uchrashdi stabillashishini ta'minlash o'tish holati shakllantirish orqali "oksiyan teshigi " faol sayt aminokislotalar Dnr P bilan deyarli bir xil va mexanizmi deyarli bir xil, ammo Dox A biosintez sxemasida keltirilgan bo'lsa ham (2-rasm), Dnr K, karminomitsin 4-O-metiltransferaza O- ga qodirmetilat 4-gidroksil har qanday guruh glikozidlar 2. rasmda 2.35 piksellar sonini kristall tuzilishi ning ferment yaqinda bog'langan mahsulotlar bilan hal qilindi.[27] Mahsulotlarning yo'nalishi a ga mos keladi SN2 mexanizmi metil o'tkazish. Saytga yo'naltirilgan mutagenez potentsial kislota / asosning qoldiqlar ichida faol sayt ta'sir qilmadi kataliz Dnr K katta ehtimollik bilan harakat qiladi degan xulosaga keladi entropik ferment bu tezlikni oshirish asosan yo'naltirilganlik va yaqinlik ta'siriga bog'liq. Bu kislota / asos katalizining tezlikni oshirishda muhim hissa bo'lishi isbotlangan boshqa ko'plab O-metiltransferazlardan farqli o'laroq. oksidlanish yilda streptomitsiyalar peucetius. Kam miqdordagi DXR ishlab chiqarilishi, asosan, Dox A darajasining pastligi yoki uning noto'g'ri ishlashi bilan bog'liq emas, balki 2-rasmda ko'rsatilgan yo'ldan chetga yo'naltirilgan ko'plab mahsulotlar mavjud. glikozidlar shunt fermentlarining potentsial maqsadidir, ularning ba'zilari dnr mahsulotidir gen klasteri. Mutatsiyalar Ushbu fermentlarning DXR ishlab chiqarilishini sezilarli darajada kuchaytiradi.[1] Bundan tashqari, Dox A juda past ko'rsatkichga ega kkat / km C-14 uchun qiymat oksidlanish (130 / M) C-13 oksidlanishiga nisbatan (ba'zi substratlar uchun 22000 / M gacha). Genetik manipulyatsiya haddan tashqari ta'sir qilish Dox A, shuningdek, shunt fermentlari genlari bir vaqtning o'zida faolsizlantirilsa, hosilni ko'paytirdi. sitoxrom P-450 monooksigenaza bu keng substratning o'ziga xosligi, katalizator antrasiklin gidroksillanish C-13 va C-14 da (2-rasm). The ferment uchun mutlaq talab mavjud molekulyar kislorod va NADPH.[5] Dastlab, C-13 da ketma-ket ikkita oksidlanish, so'ngra konversiyalashgan C-14 ning bitta oksidlanishi amalga oshiriladi. daunorubitsin doksorubitsinga.

Adabiyotlar

  1. ^ a b v Lomovskaya N, Otten SL, Doi-Katayama Y va boshq. (1999). "Streptomyces peucetius-da doksorubitsinning ortiqcha ishlab chiqarilishi: dnrU ketoreduktaza va dnrV genlari va doxA sitoxrom P-450 gidroksilaza genini klonlash va tavsifi". J. Bakteriol. 181 (1): 305–18. doi:10.1128 / JB.181.1.305-318.1999. PMC  103563. PMID  9864344.
  2. ^ Arkamone F, Kassinelli G, Fantini G va boshq. (1969). "Adriamitsin, 14-gidroksidaunomitsin, S. peucetius var. Caesius yangi antitumor antibiotik". Biotexnol. Bioeng. 11 (6): 1101–10. doi:10.1002 / bit.260110607. PMID  5365804.
  3. ^ Grimm A, Madduri K, Ali A, Xatchinson CR (1994). "Doksorubitsin poliketid sintazini kodlovchi Streptomyces peucetius ATCC 29050 genlarining xarakteristikasi". Gen. 151 (1–2): 1–10. doi:10.1016/0378-1119(94)90625-4. PMID  7828855.
  4. ^ Dikkens ML, Strohl WR (1996). "Streptomyces lividans TK24 daunomitsinni doksorubitsinga aylantirish qobiliyatini beradigan C5 shtammini Streptomyces sp. Genidan ajratish va tavsifi". J. Bakteriol. 178 (11): 3389–95. doi:10.1128 / jb.178.11.3389-3395.1996. PMC  178102. PMID  8655530.
