MED1 - MED1 - Wikipedia

MED1
PDB 1rjk EBI.jpg
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarMED1, CRSP1, CRSP200, DRIP205, DRIP230, PBP, PPARBP, PPARGBP, RB18A, TRAP220, TRIP2, mediator kompleks subunit 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 604311 MGI: 1100846 HomoloGene: 21002 Generkartalar: MED1
Gen joylashuvi (odam)
17-xromosoma (odam)
Chr.17-xromosoma (odam)[1]
17-xromosoma (odam)
MED1 uchun genomik joylashuv
MED1 uchun genomik joylashuv
Band17q12Boshlang39,404,285 bp[1]
Oxiri39,451,272 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE PPARBP 203496 s

PBB GE PPARBP 203497 da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004774

NM_001080118
NM_013634
NM_134027
NM_001361950
NM_001361951

RefSeq (oqsil)

NP_004765

NP_001073587
NP_038662
NP_598788
NP_001348879
NP_001348880

Joylashuv (UCSC)Chr 17: 39.4 - 39.45 MbChr 11: 98.15 - 98.19 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

RNK polimeraza II transkripsiyasi subbirligi 1 vositachisi shuningdek, nomi bilan tanilgan DRIP205 yoki Tuzoq 220 ning subunitidir Mediatorlar majmuasi va a oqsil odamlarda kodlanganligi MED1 gen.[5][6][7] MED1 funksiyasi a yadro retseptorlari koaktivator.

Med1
Identifikatorlar
BelgilarMed1
PfamPF10744
InterProIPR019680

Funktsiya

Gen transkripsiyasini faollashtirish bu ko'p bosqichli jarayon bo'lib, transkripsiyani kuchaytiruvchi joylarni tan oladigan omillar tomonidan qo'zg'atiladi. DNK. Ushbu omillar ko-aktivatorlar bilan transkripsiyani boshlashni yo'naltirish uchun ishlaydi RNK polimeraza II apparati. RNK polimeraza II transkripsiyasi subunit 1 oqsilining mediatori CRSP (kofaktor SP1 faollashtirish) kompleksi, u bilan birga TFIID, SP1 tomonidan faol faollashtirish uchun talab qilinadi. Ushbu oqsil, shuningdek, boshqa multisubunitli komplekslarning tarkibiy qismidir [masalan, tiroid gormoni retseptorlari - (TR-) TR bilan o'zaro ta'sir qiluvchi va DNK shablonlarida TR funktsiyasini boshlovchi omillar va kofaktorlar bilan birgalikda engillashtiradigan bog'liq proteinlar]. Shuningdek, u tartibga soladi p53 - mustaqil apoptoz va bu juda muhimdir adipogenez. Ushbu protein o'z-o'zidan oligomerizatsiya qobiliyatiga ega ekanligi ma'lum.[7]

