PSMC3 - PSMC3 - Wikipedia

PSMC3
Identifikatorlar
TaxalluslarPSMC3, TBP1, proteazom 26S kichik birligi, ATPase 3
Tashqi identifikatorlarOMIM: 186852 MGI: 1098754 HomoloGene: 2097 Generkartalar: PSMC3
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 11 (odam)
Chr.Xromosoma 11 (odam)[1]
Xromosoma 11 (odam)
Genomic location for PSMC3
Genomic location for PSMC3
Band11p11.2Boshlang47,418,769 bp[1]
Oxiri47,426,473 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE PSMC3 201267 s at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

5702

19182

Ansambl

ENSG00000165916

ENSMUSG00000002102

UniProt

P17980

O88685

RefSeq (mRNA)

NM_002804

NM_008948

RefSeq (oqsil)

NP_002795

NP_032974

Joylashuv (UCSC)Chr 11: 47.42 - 47.43 MbChr 2: 91.05 - 91.07 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

26S proteaz regulyativ kichik birligi 6A, shuningdek, nomi bilan tanilgan 26S proteazom AAA-ATPase kichik birligi Rpt5, bu ferment odamlarda kodlanganligi PSMC3 gen.[5][6] Ushbu oqsil to'liq yig'ilgan 19S proteazom majmuasining 19 muhim bo'linmasidan biridir[7] Oltita 26S proteazomli AAA-ATPase subbirliklari (Rpt1, Rpt2, Rpt3, Rpt4, Rpt5 (bu oqsil) va Rpt6 ) ATPase bo'lmagan to'rtta kichik birlik bilan birga (Rpn1, Rpn2, Rpn10 va Rpn13 uchun 19S tartibga soluvchi zarrachaning asosiy pastki kompleksini hosil qiladi proteazom murakkab.[7]

Gen

Gen PSMC3 ATPaza subbirliklaridan birini, uch kishilik ATPazlar oilasining a'zosi, u shaperonga o'xshash faoliyatga ega. Virusli oqsil va transkripsiya kompleksi o'rtasidagi o'zaro ta'sirni tartibga solish uchun ushbu kichik birlik PSMC2 bilan OIV tat proteiniga bog'lanish uchun raqobatlashishi mumkin. Psevdogen 9-xromosomada aniqlangan.[8] Inson PSMC3 gen 12 eksonga ega va 11p11.2 xromosoma tasmasida joylashgan.

Oqsil

Odam oqsili 26S proteazni tartibga soluvchi kichik birligi 6A 49kDa ga teng va 439 aminokislotadan iborat. Ushbu oqsilning hisoblangan nazariy pI 5,68 ga teng.[9]

