TRIM24 - TRIM24

TRIM24
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2YYN, 3O33, 3O34, 3O35, 3O36, 3O37, 4YAB, 4YAD, 4YAT, 4YAX, 4YBM, 4YBS, 4YBT, 4YC9, 4ZQL
Identifikatorlar
Taxalluslar	TRIM24, PTC6, RNF82, TF1A, TIF1, TIF1A, TIF1ALPHA, hTIF1, 24 tarkibidagi uch tomonlama motif
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 603406 MGI: 109275 HomoloGene: 20830 Generkartalar: TRIM24
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 7 (odam)
Oxiri	138,589,996 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 6 (sichqoncha)
Oxiri	37,966,296 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• protein kinaz faolligi; • ketma-ketlikka xos DNK bilan bog'lanish; • DNK bilan bog'lanish; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 ubiquitin protein ligaza faolligi; • GO: 0001105 transkripsiya koaktivatori faoliyati; • rux ioni bilan bog'lash; • p53 majburiy; • xromatin bilan bog'lanish; • metall ionlari bilan bog'lanish; • ubikuitin-protein transferaza faolligi; • metil qilingan gistonni bog'lash; • estrogenga javob beradigan elementni bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • ligandga bog'liq bo'lgan yadro retseptorlari bilan bog'lanish; • lizin-atsetillangan gistonni bog'lash; • retseptorlarni bog'lash; • oqsil tirozin kinaz faolligi; • transferaza faoliyati;
Uyali komponent	• sitoplazma; • yadroviy evromatin; • sitozol; • hujayra ichidagi; • perikromatin fibrillalari; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma;
Biologik jarayon	• apoptotik jarayonni tartibga solish; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • protein barqarorligini tartibga solish; • kaltsiy ionining gomeostazasi; • p53 sinf mediatori tomonidan signal uzatilishini tartibga solish; • D vitamini retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiya; • transkripsiya, DNK-andozali; • estrogen stimuliga uyali javob; • transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • oqsil fosforillanishi; • gen ekspressionining ijobiy regulyatsiyasi; • oqsil katabolik jarayoni; • oqsilning hamma joyda tarqalishi; • avtofosforillanish; • transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • hujayralar ko'payishini salbiy tartibga solish; • peptidil-tirozin fosforillanish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	8805
	21848
	ENSG00000122779
	ENSMUSG00000029833
	O15164
	Q64127
	NM_003852; NM_015905
	NM_001272064; NM_001272076; NM_145076
	NP_003843; NP_056989
	NP_001258993; NP_001259005; NP_659542
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Uch tomonlama motifni o'z ichiga olgan 24 (TRIM24) shuningdek, nomi bilan tanilgan transkripsiya vositachisi omil 1a (TIF1a) a oqsil odamlarda bu kodlangan TRIM24 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil bir nechta yadro retseptorlari faollashuvi funktsiyasi 2 (AF2) mintaqasi bilan o'zaro aloqada transkripsiyani boshqarishda vositachilik qiladi, shu jumladan estrogen, retinoik kislota va D vitamini₃ retseptorlari. Oqsil yadro jismlariga joylashadi va xromatin va heteroxromatin bilan bog'liq omillar bilan bog'langan deb o'ylashadi. Oqsil uch tomonlama motif (TRIM) oilasi. TRIM motifida rux bilan bog'laydigan uchta domen - RING, 1-turdagi B-quti va 2-turdagi B-quti - va o'ralgan lasan mintaqa. Ikki muqobil ravishda qo'shilgan Ushbu gen uchun turli xil izoformlarni kodlovchi transkript variantlari tavsiflangan.^[5]

O'zaro aloqalar

TRIM24 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan Mineralokortikoid retseptorlari,^[6]^[8] TRIM33,^[9] Estrogen retseptorlari alfa^[6]^[10] va Retinoid X retseptorlari alfa.^[6]^[11]