O'zaro aloqalar

MED1 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Proteinlar oilasi

Ushbu yozuv Mediator kompleksining Med1 kichik birligini anglatadi. Med1 Srb / Med kompleksining Med9 submodulining bir qismini tashkil qiladi. Bu uchun zarur bo'lgan uchta kichik birlikdan biri hayotiylik umuman organizm atrof-muhitga yo'naltirilgan hujayra taqdiri qarorlaridagi roli orqali.[23]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000125686 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000018160 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Rao MS, Reddy JK (noyabr 1997). "Peroksisom proliferatori bilan faollashtirilgan retseptorlari bilan o'zaro aloqada bo'lgan PBP, oqsilni ajratish va tavsifi". J Biol Chem. 272 (41): 25500–6. doi:10.1074 / jbc.272.41.25500. PMID  9325263.
  6. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Le Beau MM, Espinosa R, Atkins GB, Lazar MA, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (oktyabr 1999). "Ko'krak bezi saratonida peroksizom proliferatori bilan faollashtirilgan retseptorlarni bog'laydigan oqsil (PBP / PPARBP) genini kuchaytirish va ortiqcha ekspressioni". Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (19): 10848–53. doi:10.1073 / pnas.96.19.10848. PMC  17971. PMID  10485914.
  7. ^ a b "Entrez Gen: PPARBP PPAR bog'lovchi oqsil".
  8. ^ Vang Q, Sharma D, Ren Y, Fondell JD (2002 yil noyabr). "Androgen retseptorlari vositasida gen ekspressionida TRAP-mediator kompleksining asosiy regulyatsion roli". J. Biol. Kimyoviy. 277 (45): 42852–8. doi:10.1074 / jbc.M206061200. PMID  12218053.
  9. ^ Vada O, Oishi H, Takada I, Yanagisava J, Yano T, Kato S (2004 yil avgust). "BRCA1 funktsiyasi TRAP220 bilan bevosita ta'sir o'tkazish orqali TRAP / DRIP kompleksiga vositachilik qiladi". Onkogen. 23 (35): 6000–5. doi:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID  15208681.
  10. ^ a b Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu V, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (mart 1999). "TRAP va SMCC komplekslari orasidagi o'zaro bog'liqlik yadroviy retseptorlari va turli xil sutemizuvchilarning faollashtiruvchilari uchun yangi yo'llarni ko'rsatadi". Mol. Hujayra. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
  11. ^ a b Kitagava H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagava T, Ito T, Ishimi Y, Nagasava H, Matsumoto T, Yanagisava J, Kato S (Iyun 2003). "Xromatinni qayta qurish kompleksi WINAC yadro retseptorlarini promouterlarga qaratadi va Uilyams sindromida buziladi". Hujayra. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
  12. ^ a b Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (2002 yil mart). "TRAP / Mediator koaktivatori kompleksi TRAP220 kichik birligi orqali alfa va beta estrogen retseptorlari bilan bevosita ta'sir o'tkazadi va in vitro estrogen retseptorlari funktsiyasini bevosita oshiradi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (5): 2642–7. doi:10.1073 / pnas.261715899. PMC  122401. PMID  11867769.
  13. ^ Zilliacus J, Xolter E, Vakui H, Tazava H, Treuter E, Gustafsson JA (2001 yil aprel). "RIP140 korepressorining 14-3-3 ga bog'liq hujayra ichidagi qayta joylashishini o'zgartirish orqali glyukokortikoid retseptorlari faoliyatini tartibga solish". Mol. Endokrinol. 15 (4): 501–11. doi:10.1210 / mend.15.4.0624. PMID  11266503.
  14. ^ Hittelman AB, Burakov D, Iñiguez-Lluhí JA, Freedman LP, Garabedian MJ (oktyabr 1999). "AF-1 bilan bog'liq oqsillar orqali glyukokortikoid retseptorlari transkripsiyasini faollashtirishning differentsial regulyatsiyasi". EMBO J. 18 (19): 5380–8. doi:10.1093 / emboj / 18.19.5380. PMC  1171607. PMID  10508170.
  15. ^ Maeda Y, Rachez C, Hawel L, Byus CV, Freedman LP, Sladek FM (iyul 2002). "Poliaminlar yadro retseptorlari va D vitamini retseptorlari bilan ta'sir qiluvchi oqsil 205 o'rtasidagi o'zaro ta'sirni modulyatsiya qiladi". Mol. Endokrinol. 16 (7): 1502–10. doi:10.1210 / mend.16.7.0883. PMID  12089346.
  16. ^ Malik S, Wallberg AE, Kang YK, Roeder RG (2002 yil avgust). "TRAP / SMCC / mediatorga bog'liq bo'lgan etim yadro retseptorlari gepatotsitlari yadro omil 4 tomonidan DNK va xromatin shablonlaridan transkripsiya faollashuvi". Mol. Hujayra. Biol. 22 (15): 5626–37. doi:10.1128 / mcb.22.15.5626-5637.2002. PMC  133960. PMID  12101254.
  17. ^ Frade R, Balbo M, Barel M (dekabr 2000). "Gb 17q12-q21.1 xromosomasida lokalize qilingan RB18A in vivo p53 transaktivatsiya faoliyatini tartibga soladi". Saraton kasalligi. 60 (23): 6585–9. PMID  11118038.
  18. ^ Drané P, Barel M, Balbo M, Frade R (1997 yil dekabr). "Antigenik va funktsional xususiyatlarini p53 bilan bo'lishadigan 205 kDa yangi p53 regulyator oqsili RB18A ni aniqlash". Onkogen. 15 (25): 3013–24. doi:10.1038 / sj.onc.1201492. PMID  9444950.
  19. ^ Wallberg AE, Yamamura S, Malik S, Spiegelman BM, Roeder RG (2003 yil noyabr). "P300 vositachiligidagi kromatinni qayta tuzish va TRAP / mediator funktsiyasini koaktivator PGC-1alpha orqali muvofiqlashtirish". Mol. Hujayra. 12 (5): 1137–49. doi:10.1016 / s1097-2765 (03) 00391-5. PMID  14636573.
  20. ^ Kodera Y, Takeyama K, Murayama A, Suzava M, Masuhiro Y, Kato S (oktyabr 2000). "Peroksizom proliferatori bilan faollashtirilgan retseptorlari gammasining transkripsiya koaktivatorlari bilan ligand turiga xos o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 275 (43): 33201–4. doi:10.1074 / jbc.C000517200. PMID  10944516.
  21. ^ Misra P, Qi C, Yu S, Shoh SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (may 2002). "PIMTning transkripsiyaviy koaktivatorlar bilan o'zaro ta'siri CBP, p300 va PBP transkripsiyani boshqarishda differentsial roli". J. Biol. Kimyoviy. 277 (22): 20011–9. doi:10.1074 / jbc.M201739200. PMID  11912212.
  22. ^ Yuan CX, Ito M, Fondell JD, Fu ZY, Roeder RG (iyul 1998). "Qalqonsimon gormon retseptorlari bilan bog'liq bo'lgan oqsil (TRAP) koaktivatori kompleksining TRAP220 komponenti ligandga bog'liq ravishda yadro retseptorlari bilan bevosita ta'sir o'tkazadi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 95 (14): 7939–44. doi:10.1073 / pnas.95.14.7939. PMC  20908. PMID  9653119.
  23. ^ Boube M, Joulia L, Cribbs DL, Bourbon HM (iyul 2002). "Xamirturushdan odamga saqlanib qolgan RNK polimeraza II transkripsiya regulyatsiyasi vositachisi uchun dalillar". Hujayra. 110 (2): 143–51. doi:10.1016 / s0092-8674 (02) 00830-9. PMID  12150923. S2CID  771362.

Qo'shimcha o'qish

Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR019680