Kompleks yig'ish

26S proteazom kompleks odatda 20S yadro zarrachasidan (CP yoki 20S proteazom) va barrel shaklidagi 20S ning ikkala tomonida yoki ikkala tomonida bir yoki ikkita 19S tartibga soluvchi zarralardan (RP, yoki 19S proteazom) iborat. CP va RPlar aniq tarkibiy xususiyatlarga va biologik funktsiyalarga tegishli. Qisqacha aytganda, 20S kichik kompleksi uchta turdagi proteolitik faoliyatni, shu jumladan kaspaza o'xshash, tripsin va ximotripsin kabi faoliyatlarni namoyish etadi. Ushbu proteolitik faol joylar kameraning ichki tomonida joylashgan bo'lib, ular 20S subbirliklarning 4 ta to'plangan halqalari tomonidan hosil bo'lib, tasodifiy oqsil-fermentlar uchrashi va oqsilning nazoratsiz parchalanishini oldini oladi. 19S tartibga soluvchi zarralar ubikitin bilan belgilangan oqsilni degradatsiya substrati sifatida taniy oladi, oqsilni chiziqli qilib yoyadi, 20S yadro zarrachasining eshigini ochadi va substratni proteolitik kameraga yo'naltiradi. Bunday funktsional murakkablikni qondirish uchun 19S tartibga soluvchi zarrada kamida 18 ta tarkibiy bo'linma mavjud. Ushbu kichik birliklarni ATP-ga, ATP-ga bog'liq bo'lgan va ATP-ga bog'liq bo'lmagan birliklarning ATP-ga bog'liqligiga qarab ikkita sinfga ajratish mumkin. Ushbu ko'p qismli kompleksning oqsillarning o'zaro ta'siri va topologik xususiyatlariga ko'ra, 19S regulyativ zarrachasi asos va qopqoq subkompleksidan iborat. Baza oltita AAA ATPase (Subunit Rpt1-6, sistematik nomenklatura) va to'rtta ATPase bo'lmagan bo'linmalar (Rpn1, Rpn2, Rpn10 va Rpn13 ). Shunday qilib, 26S proteaz regulyativ kichik birligi 4 (Rpt2) 19S tartibga soluvchi zarrachaning asosiy subkompleksini shakllantirishning muhim tarkibiy qismidir. 19S tayanch majmuasini yig'ish uchun to'rtta asosiy o'rnatish chaperon to'plamlari (Hsm3 / S5b, Nas2 / P27, Nas6 / P28 va Rpn14 / PAAF1, xamirturush / sutemizuvchilar nomenklaturasi) to'rt guruh tomonidan mustaqil ravishda aniqlandi.[10][11][12][13][14][15] Ushbu 19S tartibga soluvchi zarrachalar bazasiga bag'ishlangan chaperonlarning barchasi C-terminal mintaqalari orqali individual ATPase subbirliklariga bog'lanadi. Masalan, Hsm3 / S5b subunit bilan bog'lanadi Rpt1 va Rpt2 (bu oqsil), Nas2 / p27 - Rpt5 (bu oqsil), Nas6 / p28 - Rpt3 va Rpn14 / PAAAF1 ga Rpt6 navbati bilan. Keyinchalik Nas6 / p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14 / PAAF1 moduli, Nas2 / p27-Rpt4-Rpt5 moduli va Hsm3 / S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2 moduli kabi uchta oraliq yig'ish moduli hosil bo'ladi. Oxir-oqibat, ushbu uchta modul Rpn1 bilan 6 ta atlasning heterogeksamerik halqasini hosil qilish uchun birlashadilar. Ning yakuniy qo'shilishi Rpn13 19S bazaviy sub-kompleks yig'ilishining yakunlanganligini ko'rsatadi.[7]

Funktsiya

~ 70% hujayra ichidagi proteoliz uchun javobgar bo'lgan degradatsiya mexanizmi sifatida,[16] proteazom kompleksi (26S proteazom) uyali proteomning gomeostazini saqlashda juda muhim rol o'ynaydi. Shunga ko'ra, yangi sintez uchun aminokislotalarni qayta ishlash uchun noto'g'ri katlanmış oqsillarni va buzilgan oqsillarni doimiy ravishda olib tashlash kerak; parallel ravishda, ba'zi bir muhim tartibga soluvchi oqsillar o'zlarining biologik funktsiyalarini tanlab tanazzulga uchragan holda bajaradilar; Bundan tashqari, oqsillar MHC I sinf antigenining namoyishi uchun peptidlarda hazm qilinadi. Biologik jarayonda yuzaga keladigan bunday murakkab talablarni fazoviy va vaqtincha proteoliz orqali qondirish uchun oqsil substratlarini tanib olish, jalb qilish va oxir-oqibat yaxshi boshqariladigan usulda gidroliz qilish kerak. Shunday qilib, 19S tartibga soluvchi zarrachasi ushbu funktsional muammolarni hal qilish uchun bir qator muhim imkoniyatlarga ega. Belgilangan substrat sifatida oqsilni tanib olish uchun 19S majmuasida oqsillarni tanib olishga qodir subbunitlar mavjud bo'lib, ular hamma joyda buzilib ketadigan yorliq, ya'ni hamma joyda joylashgan. Shuningdek, uning tarkibida 19S va 20S zarralari orasidagi bog'lanishni osonlashtirish, shuningdek 20S kompleksining substrat kirishini tashkil etuvchi alfa subunit C-terminallarining tasdiqlanish o'zgarishini ta'minlash uchun nukleotidlar (masalan, ATP) bilan bog'lanishi mumkin bo'lgan kichik birliklar mavjud.