Shuningdek qarang

Transkripsiya yadrosi

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000122779 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029833 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b "Entrez Gen: TRIM24 uch tomonlama motifli 24".
^ ^a ^b ^v ^d Thénot S, Henriquet C, Rochefort H, Cavaillès V (may 1997). "Yadro retseptorlarining insonning taxminiy transkripsiyaviy koaktivatori hTIF1 bilan differentsial o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 272 (18): 12062–8. doi:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID 9115274.
^ Le Douarin B, Nilsen AL, You J, Chambon P, Losson R (may 1997). "TIF1 alfa: yadro retseptorlarining AF-2 ligandga bog'liq aktivatsiya funktsiyasi uchun kromatinga xos vositachi?". Biokimyo. Soc. Trans. 25 (2): 605–12. doi:10.1042 / bst0250605. PMID 9191165.
^ Zennaro, M C; Souque A; Viengchareun S; Poisson E; Lombes M (sentyabr 2001). "MR-splice-ning yangi varianti - bu kandikosteroid ta'sirini modulyatsiya qiluvchi ligandga bog'liq bo'lmagan transaktivator". Mol. Endokrinol. Qo'shma Shtatlar. 15 (9): 1586–98. doi:10.1210 / mend.15.9.0689. ISSN 0888-8809. PMID 11518808.
^ Peng, Xongchuang; Feldman Irina; Rauscher Frank J (2002 yil iyul). "RBCC / TRIM domeniga ega bo'lgan yadroviy kofaktorlarning TIF oilasi orasida getero-oligomerizatsiya: koaktivatsiya va korepressiya o'rtasida o'tishni tartibga soluvchi potentsial mexanizm". J. Mol. Biol. Angliya. 320 (3): 629–44. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00477-1. ISSN 0022-2836. PMID 12096914.
^ Thénot, S; Bonnet S; Boulahtouf A; Margeat E; Royer C A; Borgna J L; Cavaillès V (1999 yil dekabr). "Ligand va DNK bilan bog'lanishning inson transkripsiyasi vositachisi omil 1alfa va estrogen retseptorlari o'rtasidagi o'zaro ta'siriga ta'siri". Mol. Endokrinol. Qo'shma Shtatlar. 13 (12): 2137–50. doi:10.1210 / me.13.12.2137. ISSN 0888-8809. PMID 10598587.
^ Li, Ven-Yi; Noy Noa (2002 yil fevral). "RXR ning koaktivatorlar bilan o'zaro ta'siri retseptorlarning ligand bilan bog'lanish sohasining spirali 11 tomonidan differentsial ravishda amalga oshiriladi". Biokimyo. Qo'shma Shtatlar. 41 (8): 2500–8. doi:10.1021 / bi011764 +. ISSN 0006-2960. PMID 11851396.