  5. ^ a b Walczak RJ, Dikkens ML, Priestley ND, Strohl WR (1999). "Rekombinant Streptomitsiyalarning tozalanishi, xususiyatlari va tavsifi C5 DoxA shtammi, sitoxrom P-450 Doksorubitsin biosintezidagi bir necha bosqichlarni katalizatori". J. Bakteriol. 181 (1): 298–304. doi:10.1128 / JB.181.1.298-304.1999. PMC  103562. PMID  9864343.
  6. ^ Xatchinson CR, Kolombo AL (1999). "Streptomyces peucetius-da doksorubitsin ishlab chiqarishning genetik muhandisligi: sharh". J. Ind. Mikrobiol. Biotexnol. 23 (1): 647–52. doi:10.1038 / sj.jim.2900673. PMID  10455495.
  7. ^ Lown JW (1993). "Antratsiklin va antrakinon saratonga qarshi vositalar: hozirgi holat va so'nggi o'zgarishlar". Farmakol. Ther. 60 (2): 185–214. doi:10.1016 / 0163-7258 (93) 90006-Y. PMID  8022857.
  8. ^ Xatchinson CR (1997). "Daunorubitsin va Tetratsenomitsin S ning biosintetik tadqiqotlari". Kimyoviy sharhlar. 97 (7): 2525–2536. doi:10.1021 / cr960022x. PMID  11851469.
  9. ^ Otten SL, Gallo MA, Madduri K, Liu X, Xatchinson CR (1997). "Daunorubitsin prekursori timidin difosfo-L-daunosamin biosintezi uchun zarur bo'lgan uchta fermentni kodlovchi Streptomyces peucetius dnmZUV genlarini klonlash va tavsifi". J. Bakteriol. 179 (13): 4446–50. PMC  179277. PMID  9209071.
  10. ^ Dikkens ML, Priestley ND, Strohl WR (1997). "Epsilon-rodomitsinon glikozidini in vivo jonli ravishda va dokorubitsinga biokonversiyasi: DauP, DauK va DoxA funktsiyalari". J. Bakteriol. 179 (8): 2641–50. PMC  179014. PMID  9098063.
  11. ^ Gandlur SM, Vey L, Levin J, Rassell J, Kaur P (2004). "Streptomyces peucetius doksorubitsin tashuvchisi DrrB oqsilining membrana topologiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (26): 27799–806. doi:10.1074 / jbc.M402898200. PMID  15090538.
  12. ^ Jiang H, Xatchinson CR (2006). "Streptomyces peucetius-da doksorubitsin biosintezining teskari aloqasini tartibga solish". Res. Mikrobiol. 157 (7): 666–74. doi:10.1016 / j.resmic.2006.02.004. PMID  16545946.
  13. ^ Bao V, Sheldon PJ, Xutchinson CR (1999). "Streptomyces peucetius DpsC beta-ketoasilning tozalanishi va xususiyatlari: II turdagi poliketid biosintezi uchun propionat-starter birligini ko'rsatadigan asil tashuvchisi protein sintaz III". Biokimyo. 38 (30): 9752–7. doi:10.1021 / bi990751 soat. PMID  10423255.
  14. ^ Bao V, Sheldon PJ, Wendt-Pienkowski E, Xutchinson CR (1999). "Streptomyces peucetius dpsC geni Daunorubitsin poliketidining biosintezida boshlang'ich birligi tanlovini aniqlaydi". J. Bakteriol. 181 (15): 4690–5. PMC  103607. PMID  10419974.
  15. ^ Matharu AL, Kox RJ, Krosbi J, Bayrom KJ, Simpson TJ (1998). "Streptomyces coelicolor dan minimal aktinorhodin poliketid sintazida in vitro poliketid sintezi uchun MCAT talab qilinmaydi". Kimyoviy. Biol. 5 (12): 699–711. doi:10.1016 / S1074-5521 (98) 90663-9. PMID  9862793.
  16. ^ Artur CJ, Szafranska A, Evans SE va boshqalar. (2005). "O'z-o'zini malonilizatsiya kimyoviy sintez qilingan II turdagi poliketid sintaz asil tashuvchisi oqsilining o'ziga xos xususiyati". Biokimyo. 44 (46): 15414–21. doi:10.1021 / bi051499i. PMID  16285746.