ATPases pastki bo'linmalari oltita a'zodan iborat bo'lib, Rpt1-Rpt5-Rpt4-Rpt3-Rpt3-Rpt6-Rpt2 ketma-ketligi bilan ajralib turadi, bu 20S yadro zarrachasining ettita a'zoli alfa halqasi bilan o'zaro ta'sir qiladi va sharqda 19S RP va uning orasidagi assimetrik interfeysni o'rnatadi. 20S CP.[17][18] Alohida Rpt ATPazalarning HbYX motifli uchta C-terminal quyruqlari CP ning aniqlangan ikkita alfa kichik birligi orasidagi cho'ntaklarga kiritiladi va CP alfa halqasida markaziy kanallarning eshik ochilishini tartibga soladi.[19][20] Dalillar shuni ko'rsatdiki, ATPase pastki birligi Rpt5 va boshqa ubuikintinatsiyalangan 19S proteazom subbirliklari (Rpn13, Rpn10 ) va deubikitinatsiya qiluvchi Uch37 fermenti, joyida proteazom-assotsiatsiyalovchi ubikitinatsiya fermentlari bilan hamma joyda tarqalishi mumkin. Proteazom subbirliklarining joylashuvi hujayra hamma joyda joylashish darajasining o'zgarishiga javoban proteazomal faollikni tartibga solishi mumkin.[21]