Qo'shimcha o'qish

Le Douarin B, Nilsen AL, You J va boshq. (1997). "TIF1 alfa: yadro retseptorlarining AF-2 ligandga bog'liq aktivatsiya funktsiyasi uchun kromatinga xos vositachi?". Biokimyo. Soc. Trans. 25 (2): 605–12. doi:10.1042 / bst0250605. PMID 9191165.
Moosmann P, Georgiev O, Le Douarin B va boshq. (1997). "KOX1 ning KRAB repressor domeni bilan o'zaro aloqada bo'lgan RING barmoq oqsili TIF1 beta bilan transkripsiyaviy repressiya". Nuklein kislotalari rez. 24 (24): 4859–67. doi:10.1093 / nar / 24.24.4859. PMC 146346. PMID 9016654.
Thénot S, Henriquet C, Rochefort H, Cavaillès V (1997). "Yadro retseptorlarining insonning taxminiy transkripsiyaviy koaktivatori hTIF1 bilan differentsial o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 272 (18): 12062–8. doi:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID 9115274.
Freyzer RA, Heard DJ, Adam S va boshq. (1998). "TIF1alfa taxminiy kofaktori ligandlangan yadro retseptorlari bilan o'zaro ta'sirlashganda giperfosforillangan oqsil kinazidir". J. Biol. Kimyoviy. 273 (26): 16199–204. doi:10.1074 / jbc.273.26.16199. PMID 9632676.
Eng FC, Barsalou A, Akutsu N va boshqalar. (1998). "Koaktivatorlarning turli sinflari estrogen retseptorlari ligandining bog'lanish sohasidagi aniq, lekin bir-biriga bog'langan joylarni taniydi". J. Biol. Kimyoviy. 273 (43): 28371–7. doi:10.1074 / jbc.273.43.28371. PMID 9774463.
Venturini L, You J, Stadler M va boshq. (1999). "TIF1gamma, transkripsiya vositachisi omil 1 oilasining yangi a'zosi". Onkogen. 18 (5): 1209–17. doi:10.1038 / sj.onc.1202655. PMID 10022127.
Remboutsika E, Lutz Y, Gansmuller A va boshq. (1999). "TIF1alfa yadroviy retseptorlari mediatori evromatin bilan chambarchas bog'liq". J. Cell Sci. 112 (11): 1671–83. PMID 10318760.
Klugbauer S, Rabes HM (1999). "Transkripsiya koaktivatori HTIF1 va unga aloqador oqsil RET retseptorlari tirozin kinazasi bilan bolalik davridagi papiller tiroid karsinomalarida birlashtirilgan". Onkogen. 18 (30): 4388–93. doi:10.1038 / sj.onc.1202824. PMID 10439047. S2CID 2166439.
Nilsen AL, Ortiz JA, Siz J va boshq. (2000). "Heteroxromatin oqsili 1 (HP1) oilasi a'zolari bilan o'zaro ta'sirlashish va giston deatsetilatsiya TIF1 oilasi a'zolari tomonidan transkripsiyaviy sustlashda turlicha ishtirok etadi". EMBO J. 18 (22): 6385–95. doi:10.1093 / emboj / 18.22.6385. PMC 1171701. PMID 10562550.
Thénot S, Bonnet S, Boulahtouf A va boshq. (2000). "Ligand va DNK bilan bog'lanishning inson transkripsiyasi vositachisi omil 1alfa va estrogen retseptorlari o'rtasidagi o'zaro ta'siriga ta'siri". Mol. Endokrinol. 13 (12): 2137–50. doi:10.1210 / me.13.12.2137. PMID 10598587.
Zhong S, Delva L, Rachez C va boshq. (1999). "RAga bog'liq bo'lgan, o'smaning o'sishini bostiruvchi transkripsiya kompleksi PML-RARalpha va T18 onkoproteinlarining maqsadi hisoblanadi". Nat. Genet. 23 (3): 287–95. doi:10.1038/15463. PMID 10610177. S2CID 23613492.
Hellal-Levy C, Fagart J, Souque A va boshq. (2001). "H11-H12 tsiklining inson mineralokortikoid retseptorlari faol konformatsiyasini barqarorlashtirishda hal qiluvchi ahamiyati". Mol. Endokrinol. 14 (8): 1210–21. doi:10.1210 / mend.14.8.0502. PMID 10935545.
Seeler JS, Marchio A, Losson R va boshq. (2001). "Yadro tanasi oqsillari SP100 va TIF1a xromatin omillarining umumiy xususiyatlari: SUMO modifikatsiyasining roli". Mol. Hujayra. Biol. 21 (10): 3314–24. doi:10.1128 / MCB.21.10.3314-3324.2001. PMC 100253. PMID 11313457.
Reymond A, Meroni G, Fantozzi A va boshqalar. (2001). "Uch tomonlama motifli oila hujayra bo'linmalarini aniqlaydi". EMBO J. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
Zennaro MC, Souque A, Viengchareun S va boshq. (2002). "MR-splice-ning yangi varianti - bu kandikosteroid ta'sirini modulyatsiya qiluvchi ligandga bog'liq bo'lmagan transaktivator". Mol. Endokrinol. 15 (9): 1586–98. doi:10.1210 / mend.15.9.0689. PMID 11518808.
Li VY, Noy N (2002). "RXR ning koaktivatorlar bilan o'zaro ta'siri retseptorlarning ligand bilan bog'lanish sohasining spirali 11 tomonidan differentsial ravishda amalga oshiriladi". Biokimyo. 41 (8): 2500–8. doi:10.1021 / bi011764 +. PMID 11851396.
Gandini D, De Angeli C, Aguiari G va boshq. (2002). "O'tkir miyeloid leykemiya va MDS bilan bog'liq AMLda transkripsiya koaktivatori HTIF1alpha genining imtiyozli ifodasi". Leykemiya. 16 (5): 886–93. doi:10.1038 / sj.leu.2402452. PMID 11986951.
Peng H, Feldman I, Rauscher FJ (2002). "RBCC / TRIM domeniga ega bo'lgan yadroviy kofaktorlarning TIF oilasi orasida getero-oligomerizatsiya: koaktivatsiya va korepressiya o'rtasida o'tishni tartibga soluvchi potentsial mexanizm". J. Mol. Biol. 320 (3): 629–44. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00477-1. PMID 12096914.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tashqi havolalar

TRIM24 oqsili, inson AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasida Tibbiy mavzu sarlavhalari (MeSH)
NURSA C150

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000122779 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029833 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: TRIM24 uch tomonlama motifli 24".