  17. ^ Dreier J, Xosla S (2000). "II turdagi poliketid sintazni mexanik tahlil qilish. Beta-ketoatsil sintaza zanjiri uzunligi omil heterodimeridagi konservalangan qoldiqlarning o'rni". Biokimyo. 39 (8): 2088–95. doi:10.1021 / bi992121l. PMID  10684659.
  18. ^ Keatinge-Clay AT, Maltby DA, Medzihradsky KF, Khosla C, Stroud RM (2004). "Antibiotik ishlab chiqaradigan zavod harakatga tushdi". Nat. Tuzilishi. Mol. Biol. 11 (9): 888–93. doi:10.1038 / nsmb808. PMID  15286722.
  19. ^ Tang Y, Tsay SC, Xosla S (2003). "Zanjir uzunlik koeffitsienti bo'yicha poliketid zanjiri uzunligini boshqarish". J. Am. Kimyoviy. Soc. 125 (42): 12708–9. doi:10.1021 / ja0378759. PMID  14558809.
  20. ^ Meurer G, Gerlitz M, Wendt-Pienkowski E, Vining LC, Rohr J, Xutchinson CR (1997). "Ikkinchi turdagi poliketidli sintazlar, siklazlar va ketoreduktazalar chiziqli va burchakli dekapolyketidlarning biosintezida kontekstga bog'liq xatti-harakatlarni namoyish etadi". Kimyoviy. Biol. 4 (6): 433–43. doi:10.1016 / S1074-5521 (97) 90195-2. PMID  9224566.
  21. ^ Vohlert SE, Vendt-Pienkovski E, Bao V, Xatchinson CR (2001). "Daunorubitsin poliketid sintaz genlari tomonidan aromatik minimal poliketidlarni ishlab chiqarish geterologik DpsY va JadI siklazlarining mos kelmasligini ochib beradi". J. Nat. Mahsulot. 64 (8): 1077–80. doi:10.1021 / np010067f. PMID  11520231.
  22. ^ Fetzner S (2002). "Oksigenazlar kofaktorlar yoki metall ionlariga ehtiyoj sezmasdan". Qo'llash. Mikrobiol. Biotexnol. 60 (3): 243–57. doi:10.1007 / s00253-002-1123-4. PMID  12436305.
  23. ^ a b Kendrew SG, Katayama K, Deutsch E, Madduri K, Xutchinson CR (1999). "Doksorubitsin biosintezida ishtirok etgan DnrD siklaza: rekombinant fermentni tozalash va tavsiflash". Biokimyo. 38 (15): 4794–9. doi:10.1021 / bi9827924. PMID  10200167.
  24. ^ Niemi J, Vang Y, Airas K, Ylihonko K, Hakala J, Mäntsälä P (1999). "Stlavtomyces purpurascens dan aklavinone-11-gidroksilaza xarakteristikasi". Biokimyo. Biofiz. Acta. 1430 (1): 57–64. doi:10.1016 / S0167-4838 (98) 00265-9. PMID  10082933.
  25. ^ Otten SL, Liu X, Fergyuson J, Xatchinson CR (1995). "Daunosamin biosintezi fermenti va daunorubitsin biosintezida ishtirok etadigan glikozil transferazni kodlovchi Streptomyces peucetius dnrQS genlarini klonlash va tavsifi". J. Bakteriol. 177 (22): 6688–92. PMC  177529. PMID  7592454.
  26. ^ Jansson A, Niemi J, Mäntsälä P, Shnayder G (2003). "Aklacinomitsin metilesterazning bog'langan mahsulot analoglari bilan kristalli tuzilishi: antrasiklinni tanib olish va mexanizmi uchun ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 278 (40): 39006–13. doi:10.1074 / jbc.M304008200. PMID  12878604.
  27. ^ Jansson A, Koskiniemi H, Mäntsälä P, Niemi J, Shnayder G (2004). "DnrK uchlamchi kompleksining kristalli tuzilishi, bog'langan mahsulotlar bilan daunorubitsin biosintezidagi metiltransferaza". J. Biol. Kimyoviy. 279 (39): 41149–56. doi:10.1074 / jbc.M407081200. PMID  15273252.