O'zaro aloqalar

PSMC3 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan PSMC5[22] va Von Xippel-Lindau o'simtasini bostiruvchi.[23]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000165916 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000002102 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Hoyle J, Tan KH, Fisher EM (Mar 1997). "AAA oilasining ikkita bir domen a'zosini kodlovchi genlarni lokalizatsiyasi: PSMC5 (qalqonsimon gormon retseptorlari bilan o'zaro ta'sir qiluvchi protein, TRIP1) va PSMC3 (Tat bilan bog'lovchi protein, TBP1)". Hum Genet. 99 (2): 285–8. doi:10.1007 / s004390050356. PMID  9048938. S2CID  29818936.
  6. ^ Tanahashi N, Suzuki M, Fujiwara T, Takahashi E, Shimbara N, Chung CH, Tanaka K (Mar 1998). "Odamning 26S proteazomal ATPazalari oilasining xromosomal lokalizatsiyasi va immunologik tahlili". Biokimyo Biofiz Res Commun. 243 (1): 229–32. doi:10.1006 / bbrc.1997.7892. PMID  9473509.
  7. ^ a b v Gu ZC, Enenkel C (dekabr 2014). "Proteazomli yig'ilish". Uyali va molekulyar hayot haqidagi fanlar. 71 (24): 4729–45. doi:10.1007 / s00018-014-1699-8. PMID  25107634. S2CID  15661805.
  8. ^ "Entrez Gen: PSMC3 proteazom (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 3".
  9. ^ "Uniprot: P17980 - PRS6A_HUMAN".
  10. ^ Le Tallec B, Barrault MB, Guérois R, Carré T, Peyroche A (Fevral 2009). "Hsm3 / S5b proteazomaning 19S tartibga soluvchi zarrachasini yig'ish yo'lida ishtirok etadi". Molekulyar hujayra. 33 (3): 389–99. doi:10.1016 / j.molcel.2009.01.010. PMID  19217412.
  11. ^ Funakoshi M, Tomko RJ, Kobayashi H, Xoxstrasser M (may 2009). "Proteazomani tartibga soluvchi zarrachalar bazasining biogenezini bir nechta yig'ish chaperonlari boshqaradi". Hujayra. 137 (5): 887–99. doi:10.1016 / j.cell.2009.04.061. PMC  2718848. PMID  19446322.
  12. ^ Park S, Roelofs J, Kim V, Robert J, Shmidt M, Gygi SP, Finley D (iyun 2009). "Proteazomal ATPazalarning geksamerik birikmasi ularning C termini orqali shablonlangan". Tabiat. 459 (7248): 866–70. Bibcode:2009 yil natur.459..866P. doi:10.1038 / nature08065. PMC  2722381. PMID  19412160.
  13. ^ Roelofs J, Park S, Haas V, Tian G, McAllister FE, Huo Y, Li BH, Zhang F, Shi Y, Gygi SP, Finley D (iyun 2009). "Proteazomalarni tartibga soluvchi zarrachalar birikmasining shaperon vositachiligi yo'li". Tabiat. 459 (7248): 861–5. Bibcode:2009 yil natur.459..861R. doi:10.1038 / nature08063. PMC  2727592. PMID  19412159.
  14. ^ Saeki Y, Tox-E A, Kudo T, Kavamura H, Tanaka K (may 2009). "Ko'p proteazom bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillar xamirturush 19S tartibga soluvchi zarrachasini yig'ilishiga yordam beradi". Hujayra. 137 (5): 900–13. doi:10.1016 / j.cell.2009.05.005. PMID  19446323. S2CID  14151131.
  15. ^ Kaneko T, Hamazaki J, Iemura S, Sasaki K, Furuyama K, Natsume T, Tanaka K, Murata S (may 2009). "Sutemizuvchilarning proteazom bazasi subkompleksini yig'ish yo'li ko'plab o'ziga xos chaperonlar vositasida bo'ladi". Hujayra. 137 (5): 914–25. doi:10.1016 / j.cell.2009.05.008. PMID  19490896. S2CID  18551885.
  16. ^ Rok KL, Gramm C, Rothstein L, Klark K, Stayn R, Dik L, Xvan D, Goldberg AL (sentyabr 1994). "Proteazoma inhibitörleri ko'p hujayra oqsillarining parchalanishini va MHC I sinf molekulalarida taqdim etilgan peptidlarning hosil bo'lishini bloklaydi". Hujayra. 78 (5): 761–71. doi:10.1016 / s0092-8674 (94) 90462-6. PMID  8087844. S2CID  22262916.
  17. ^ Tian G, Park S, Li MJ, Xak B, McAllister F, Hill CP, Gygi SP, Finley D (noyabr 2011). "Proteazomaning regulyativ va yadro zarralari orasidagi assimetrik interfeys". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 18 (11): 1259–67. doi:10.1038 / nsmb.2147. PMC  3210322. PMID  22037170.
  18. ^ Lander GC, Estrin E, Matyskiela ME, Bashor S, Nogales E, Martin A (Fevral 2012). "Proteazom regulyatsion zarrachasining to'liq subunit arxitekturasi". Tabiat. 482 (7384): 186–91. Bibcode:2012 yil natur.482..186L. doi:10.1038 / tabiat 1077. PMC  3285539. PMID  22237024.
  19. ^ Gillette TG, Kumar B, Tompson D, Slaughter CA, DeMartino GN (noyabr 2008). "PA700 (19 S regulyatori) ning AAA subbirliklarining COOH terminlarining assimetrik yig'ilishida va 26 S proteazomaning faollashuvidagi differentsial rollari". Biologik kimyo jurnali. 283 (46): 31813–31822. doi:10.1074 / jbc.M805935200. PMC  2581596. PMID  18796432.
  20. ^ Smit DM, Chang SC, Park S, Finley D, Cheng Y, Goldberg AL (sentyabr 2007). "Proteazomal ATPazalarning karboksil terminalarini 20S proteazomaning alfa halqasiga ulab qo'yish substrat kirish eshigini ochadi". Molekulyar hujayra. 27 (5): 731–744. doi:10.1016 / j.molcel.2007.06.033. PMC  2083707. PMID  17803938.
  21. ^ Jacobson AD, MacFadden A, Wu Z, Peng J, Liu CW (iyun 2014). "26S proteazomasini in situ hamma joyda avtoregulyatsiya qilish". Hujayraning molekulyar biologiyasi. 25 (12): 1824–35. doi:10.1091 / mbc.E13-10-0585. PMC  4055262. PMID  24743594.
  22. ^ Ishizuka T, Satoh T, Monden T, Shibusava N, Xashida T, Yamada M, Mori M (Avgust 2001). "1-turdagi inson immunitet tanqisligi virusi Tat bilan bog'lovchi protein-1 TR ga xos transkripsiya koaktivatori". Mol. Endokrinol. 15 (8): 1329–43. doi:10.1210 / mend.15.8.0680. PMID  11463857.
  23. ^ Misr PG, McDonald ER, Herman JG, El-Deiry WS (noyabr 2003). "Tat bilan bog'laydigan protein-1, 26S proteazomining tarkibiy qismi, fon Hippel-Lindau oqsilining E3 ubikuitin ligaz funktsiyasiga hissa qo'shadi". Nat. Genet. 35 (3): 229–37. doi:10.1038 / ng1254. PMID  14556007. S2CID  22798700.

Qo'shimcha o'qish