[pmid9115274-6] v ^d Thénot S, Henriquet C, Rochefort H, Cavaillès V (may 1997). "Yadro retseptorlarining insonning taxminiy transkripsiyaviy koaktivatori hTIF1 bilan differentsial o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 272 (18): 12062–8. doi:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID 9115274.

[pmid9191165-7] Le Douarin B, Nilsen AL, You J, Chambon P, Losson R (may 1997). "TIF1 alfa: yadro retseptorlarining AF-2 ligandga bog'liq aktivatsiya funktsiyasi uchun kromatinga xos vositachi?". Biokimyo. Soc. Trans. 25 (2): 605–12. doi:10.1042 / bst0250605. PMID 9191165.

[pmid11518808-8] Zennaro, M C; Souque A; Viengchareun S; Poisson E; Lombes M (sentyabr 2001). "MR-splice-ning yangi varianti - bu kandikosteroid ta'sirini modulyatsiya qiluvchi ligandga bog'liq bo'lmagan transaktivator". Mol. Endokrinol. Qo'shma Shtatlar. 15 (9): 1586–98. doi:10.1210 / mend.15.9.0689. ISSN 0888-8809. PMID 11518808.

[pmid12096914-9] Peng, Xongchuang; Feldman Irina; Rauscher Frank J (2002 yil iyul). "RBCC / TRIM domeniga ega bo'lgan yadroviy kofaktorlarning TIF oilasi orasida getero-oligomerizatsiya: koaktivatsiya va korepressiya o'rtasida o'tishni tartibga soluvchi potentsial mexanizm". J. Mol. Biol. Angliya. 320 (3): 629–44. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00477-1. ISSN 0022-2836. PMID 12096914.

[pmid10598587-10] Thénot, S; Bonnet S; Boulahtouf A; Margeat E; Royer C A; Borgna J L; Cavaillès V (1999 yil dekabr). "Ligand va DNK bilan bog'lanishning inson transkripsiyasi vositachisi omil 1alfa va estrogen retseptorlari o'rtasidagi o'zaro ta'siriga ta'siri". Mol. Endokrinol. Qo'shma Shtatlar. 13 (12): 2137–50. doi:10.1210 / me.13.12.2137. ISSN 0888-8809. PMID 10598587.

[pmid11851396-11] Li, Ven-Yi; Noy Noa (2002 yil fevral). "RXR ning koaktivatorlar bilan o'zaro ta'siri retseptorlarning ligand bilan bog'lanish sohasining spirali 11 tomonidan differentsial ravishda amalga oshiriladi". Biokimyo. Qo'shma Shtatlar. 41 (8): 2500–8. doi:10.1021 / bi011764 +. ISSN 0006-2960. PMID 11851396.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Transkripsiya asosiy regulyatorlari
Koaktivatorlar	ARA (54, 55, 70 ) BCAS3 CARM1 p300-CBP (EP300, CREBBP ) CRTC (1, 2, 3 ) DRIP / TRAP (MED1 Drip205 / Trap220) MN1 PCAF PNRC (1, 2 ) PPARGC (1A, 1B ) TGFB1I1 NCOA1 (SRC-1) NCOA2 (GRIP1 / SRC-2 / TIF2) NCOA3 (AIB / SRC-3 / TRAM-1) NCOA4 (ARA70) NCOA5 (Markaziy razvedka boshqarmasi) NCOA6 (RAP250) NCOA7 (ERAP140)
Korepressorlar	CTBP (1, 2 ) Sochsiz gomolog LCOR NRIP1 (RIP140) PELP-1 RCOR1 Rb SIN3A SIN3B Uch tomonlama motifli oila TRIM (24, 28, 33 ) NCOR1 NCOR2 (SMRT)
ATPga bog'liq qayta qurish omillari	Xromatin strukturasini qayta qurish (RSC) kompleksi SWI / SNF